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南京大学生命科学学院演化发育生物学研究所

作品数:2 被引量:11H指数:2
相关作者:张棋麟更多>>
相关机构:兰州大学草地农业科技学院草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院南京财经大学食品科学与工程学院江苏省现代粮食流通与安全协同创新中心更多>>
发文基金:江苏省高校优势学科建设工程资助项目公益性行业科研专项国家自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇农业科学

主题

  • 1篇印度谷螟
  • 1篇荧光
  • 1篇荧光定量
  • 1篇实时定量PC...
  • 1篇实时荧光
  • 1篇实时荧光定量
  • 1篇栖息
  • 1篇青藏
  • 1篇青藏高原
  • 1篇转录
  • 1篇转录组
  • 1篇小RNA
  • 1篇内参
  • 1篇内参基因
  • 1篇基因
  • 1篇基因表达
  • 1篇害虫
  • 1篇MIRNA
  • 1篇仓储害虫
  • 1篇草原

机构

  • 2篇南京大学
  • 2篇兰州大学
  • 1篇南京财经大学

作者

  • 2篇袁明龙
  • 1篇张棋麟
  • 1篇李敏
  • 1篇唐培安
  • 1篇薛昊

传媒

  • 2篇中国科学:生...

年份

  • 1篇2018
  • 1篇2016
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
印度谷螟实时荧光定量PCR内参基因的选择被引量:7
2016年
实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是研究基因表达的重要手段之一,而选择合适的内参基因是获得可靠研究结果的基础.本研究以世界性分布的重要仓储害虫印度谷螟(Plodia interpunctella)为研究对象,旨在筛选出该虫不同发育阶段及不同品系qRT-PCR的最适内参基因,并利用两个独立软件(ge Norm和Norm Finder)对8个备选内参基因的表达稳定性进行了评价.结果表明,不同发育阶段最稳定表达的内参基因为Ef1a,而不同品系最稳定的是b-Actin和Ef1a.利用筛选到的Ef1a,b-Actin及两者组合对目标基因(过氧化物酶POD)进行标准化,印度谷螟不同品系间的POD基因表达量存在显著差异,而以稳定性最差的SD作为内参时,不同品系间POD的相对表达量并无显著差异.这表明,在开展qRT-PCR研究时评价内参基因的稳定性非常必要,且基于筛选到的最佳基因作为内参时,才能准确获得目标基因的相对表达水平.这些结果将有助于更好地研究印度谷螟发育及品系特异相关基因的功能,并为筛选印度谷螟在其他条件下的最适内参基因提供参考.
唐培安张棋麟薛昊袁明龙
关键词:印度谷螟仓储害虫实时定量PCR基因表达内参基因
栖息于青藏高原不同海拔环境的两种草原毛虫miRNA转录组的比较分析被引量:4
2018年
有关动物适应异质性海拔环境的研究,已在表型、解剖学、生理学、基因组学和转录组学等方面广泛开展,但是很少关注小RNA(micro RNAs或miRNAs)的生态适应性功能.草原毛虫是青藏高原高寒草地的重要害虫,并对不同海拔环境产生了良好的适应性.为此,本研究以两种栖息于青藏高原不同海拔环境的黄斑草原毛虫和门源草原毛虫为研究对象,基于Illumina Hi Seq技术对这两种草原毛虫的miRNA转录组进行了高通量测序.结果表明,两种草原毛虫中共鉴定到109个成熟miRNAs,其中47个为保守miRNAs.在所有miRNAs种,共有9个miRNAs的表达水平在两种草原毛虫间存在显著差异性.对这9个差异性表达的miRNAs采用实时荧光定量PCR进行验证,发现8个基因的表达水平与高通量测序结果完全一致.功能分析表明,差异性表达的miRNAs共预测到93个靶基因.这些靶基因主要富集到脂、核酸和维生素等代谢或衰老相关的GO条目,并与代谢、抗寒和低氧等KEGG通路相关(如AMPK信号通路、Wnt信号通路和m TOR信号通路).这些研究表明,miRNAs在草原毛虫对异质性海拔环境的适应性进化过程中具有重要作用.该研究加深了对青藏高原特有昆虫适应高海拔环境的遗传基础的理解.
杨兴卓张棋麟李敏李敏周敏强袁明龙
关键词:小RNA青藏高原
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