复旦大学生命科学学院微生物学和微生物工程系
- 作品数：22 被引量：31H指数：3
- 相关作者：梁丹涛郑宾更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所中国科学院微生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学文化科学更多>>
- 编者按
- 2019年
- 21世纪初,工程科学的研究理念与现代生物学、系统科学以及合成科学的融合,形成了以采用标准化表征的生物元件,在理性设计指导下,重组乃至从头合成创新的、具有特定功能的人造生命为目标的"合成生物学"。合成生物学开启了生命科学可定量、可计算、可预测、可制造的"会聚"研究新时代。
- 赵国屏
- 关键词：合成生物学
- 地中海拟无枝酸菌“硝酸盐效应”的研究进展被引量：3
- 2015年
- 地中海拟无枝酸菌"硝酸盐效应"是指发酵基质中的硝酸盐在一定浓度下大幅度促进该菌合成利福霉素,并对初级代谢产生多种影响的现象。针对该效应,本实验室开展了多年的研究,阐明硝酸盐主要通过两个方面促进利福霉素的生物合成:一方面,硝酸盐增加利福霉素生物合成前体的供给(如UDP-葡萄糖、AHBA、丙二酰Co A以及甲基丙二酰Co A等),尤其是通过抑制体内脂肪酸的合成来保障利福霉素前体丙二酰Co A的供给;另一方面,硝酸盐提升利福霉素生物合成酶基因的表达。因此,在充足的利福霉素前体和合成酶系的协同效应下,菌体生成大量的利福霉素。进一步的工作将围绕"硝酸盐效应"的信号分子、信号转导途径以及相关基因的表达调控和翻译后修饰机制等方面展开。
- 邵志会赵维王颖丁晓明王金姜卫红赵国屏
- 关键词：放线菌硝酸盐利福霉素
- 我国包虫病报告病例数自回归移动平均模型预测研究被引量：6
- 2018年
- 目的采用自回归移动平均模型(Autoregressive integrated moving average,ARIMA)对全国(不含港、澳、台地区)包虫病月报告病例数进行预测,为包虫病的防控提供科学参考。方法通过SPSS 24.0软件,分别以2007-2015年和2007-2014年全国包虫病月报告病例数,分别建立最优的ARIMA模型,并进行模型比较。结果 2007-2015年全国包虫病月报告病例数的最优模型为ARIMA(1,0,0)(1,1,0)_(12),预测相对误差为-13.97%,AR(1)=0.367(t=3.816,P<0.001)、SAR(1)=-0.328(t=-3.361,P=0.001),Ljung-Box Q=14.119(df=16,P=0.590)。2007-2014年全国包虫病月报告病例数的最优模型为ARIMA(1,0,0)(1,0,1)12,预测相对误差为0.56%,AR(1)=0.413(t=4.244,P<0.001),SAR(1)=0.809(t=9.584,P<0.001),SMA(1)=0.356(t=2.278,P=0.025),Ljung-Box Q=18.924(df=15,P=0.217)。结论时间序列不同,所建立的预测模型可能不同。数据积累越多、预测时间越短、预测误差越小的情况还需得到进一步验证。模型的建立和预测应用是动态过程,需要不断根据积累的数据进行调整,但同时要充分考虑影响传染病报告病例数相关工作(普查和专项调查等)的影响。
- 谭恩丽王正峰周文策李石柱卢艳艾琳蔡玉春滕雪娇张顺先党志胜杨春利陈家旭胡薇周晓农周晓农
- 关键词：包虫病
- 利用大肠杆菌tyrB-aspA基因串联表达制备L-苯丙氨酸
- 2005年
- 从大肠杆菌K12菌株中获得tyrB和aspA基因,将2个基因串联并克隆到pλPR质粒上,然后转化到E·coliP2392菌株进行表达。相应酶活力和氨基酸产量检测结果表明,单基因表达和双串联基因串联表达菌株的酶活性成倍提高,与原始菌株相比,AspA活力分别提高243%与239%,TyrB活力分别提高到247%和236%。以基因双串联表达菌株E·coliPBA的菌体悬浮液为酶原,以铵盐、反丁烯二酸和苯丙酮酸为酶转化底物,反应3h后,苯丙酮酸转化苯丙氨酸的效率为93%,苯丙氨酸产率达到0·6g/(g·h)(细胞),是对照菌株的4·7倍。
- 范长胜李欣高山峨王海蛟焦晔王建刚梁国新陶菊红
- 关键词：天冬氨酸酶苯丙氨酸L-苯丙氨酸串联基因大肠杆菌E.COLI
- 我国疟疾报告病例数自回归移动平均模型预测研究被引量：8
- 2017年
- 目的采用自回归移动平均(Autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型对全国(不含港澳台地区)疟疾月报告病例数进行预测研究,为疟疾的预防控制提供参考依据。方法通过SPSS 24.0软件,建立两个时间序列,分别为2006-2015年和2011-2015年全国疟疾月报告病例数的时间序列,并建立最优ARIMA模型,以2016年1-12月全国疟疾月报告病例数进行验证。结果 2006-2015、2011-2015年两个不同时间序列建立的全国疟疾月报告病例数模型分别为ARIMA(2,1,1)(1,1,0)_(12)和ARIMA(1,0,0)(1,1,0)_(12),分别对2016年1-12月数据进行预测,基于2011-2015年数据建立的ARIMA模型的预测误差更小。结论模型的建立和预测应用是动态过程,需要不断根据积累的数据进行调整,从而提高预测精度,但同时要充分考虑传染病流行特征的重大变化等其他因素。
- 侯慧玉宋华芹张顺先艾琳卢艳蔡玉春李石柱滕雪娇杨春利胡薇陈家旭
- 关键词：疟疾
- 胞外囊泡介导血吸虫与宿主相互作用的研究进展被引量：2
- 2020年
- 胞外囊泡(EVs)是由细胞释放至胞外的具有脂质双分子层结构的包膜性小囊泡,内含蛋白质、脂质、DNA和RNA等生物活性分子,可通过与靶细胞受体结合或直接融合的方式传递效应分子,发挥生物学功能。EVs作为一种新型的细胞间信号转导机制,在血吸虫与宿主间的相互作用过程中发挥了重要的调控作用。本文着重阐述EVs的分类、起源、结构和功能以及血吸虫不同发育阶段分泌的EVs介导虫体与宿主相互作用的研究进展,为血吸虫病的防治研究提供新的思路。
- 孙成松孙成松汪天平
- 关键词：血吸虫宿主
- 总结基因组研究成果,发展微生物系统生物学
- 《国家自然科学基金1999年度项目指南》指出,“微生物作为最简单的生命体而成为生命科学研究不可替代的基本材料,由此也奠定了微生物学在生命科学中的基础地位;微生物极其丰富的生物多样性决定了它们具有代谢产物多样性,同时又与人...
- 赵国屏
- 文献传递
- 受miRNA-205调控的重组柯萨奇病毒B3的构建及其复制被引量：1
- 2019年
- 本研究在柯萨奇病毒B3(coxsackievirus B3,CVB3)基因组P1编码区与P2编码区之间插入一段has-miRNA-205-3p和has-miRNA-205-5p(简称miR-205)的靶序列,得到重组病毒v205T,并比较分析了它在人宫颈癌细胞系HeLa细胞(miR-205低水平表达)和非小细胞肺癌细胞系A549细胞(miR-205高水平表达)中的复制情况。结果表明,插入的miR-205靶序列不影响病毒在HeLa细胞中的复制水平,但抑制了病毒在A549细胞中的复制,病毒滴度为对照的1%以下。为探讨v205T在2株细胞中复制差异的原因,进一步加入miR-205的类似物和抑制物。miR-205类似物可抑制v205T在HeLa细胞中复制和杀伤细胞的水平,而miR-205抑制物可提高v205T在A549细胞中的复制和杀伤细胞的水平。结果表明,v205T的复制确实受miR-205的调控。本研究为开发基于CVB3载体的溶瘤病毒和针对CVB3的减毒活疫苗提供了依据。
- 戴潇逸钟江
- 关键词：柯萨奇病毒B3
- AcMNPV ORF38功能初步研究
- 昆虫杆状病毒 AcMNPV 的 ORF38蛋白带有焦磷酸水解酶(Nudix)保守结构域。为研究其功能,首先制备了重组 ORF38蛋白。酶活分析证实重组蛋白具 Nudix 活性,
- 葛晶钟江
- 文献传递
- 中国微生物基因组研究:回顾与展望
- "微生物作为最简单的生命体而成为生命科学研究不可替代的基本材料,由此也奠定了微生物学在生命科学中的基础地位;微生物极其丰富的生物多样性决定了它们具有代谢产物多样性,同时又与人类、动植物和环境有着密切的相互作用,使得微生物...
- 赵国屏
- 文献传递
