深圳大学生命与海洋科学学院深圳市微生物基因工程重点实验室
- 作品数：28 被引量：52H指数：4
- 相关作者：谢宁邓婷婷余弦更多>>
- 相关机构：江西农业大学理学院河南农业大学植物保护学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金深圳市科技计划项目中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生环境科学与工程理学更多>>
- 纳升液相色谱-高分辨串联质谱分析尿液多肽组及其翻译后修饰被引量：7
- 2016年
- 多肽组是指生物体表达的所有多肽,尿液等体液的多肽组是生物标记物的重要来源。本研究采用氧化石墨烯-磷酸镧纳米磁性复合材料分离富集尿液多肽,进行纳升液相色谱-高分辨串联质谱分析,从单一样本中鉴定了归属于123个蛋白质的790条肽段。研究表明,这些肽段在蛋白质水平上不是平均分布的。此外,本研究检测到了肽段的氧化、磷酸化和脱氨化等翻译后修饰现象,观察到了尿液多肽的阶梯序列性,从蛋白水平上对尿液多肽组进行了生物信息学分析,结果表明,这些多肽所归属的大部分蛋白质之间存在相互作用。本方法可为在尿液中寻找疾病的标志物提供方法学支持。
- 洪晓愉李水明王勇
- 关键词：尿液翻译后修饰
- 同源过表达mhr2基因可提高嗜热毁丝霉纤维素酶活性
- 2017年
- 为寻找新型的与纤维素酶相关转录调控因子,以嗜热毁丝霉(Myceliophthora thermophila ATCC42464)为研究材料,通过克隆嗜热毁丝霉mhr2基因序列,构建重组过表达载体,转化并筛选到转化子Mt O24中mhr2基因表达量比野生型菌株高204倍。蛋白浓度及酶活测定的结果显示,诱导培养72 h,转化子胞外蛋白浓度和滤纸酶活分别是野生菌的1.58和1.30倍;非诱导培养144 h,转化子胞外蛋白浓度和滤纸酶活分别是野生菌的1.87和1.49倍。实时荧光定量PCR的结果表明,转化子中主要纤维素酶基因egl1、egl3和cbh1、cbh2的表达量均有显著提高。研究初步证实了mhr2基因具有调控纤维素酶基因表达的功能。
- 龚艳芬谢志臻赵胜明王娟
- 关键词：纤维素酶
- Ppgst基因的转录水平对纳米TiO_2的指示作用研究
- 2018年
- 纳米二氧化钛Ti O2(nTiO_2)的大量使用与排放可能导致环境污染。因此有必要发展nTiO_2的环境污染标志物。该研究用多种粒径(25、43、67 nm)nTiO_2胁迫环境敏感型真菌多头绒泡菌,发现其谷胱甘肽酶(GST)总活性升高了8～44倍,活性高低与nTiO_2的胁迫浓度(5～15 mg/mL)呈现正相关;随后用PCR技术从被胁迫的该菌中克隆到1个谷胱甘肽转移酶(Ppgst)基因,进一步研究发现该基因会对nTiO_2的胁迫产生显著的转录应答,其转录水平与nTiO_2的胁迫浓度(5～15 mg/mL)呈正相关;该研究提示Ppgst基因可以作为生物标志物指示多种粒径nTiO_2的环境污染,具有潜在的应用价值。
- 张智张智张建华刘士德
- 关键词：谷胱甘肽转移酶纳米二氧化钛多头绒泡菌
- 利用GC/MS代谢组学技术检测纳米TiO_2对多头绒泡菌代谢途径的扰动作用被引量：1
- 2018年
- 纳米TiO_2(n TiO_2)具有广泛的应用价值.但n TiO_2在阳光或紫外线下具有很强的氧化作用,可对细胞产生强烈的毒害作用,因此其对生态环境的可能破坏作用值得关注.有关n TiO_2在暗环境中对生物的毒性作用报道还不多,还不能全面揭示n TiO_2的毒性作用机理.代谢组学分析是发现代谢差异、识别被干扰的代谢途径、了解n TiO_2毒性作用机理、评估n TiO_2细胞毒性的重要手段.本文采用GC/MS(气相色谱/质谱)技术检测了n TiO_2在暗环境下对多头绒泡菌原质团(单细胞)代谢组的影响,根据多变量识别模式分析发现了60余个被n TiO_2显著干扰的代谢物.这些代谢物涉及糖代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢、多胺生物合成、次生代谢途径等,为全面了解n TiO_2对细胞的毒性作用机理提供了有益补充.
- 张天任闵武霞夏沁怡李佳琦易思卓张建华刘士德
- 关键词：多头绒泡菌代谢组学
- 里氏木霉组成型表达siRNA干扰cre1基因对纤维素酶表达的调控作用被引量：5
- 2018年
- 使用组成型siRNA干扰载体对里氏木霉碳阻遏抑制因子CRE1进行siRNA干扰以研究其对里氏木霉纤维素酶基因表达的调控作用。根据里氏木霉cre1基因序列设计siRNA干扰片段。利用里氏木霉组成型表达载体将干扰片段分别构建至里氏木霉cre1干扰载体并将其转化里氏木霉QM9414。分别在48和144 h对各转化子进行纤维素酶酶活力测试(CMC酶活力测试和滤纸酶活力测试)及利用qPCR检测相关基因的表达。在诱导144 h时转化子的两种酶活力平均约比出发菌株高出1倍。qPCR检测cre1基因的表达结果表明,转化子的cre1表达量比出发菌株平均降低约50%,而ace1基因表达量变化不大。其他纤维素酶相关基因的表达水平也均高于出发菌株。通过组成型表达siRNA干扰里氏木霉cre1基因可以明显调控纤维素酶基因的表达,为研究纤维素酶的基因表达与调控提供参考。
- 高云雨钟路遥董冠园佘伟怡周娇娇刘思远田生礼
- 关键词：里氏木霉RNA干扰
- 大豆PM1蛋白抗氧化作用及提高酵母对铜耐受力
- 2017年
- Cu^(2+)是植物生长必需的微量元素之一,但土壤中过量的Cu^(2+)会对植物细胞产生毒害作用.大豆GmPM1蛋白属于第4组的胚胎晚期富集(late embroygenesis abundant,LEA)蛋白,该组蛋白序列中富含组氨酸残基.研究大豆GmPM1蛋白在提高植物耐Cu^(2+)胁迫方面的保护作用及其机理.对大豆幼苗进行150μmol/L Cu SO_4胁迫实验.结果表明,Cu^(2+)胁迫会造成大豆幼苗叶片失水萎蔫;在胁迫3 h和24 h时,幼叶内GmPM1基因表达上调.构建了酵母表达载体p YES2-GmPM1,转化Cu^(2+)敏感型酵母(ΔYAP1)得到重组菌ΔYAP1-GmPM1.检测结果表明,表达GmPM1蛋白的酵母重组子对Cu^(2+)胁迫耐受力得到提高.采用Cu抗坏血酸体系,在体外检测出GmPM1及富含组氨酸残基的GmPM1-C端蛋白具有清除羟基自由基能力.研究表明,大豆GmPM1蛋白可通过其C端的组氨酸残基结合过多的Cu^(2+),清除由Cu^(2+)胁迫造成的细胞内产生的过量羟基自由基,提高植物及其细胞对Cu^(2+)胁迫的耐受性.
- 李承娜高阳刘子明刘国宝郑易之
- 关键词：大豆组氨酸
- 拟南芥microRNA通路中新因子的筛选和突变体分析被引量：1
- 2017年
- 小核糖核酸(micro ribonucleic acid,miRNA)是一类长度为20~24核苷酸(nucleotide,nt)的非编码的核糖核酸(ribonucleic acid,RNA),在植物生长发育过程中具有重要作用.为鉴定参与植物miRNA合成、降解和运输等通路的因子,利用拟南芥转基因株系SUC2:amiR-SUL进行正向遗传筛选体系,通过对该株系进行甲基磺酸乙酯(ethylmethylsulfone,EMS)诱变筛选获得SUP-E45突变体.对该突变体进行表型观察、实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)和全基因组测序实验.结果显示,突变的基因为Ago1(Argonaute 1),该基因编码的AGO1蛋白是miRNA通路中至关重要的蛋白,成熟的miRNA与AGO1蛋白结合形成miRISC沉默复合体(miRNA-induced silencing complex,miRISC)从而对靶基因的表达进行负调控.验证了该筛选体系的可行性.通过该筛选体系可筛选出其他参与miRNA合成、影响miRNA活性或miRNA运输等通路的因子,为后续拟南芥miRNA通路的研究奠定了基础.
- 赵庆喆梁超莫蓓莘
- 关键词：分子生物学拟南芥EMS诱变全基因组测序
- 中国大都市食品安全指数模型构建与应用被引量：2
- 2017年
- 针对中国大都市食品安全现状与监管需求,提出一种食品安全指数模型的构建方法.基于食品日常监督抽检和风险监测大数据,考虑指标效益,设计有效系数及影响因子进行数学建模.通过深圳市实例验证,获得2013—2016年深圳市食品安全指数依次为89.88、90.31、91.89和92.66,表明所建立的食品安全指数模型实用有效,可用于城市食品安全评价或区域比较.
- 胡萍余少文余弦韩平华周鹏
- 关键词：食品安全
- 真菌纤维素酶表观遗传修饰的研究进展被引量：2
- 2018年
- 组蛋白乙酰化酶编码基因gcn5、蛋白甲基转移酶LaeA及其同源物Lae1、VeA等可通过作用于调节纤维素酶基因及其表达调控因子的表达,进而在转录水平上影响纤维素酶基因的表达。简述了真菌纤维素酶的种类与结构和真菌纤维素酶基因的表达调控机制,重点从DNA甲基化、蛋白甲基化和乙酰化以及非编码RNA等的角度,综述几种主要表观遗传修饰对真菌纤维素酶基因表达作用的研究进展。
- 郑春娟邓婷婷来亚鹏刘刚王娟
- 关键词：DNA甲基化LAEA组蛋白乙酰化SIRNA
- 里氏木霉磷酸化蛋白质组的非标记定量分析被引量：1
- 2016年
- 目的:利用液相色谱串联质谱和非标定量技术,研究里氏木霉中磷酸化蛋白在不同培养条件下的表达差异,以期获得与纤维素酶表达调控相关的磷酸化蛋白。方法:分别在阻遏条件、诱导条件和中性条件下培养里氏木霉,提取胞内总蛋白,进行酶切和非标记定量分析。结果:对比诱导条件与阻遏条件、诱导条件与中性条件、阻遏条件与中性条件下培养的里氏木霉的胞内蛋白表达量差异,分别发现差异蛋白90、61和90个。根据其功能,可将这些差异蛋白归为四类,即锌指蛋白、ATP结合蛋白、具有N-乙酰化转移酶活性的蛋白以及具有氧化还原酶活性的蛋白。它们主要参与糖酵解、蛋白质合成、DNA修复以及转录调节过程。结论:发现的这些差异蛋白为研究调控纤维素酶的表达调控提供了新的线索。
- 阮土娣马成成刘思远王娟李水明刘刚
- 关键词：里氏木霉纤维素酶
