贵州医科大学基础医学院微生物学教研室
- 作品数：55 被引量：91H指数：5
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- 相关领域：医药卫生生物学农业科学环境科学与工程更多>>
- 幽门螺杆菌临床标本的最佳运送条件及最适培养基的实验研究
- 目的:探索幽门螺杆菌临床标本的最佳运送条件和最适培养基.方法:将实验菌株加入小牛血清、牛奶运送液,分别置不同温度及气体环境6h后接种于哥伦比亚血琼脂微需氧培养;将20例临床标本分别接种于MH和哥伦比亚血琼脂微需氧培养5天...
- 王琼杨杰潘科黄亚琴陈峥宏王菲綦廷娜
- 瓷珠保藏法和脱纤维绵羊血介质保藏法对幽门螺杆菌的保藏效果被引量：1
- 2018年
- 目的比较瓷珠保藏法和脱纤维绵羊血介质保藏法对幽门螺杆菌(Hp)的保藏效果。方法对分离自胃炎和胃溃疡患者胃黏膜组织的10株Hp菌株,分别采用瓷珠保藏法和脱纤维绵羊血介质保藏法置于-80℃保藏。比较两种保藏方法在冻存1个月、反复冻存2、3、6个月以及直接保藏12个月的复苏存活率。结果 10株Hp菌株冻存1个月、反复冻存2、3、6个月,采用瓷珠保藏法的复苏存活率分别为90.0%、90.0%、90.0%、50.0%,而脱纤维绵羊血介质保藏法的复苏存活率分别为100%、100%、100%、80.0%,两种方法复苏存活率相比均无统计学差异(P>0.05)。瓷珠保藏法、脱纤维绵羊血介质保藏法和液体冻存的菌株在保藏12个月复苏时的存活率分别为70.0%、100%和100%;瓷珠保藏法与脱纤维绵羊血介质保藏法的复苏存活率相比无统计学差异(P>0.05)。结论瓷珠保藏法和脱纤维绵羊血介质保藏法均适用于Hp的保藏;吸附菌细胞的瓷珠和含有菌细胞的保藏管内液体可分别冻存。
- 郭长城刘芳吴芳草王琼印琳陈峥宏
- 关键词：幽门螺杆菌菌种保藏
- 结核分枝杆菌pyrF基因的生物信息学分析被引量：5
- 2019年
- 目的应用生物信息学软件分析预测结核分枝杆菌乳清酸核苷-5'-磷酸脱羧酶(orotidine 5'-monophosphate decarboxylase,OMPdecase)的结构与生物学特性。方法采用ProtParam,ProtScale,TMPred,SignalP4.1,NetNGlyc1.0,Netphos3.1,SOPMA,SWISS-MODEL和STRING等生物信息学软件对结核分枝杆菌(Mycobacterium Tuberculosis)H37Rv的pyrF基因及其编码蛋白OMPdecase的理化性质、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点、二级结构、三维结构和蛋白-蛋白相互作用网络等进行预测分析。结果预测结核分枝杆菌pyrF基因编码的OMPdecase为相对分子质量27.4×10~3的富含丙氨酸、甘氨酸和缬氨酸的稳定疏水性膜蛋白或胞浆蛋白,不含信号肽,且磷酸化程度较高。α螺旋和无规卷曲为OMPdecase的主要二级结构元件,分别占51.09%和27.37%。同源建模分析显示D93-K95-D98-I99-T102位于活性中心区域内。结论生物信息学方法预测结核分枝杆菌pyrF基因编码的OMPdecase相对分子质量为27.4×10~3,为稳定疏水性膜蛋白或胞浆蛋白,其含有的保守氨基酸残基D93-K95-D98-I99-T102与该蛋白的催化活性密切相关。
- 黄劲王洁牛雪可邱文赵亮王梅竹康颖倩冯永红秦莲花
- 关键词：结核分枝杆菌生物信息学
- 家蝇抗菌肽Sarcotoxin Ⅱ家族基因的克隆及原核表达条件优化
- [目的]克隆家蝇抗菌肽sarcotoxin Ⅱ 家族基因S50、S52、S88、S90,对其进行原核表达并优化表达条件.[方法]1.从家蝇转录组库中克隆差异表达基因sarcotoxin Ⅱ 家族基因S50、S52、S88...
- 王兵田川张雪婷黄伟康石玉玲杨丽萍覃海姚杨修江帆彭建朱贵明尚小丽王涛吴建伟
- 关键词：家蝇抗菌肽原核表达
- 乳双歧杆菌对旋毛虫感染小鼠炎性细胞因子及肠道菌群的影响被引量：1
- 2023年
- 目的探究不同剂量乳双歧杆菌对旋毛虫感染小鼠的虫荷量、炎症调节作用及肠道菌群组成的影响。方法取感染旋毛虫的小鼠(300条/只)随机分为模型组、乳双歧杆菌高剂量组、中剂量组、低剂量组,未感染旋毛虫小鼠作为空白对照组;高、中、低剂量组分别给予乳双歧杆菌灌胃,模型组和空白对照组每日给予等量磷酸缓冲盐溶液(phosphate buffered saline,PBS)连续灌胃30 d;胃蛋白酶消化法检测各组第7 d肠道成虫数量及第30 d肌肉幼虫数量。ELISA法检测各组模型小鼠血清中白细胞介素10(Interleukin-10,IL-10)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor,TNF-α)水平,采集各组小鼠肠道感染期粪便样本,采用16S rDNA高通量测序进行微生物组生物信息学分析,评估样本多样性和分类学特征。结果虫荷量结果显示,高剂量乳双歧杆菌显著降低旋毛虫感染小鼠第7 d肠道成虫及第30 d肌肉幼虫数量(P<0.05);炎性因子水平检测发现高剂量乳双歧杆菌使旋毛虫感染小鼠血清抑炎因子(IL-10)水平升高(P<0.05),促炎因子(TNF-α)水平降低(P<0.05)。肠道微生物组成结果显示,乳双歧杆菌干预使感染小鼠厚壁菌门与拟杆菌门比值上升,降低普雷沃菌属丰度,高剂量组中异杆菌属、颤螺菌属丰度增加,中剂量组中布劳特菌属增加。结论乳双歧杆菌能改善旋毛虫感染小鼠炎症表现,促进旋毛虫清除,提高感染小鼠肠道内有益菌丰度。
- 迟茜文解文利姚梦玮李玉迁魏洪
- 关键词：旋毛虫肠道菌群炎性因子
- 水泡性口炎病毒通过基质金属蛋白调控结肠癌SW480细胞增殖、迁移和侵袭
- 2022年
- 目的探讨水泡性口炎病毒(VSV)对结肠癌SW480细胞增殖、迁移和侵袭的影响及其分子机制。方法用Vero细胞对VSV进行扩增、浓缩和滴度测定。通过CCK-8法检测不同浓度的VSV对SW480细胞增殖活性的抑制作用;采用划痕实验、Transwell实验检测SW480细胞的迁移和侵袭能力;实时荧光定量聚合酶反应(qPCR)及蛋白质印迹法(Western blotting)检测SW480细胞的MMP-2、MMP-9 mRNA及蛋白表达。结果VSV处理组增殖率小于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。VSV处理组细胞的迁移能力低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。VSV处理组侵袭细胞数明显低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。VSV处理组MMP-2表达量高于对照组,MMP-9表达量低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论VSV通过靶向调控基质金属蛋白的表达能够抑制结肠癌SW480细胞的侵袭、迁移。
- 李戈姚梦玮李玉迁李胜方小涵魏洪
- 关键词：水泡性口炎病毒
- 幽门螺杆菌培养中分离的胃内菌群的鉴定
- 印琳齐兴爽王琼刘芳郭长城陈峥宏
- 海南省39株幽门螺杆菌的耐药性及毒力基因特征
- 2024年
- 目的了解海南省幽门螺杆菌(Hp)耐药性及其毒力基因vacA、cagA和iceA基因型特征。方法对146例上消化道症状疾病患者进行胃镜检查,取胃黏膜组织进行Hp的分离和培养,对Hp进行药敏检测;通过聚合酶链式反应(PCR)对毒力基因cagA、vacA和iceA进行检测和分型,cagA测序进行聚类分析、并构建系统进化树;使用Fisher确切概率法分析各型毒力基因和患者疾病发生的相关性。结果共培养出39株Hp,对阿莫西林和克拉霉素的耐药率分别为2.6%和48.7%;39株均为vacA^(+)菌株,iceA 1型26株、2型13株;33株为cagA^(+)菌株,其中5株为西方型(EPIYA-ABC型),28株为东亚型(EPIYA-ABD型);cagA^(+)和vacA^(+)菌株与胃和十二指肠疾病有显著的相关性(P<0.05),iceA则无显著性差异(P>0.05)。结论海南省胃和十二指肠Hp患者中Hp毒力基因多样化,vacA s1am2/cagA^(+)基因型在消化性溃疡患者中占优势,不同毒力基因型对胃和十二指肠疾病的发生具有明显的差别,阿莫西林可作为该地区根除Hp首选抗生素。
- 卓书伟林美幸吴翔潘静琳周海清陈海陈峥宏
- 关键词：幽门螺杆菌耐药性基因多样性CAGAVACAICEA
- 热纤梭菌Cthe_2401蛋白功能预测及在大肠杆菌中的克隆表达与纯化
- 2024年
- 目的利用生信手段预测Cthe_2401蛋白的特性与功能,并在大肠杆菌中进行体外克隆、表达与纯化。方法利用国家生物技术信息中心数据库(NCBI)、蛋白保守结构域数据库(CDD)分析Cthe_2401蛋白的序列和进化特征,采用SWISS-MODEL在线软件进行同源建模并预测该蛋白的结构与功能;利用聚合酶链式反应(PCR)扩增Cthe_2401基因,并与pET28a载体链接构建pET28a-Cthe_2401表达质粒,转化大肠杆菌后利用异丙基硫代半乳糖(IPTG)诱导Cthe_2401蛋白表达;利用50%硫酸铵沉淀、Ni-NTA柱以及SephadexG75葡聚糖凝胶柱纯化Cthe_2401蛋白。结果生物信息学预测表明,Cthe_2401蛋白属于Veg蛋白家族,可能与生物膜的发生和孢子形成有关;Cthe_2401蛋白成功在大肠杆菌克隆与表达,体外纯化获得约10 ku大小的蛋白条带,与预期结果一致。结论成功预测Cthe_2401蛋白的功能,成功获得Cthe_2401蛋白在大肠杆菌中的克隆、表达与纯化。
- 崔古贞管玉祝王鑫鑫花登雄吴道艳吴晓娟钟欣言洪伟陈峥宏
- 关键词：生物信息学大肠杆菌
- 阿尔茨海默病合并深部感染患者的病原菌分布规律及耐药性特点
- 2024年
- 目的探讨阿尔茨海默病(AD)合并深部感染住院患者的病原菌分布规律及耐药性特点。方法选取AD合并深部感染患者350例为研究对象,收集患者的痰液(n=244)、尿液(n=83)、血液(n=20)及其它分泌物(n=3)标本350份分离培养得纯菌落,采用全自动微生物鉴定系统对纯菌落进行菌种鉴定;收集164例临床体征表现典型的AD合并肺部感染患者的痰标本进行分离培养得纯菌落,采用全自动微生物鉴定系统对纯菌落进行菌种鉴定,并对该164例患者的基础疾病和死亡情况进行统计;选取AD合并肺部感染排名前5的155株主要菌株进行药物敏感试验;同时收集上述菌株来源患者的肺部影像学资料。结果350份AD合并深部感染患者的标本中培养出病原菌397株,数量最多的细菌是铜绿假单胞菌(23.93%),数量最多的真菌是白念珠菌(5.04%);AD合并肺部感染的患者常常伴有多种基础疾病,伴有糖尿病的患者占比居首位(53.66%),其次是伴有高血压病的患者占比(47.56%);药敏检测结果显示,鲍曼不动杆菌对哌拉西林/他唑巴坦耐药率最高(47.36%),大肠埃希菌对环丙沙星耐药率最高(44.44%),铜绿假单胞菌对庆大霉素耐药率最高(59.25%),金黄色葡萄球菌对头孢吡肟耐药率最高(70.58%),肺炎克雷伯菌对头孢吡肟耐药率最高(38.29%);对AD合并肺部感染患者的常见影像学表现以小叶性肺炎居多,间质性肺炎及肺脓肿情况少见。结论AD合并深部感染患者的病原菌以革兰阴性菌居多,感染部位以肺部感染最高,菌株对环丙沙星、左氧氟沙星、头孢他啶、头孢吡肟及庆大霉素耐药率较高。
- 姚昌昊唐琴周晓明康颖倩
- 关键词：阿尔茨海默病深部感染病原菌构成比耐药性
