刘永澜
- 作品数：5 被引量：14H指数：2
- 供职机构：重庆大学更多>>
- 发文基金：重庆市科技攻关计划国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：医药卫生理学更多>>
- R基团搜索策略用于HEA类β分泌酶抑制剂的三维定量构效关系研究与分子虚拟筛选
- 2014年
- β分泌酶是治疗阿尔茨海默病(AD)的理想作用靶点。采用以R基团技术为核心的Topomer CoMFA研究HEA类β分泌酶抑制剂的三维定量构效关系(3D-QSAR),构建了拟合与预测能力良好的3D-QSAR模型,得到拟合、交叉与外部验证的复相关系数分别为r2=0.928,q2loo=0.605和r2pred=0.626。通过3D-QSAR模型搜索ZINC化合物结构片段源,得到活性贡献提高的R基团并结合公共骨架设计得到15个新颖化合物,其预测活性值均优于训练集中的活性最高分子。用分子对接研究新设计化合物与β分泌酶的相互作用模式,结果表明,氢键和疏水性是影响亲和力的重要因素。研究表明,基于R基团的Topomer CoMFA与Topomer Search可以有效地筛选和设计HEA类β分泌酶抑制剂,所设计的分子为AD药物的研发提供了新的候选物。
- 史博智刘永澜李月婷王贵学梁桂兆
- 关键词：Β分泌酶三维定量构效关系COMFASEARCH
- 分子对接技术用于马来酰亚胺类GSK-3α抑制剂的作用特征分析被引量：6
- 2013年
- 糖原合酶激酶-3α(GSK-3α)是治疗阿尔兹海默症(AD)的关键靶点之一.采用基于R基团的搜索组合分子对接研究了GSK-3α抑制剂的作用特征.以45个马来酰亚胺类GSK-3α抑制剂分子为训练集,采用Topomer CoMFA建立3D-QSAR模型,其拟合与留一法交互验证的复相关系数和标准差分别为r2=0.797,SD=0.210,q2cv=0.611,SDcv=0.280,对22个测试集样本外部预测的复相关系数与标准差分别为r2pred=0.703,SDpred=0.213.以Topomer Search搜索技术设计了25个理论上具有更高活性的新型分子.分子对接对比研究表明,新设计的分子与建模样本同GSK-3α的作用位点具有类似的作用特征,且与对比文献一致.该研究为AD治疗的分子设计与研发提供了新的思路.
- 李月婷刘永澜史博智王贵学梁桂兆
- 关键词：3D-QSARCOMFASEARCH分子对接
- 基于Topomer CoMFA和Surflex-dock的GSK-3β抑制剂的3D-QSAR与作用模式研究被引量：9
- 2013年
- GSK-3β的过度表达可导致人脑神经细胞内Tau蛋白的过磷酸化,从而介导阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)的发生.本文旨在研究GSK-3β的马来酰胺类抑制剂的三维定量构效关系(3D-QSAR)及新抑制剂分子与GSK-3β的作用机制.采用基于R基团搜索技术的Topomer CoMFA建立了49个马来酰胺类GSK-3β抑制剂的3D-QSAR模型,并用包括25个样本的测试集验证模型的外部预测能力.所得优化模型的拟合、交互验证以及外部验证的复相关系数分别为0.928,0.790和0.725.采用Topomer search在ZINC分子数据库中进行虚拟搜索,设计了28个可能具有更高活性的新抑制剂.借助Surflex-dock分子对接研究了新抑制剂与GSK-3β作用模式与机制.结果显示,新抑制剂与GSK-3β的Asp133,Tyr134,Val135和Pro136等位点作用显著.
- 刘永澜李月婷史博智钟刊邵奕强曾亚飞黄丹丹王贵学梁桂兆
- 关键词：阿尔兹海默病TAU蛋白COMFA
- 一种Aβ聚集抑制剂
- 本发明公开了一种Aβ聚集抑制剂，其特征在于它的氨基酸序列为：氨基端-VTLWYG-羧基端。本肽序列经原子力显微镜扫描技术检测，进一步用细胞毒性实验评价得到。它对导致阿尔茨海默病的主要毒性体-Aβ的聚集具有良好的抑制作用，...
- 梁桂兆刘永澜王秋明郑洁
- 文献传递
- 一种Aβ聚集抑制剂
- 本发明公开了一种Aβ聚集抑制剂，其特征在于它的氨基酸序列为：氨基端-VTLWYG-羧基端。本肽序列经原子力显微镜扫描技术检测，进一步用细胞毒性实验评价得到。它对导致阿尔茨海默病的主要毒性体-Aβ的聚集具有良好的抑制作用，...
- 梁桂兆刘永澜王秋明郑洁
- 文献传递
