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宋婀莉: 作品数：10 被引量：16H指数：3; 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院基础医学院基础医学研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>; 相关领域：生物学医药卫生更多>>

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通过筛选随机多肽文库研究ZO-1中PDZ1结构域的配体结合特点被引量：1: 2006年; 选择ZO-1的PDZ1结构域作为研究对象,以酵母双杂交为筛选系统,筛选随机多肽文库和与其它PDZ结构域的配体进行相互作用,阐明ZO-1PDZ1的配体结合特性.ZO-1PDZ1识别配体C末端保守的氨基酸序列通式可以表示为[S/T][F/Y/W][V/I/L/C]-COOH、[S/T][K/R]V-COOH、V[F/Y/W][L/C]-COOH、EYV-COOH.研究发现ZO-1PDZ1的配体同时具有3种传统PDZ结构域配体的特点,不同的是其结合配体-1位对芳香族氨基酸具有强烈的偏好性.并且某些PDZ结构域配体的-1位和-3位对结构域与配体相互作用的特异性和亲和力有重要的作用.随后通过生物信息学的方法在Swiss-Prot数据库找到与此识别规律相符合的天然人类蛋白质.根据蛋白质的功能和细胞定位等性质选择10个配体用酵母双杂交验证相互作用.证实的相互作用配体有4个.本研究希望用这样的研究策略建立一种有效的研究蛋白质相互作用的方法,通过在全蛋白质组规模上对含有结合配体保守氨基酸序列的蛋白质的查询,理论上可以找到现有数据库中所有可能与目的结构域结合的潜在配体蛋白,特别是那些筛选cDNA文库不容易获得的低丰度配体.; 田瑞李英娜宋婀莉高诗娟黄海明张玲马素参高友鹤; 关键词：蛋白质相互作用 PDZ结构域酵母双杂交

一种验证性筛选目的结构域结合配体的方法: 本发明公开了一种验证性筛选目的结构域结合配体的方法。该方法包括以下步骤：1)以目的结构域家族中结合特性有代表性的成员为诱饵蛋白筛选酵母双杂交文库；2)收集步骤1)筛选获得的结合配体克隆以及其它已知或可能的目的结构域结合配...; 高友鹤宋婀莉高诗娟田瑞马素参黄海明; 文献传递

PICK1:一个功能多样的药靶蛋白被引量：2: 2007年; 蛋白质是生命功能的执行者.生命体中某些关键蛋白的功能异常往往是导致疾病发生的根本原因.这些疾病相关蛋白极有可能成为药物靶点,为新药研发和疾病治疗提供重要线索.PICK1蛋白(protein interacting with Cαkinase1)结合能力广泛、功能多样以及在多种重要疾病(如:癌症、精神分裂症、疼痛、帕金森综合症等)的发生发展过程中发挥潜在的作用,使其成为一个可能的药靶蛋白.PICK1与绝大多数配体蛋白的相互作用是通过其PDZ结构域与配体C末端区域的结合介导的,使PICK1的PDZ结构域成为一个潜在的药物靶点.因此,可以利用生物小分子物质特异性地结合PICK1的PDZ结构域,干扰或阻断PICK1与配体蛋白的天然相互作用,最终达到治疗相关疾病的目的.; 宋婀莉高友鹤; 关键词：INTERACTING PDZ结构域药物靶点

验证性筛选PDZ结构域结合配体文库快速研究HtrA2/Omi PDZ结构域的结合特性被引量：2: 2007年; HtrA2/Omi是一种线粒体丝氨酸蛋白酶,在哺乳动物细胞中具有双重功能,即诱导细胞凋亡和参与维持线粒体活性的动态平衡.PDZ结构域是最重要的蛋白质相互作用结构域之一,参与多种生物学过程,如细胞信号转导、蛋白质降解、细胞骨架组织等.最近研究发现,HtrA2/Omi蛋白的PDZ结构域与配体的相互作用,可以调节HtrA2/Omi蛋白自身的水解酶活性.以HtrA2/Omi PDZ结构域为研究对象,用酵母双杂交系统验证性筛选PDZ结构域结合配体文库,快速研究该结构域的结合特性,并在人类全蛋白质组范围内预测并发现该结构域新的相互作用蛋白,最后分析这些新的相互作用所能够形成的最小相互作用网络来评估其可信度.研究结果揭示了HtrA2/Omi PDZ结构域新的结合特性,即:不仅能够结合已报道的II类PDZ配体而且还可以结合I类和III类PDZ配体,并且配体-3位氨基酸具有一定范围内的可变性.而且,发现了7个新的HtrA2/Omi PDZ结构域相互作用蛋白,为进一步阐明HtrA2/Omi蛋白的生物学功能提供了重要线索.同时证明了验证性筛选目的结构域结合配体文库,这一结构域结合特性研究新策略的实用性和高效性.; 马素参宋婀莉高诗娟田瑞高友鹤; 关键词：PDZ结构域蛋白质相互作用生物信息学

利用随机多肽文库研究ZO-1中PDZ3结构域的配体结合特点被引量：4: 2004年; 建立一种研究PDZ结构域配体结合特点的简单方法 .利用酵母双杂交技术从随机多肽文库中寻找所有可能与ZO 1中PDZ3结构域结合的C末端序列 ,从现有蛋白质数据库中检索所有具有该C末端蛋白 .利用液体培养物 β 半乳糖苷酶检测实验 ,比较文库中筛选的C末端序列和已知的PDZ3结构域结合配体———JAM的C末端 (SFLV)与PDZ3结构域结合的强弱 .共筛选到 3个阳性克隆 ,其C末端序列分别为 LGWV、 LVWV和 DEWV .前 2者属于第二类PDZ结构域 ,后者属于第三类 .蛋白质数据库检索结果表明 ,有多个蛋白质具有 LGWV、 LVWV末端 ,没有检索到任何具有 DEWV末端的蛋白质 .结合强度实验结果表明 ,它们与PDZ3结构域结合强度依次为 DEWV > LGWV > LVWV > SFLV ,说明筛选的 3个C末端除了反映ZO 1中PDZ3结构域可能的潜在结合配体外 ,也有可能成为JAM蛋白阻断性试剂甚至药物的重要组成部分之一 .利用随机多肽文库 ,可以尽可能寻找所有可能与PDZ结构域结合的C末端序列。; 郭佳岩宋婀莉黄海明马素参高友鹤; 关键词：ZO-1 蛋白质相互作用酵母双杂交

一种验证性筛选目的结构域结合配体的方法: 本发明公开了一种验证性筛选目的结构域结合配体的方法。该方法包括以下步骤：1)以目的结构域家族中结合特性有代表性的成员为诱饵蛋白筛选酵母双杂交文库；2)收集步骤1)筛选获得的结合配体克隆以及其它已知或可能的目的结构域结合配...; 高友鹤宋婀莉高诗娟田瑞马素参黄海明; 文献传递

相互作用结构域SH3和WW的蛋白质组学研究被引量：2: 2007年; 在过去十年的研究中,发现许多蛋白质相互作用是通过相互作用结构域(如SH2,WW,SH3等)与其识别的另一个蛋白质中一段短肽序列的结合完成的,蛋白质相互作用结构域在蛋白质亚细胞定位、信号传导和蛋白复合体的组装等方面发挥重要功能。随着蛋白质组学技术的发展,高通量技术用于结构域结合特性及相互作用网络的研究。本文通过概述SH3和WW结构域的蛋白质组学研究策略的最新进展,总结结构域的几种现有研究策略。; 田瑞高诗娟宋婀莉郑德先高友鹤; 关键词：蛋白质相互作用

高效研究多肽结合结构域结合特性新策略的建立及其应用: ●结构域是蛋白质相互作用研究的一个简单高效的入手点在蛋白质组学规模上研究蛋白质相互作用网络是全面了解蛋白质功能、揭示疾病发病机制的有效手段之一。节点蛋白在相互作用网络中占据关键位置,在生命调控机制中发挥重要功能...; 宋婀莉; 关键词：蛋白质相互作用结构域 PDZ结构域酵母双杂交 ZO-1蛋白分子治疗; 文献传递

快速LacZ检测法提高酵母双杂交试验的敏感度被引量：3: 2004年; 目的 :建立快速简单敏感准确的LacZ检测法。方法 :将在SD/ -Trp -Leu培养液中过夜培养的待检测酵母菌直接点样在滤纸上进行LacZ检测 ,筛选出LacZ阳性克隆。结果 :将小鼠 3T3文库转化含有WWP1的酵母菌 ,选出 10个较大的SD/ -Trp -Leu -His培养阳性的克隆 ,利用快速LacZ检测法检测这 10个酵母克隆 ,结果在 5h内不同程度地变蓝 ,呈阳性结果 ;而作为对照的传统检测方法在 8h内的检测结果均显示为阴性。结论 :采用快速LacZ检测法检测蛋白质之间的相互作用可以大大缩短筛选的时间 ,简化筛选的步骤。; 郭佳岩宋婀莉马素参高友鹤; 关键词：酵母双杂交技术蛋白质相互作用

酵母双杂交常用菌株AH109半乳糖苷酶检测实验呈阳性被引量：3: 2005年; 高诗娟田瑞宋婀莉高友鹤; 关键词：阳性酶检测靶蛋白酵母双杂交

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