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南开大学泰达生物技术研究院: 作品数：15 被引量：10H指数：2; 相关作者：王培胜钱云云王天威尹春燕杨斌更多>>; 相关机构：天津职业技术师范大学自动化与电气工程学院天津师范大学化学学院河北经贸大学生物科学与工程学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金中国博士后科学基金更多>>; 相关领域：医药卫生生物学理学化学工程更多>>

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副溶血弧菌K抗原基因决定簇的破译及液相芯片检测方法的建立: 2020年; 副溶血性弧菌是一种革兰氏阴性嗜盐致病菌,被认为是多血清型引起的主要食源性致病菌.通过全基因组测序技术,实现对K3、K29、K61菌株的测序.并且使用相关软件对测序数据进行基因预测和功能注释从而实现抗原决定簇的破译.鉴定的3个血清型的K抗原基因簇,表现出高程度的遗传多样性.根据K抗原基因决定簇的特异基因,建立了用于检测和鉴定这3种K血清型的液相芯片检测体系.本研究中破译的副溶血弧菌K抗原基因决定簇以及基于分子技术建立的检测分型体系,为高效的细菌检测提供了可能.; 庞羽郭玺刘粉霞孙昊张思厉书杰刘斌; 关键词：副溶血弧菌全基因组测序液相芯片

一种PT试剂用于测定血浆内FXa活性的用途: 本发明提供了一种PT试剂用于测定血浆内FXa活性的用途，以及采用PT试剂测定血浆内FXa活性的方法，所述PT试剂安全易得，代替昂贵稀少的RVV‑X，所述FXa活性测定方法简便易操作，高效灵敏，能有效反应血浆内FXa活性。; 孙双勇郝春华张蕊王维亭徐向伟赵专友蒋玲艳; 文献传递

猪链球菌血清未分型菌株的荚膜多糖基因簇分析被引量：2: 2016年; 目的从基因水平上探究猪链球菌菌株血清不可分型的原因及cps基因簇序列变异规律。方法根据Gen Bank登记号下载并提取41株猪链球菌血清未分型菌株的cps基因簇序列,根据wzy序列确定菌株的cps型别,并与相应血清型标准菌株的cps基因簇进行序列比对研究。结果 41株血清未分型猪链球菌中,共有37株菌的cps型别属于已知血清型。其中18株与其对应的血清型标准菌株的cps基因簇相比出现部分cps基因的插入、缺失、倒转、替换和移码突变等变异;另有19株与其对应的血清型标准菌株的cps基因簇序列相同或相似,除携带血清24型cps基因簇的菌株LSS23、LSS31、LSS37与血清24型标准菌株88-5299A的cps基因簇同源性为96%外,其余16株与其各自的标准菌株的cps基因簇同源性均超过99%。此外,有4株血清未分型菌株属于已知的新cps型别。结论由于猪链球菌cps基因簇序列变异频繁,导致荚膜多糖抗原型别呈多样化趋势,传统的血清凝集方法无法有效应对,亟需引入更灵敏的分子血清分型技术开展监测。; 邱小彤郝琴白雪梅; 关键词：猪链球菌基因特征

高盐环境下鼠伤寒沙门氏菌差异糖蛋白富集及组学分析被引量：1: 2020年; 【背景】沙门氏菌是一种革兰阴性肠道病原菌,主要依靠Ⅲ型分泌系统(type Ⅲ secretion systems,T3SSs)来产生与致病性相关的效应蛋白。其中沙门氏菌致病岛(Salmonella pathogenicity island,SPI)区域是关键的基因区域。高盐浓度条件可以诱导SPI-1上效应蛋白的表达。【目的】探究在高盐浓度条件下鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella enterica serovar Typhimurium)糖蛋白的差异表达情况,寻找有意义的效应糖蛋白。【方法】将鼠伤寒沙门氏菌在普通培养基和高盐培养基中培养,收集菌体并超声裂解,提取蛋白后,用肼偶联法富集糖蛋白并用胰酶酶解,通过二甲基标记定量及LC/MS定量蛋白质组学方法进行糖蛋白的定量,用Thermo Proteome Discoverer 2.2软件对标记蛋白进行定性及定量分析。【结果】质谱结果显示,高盐环境中,沙门氏菌有19个糖蛋白的表达发生显著改变,其中,上调蛋白10个,最为显著的是ompC基因编码的外膜孔蛋白;下调表达糖蛋白9个,最为显著的是yjgF基因编码的翻译起始抑制因子。【结论】根据定量蛋白质组学分析,沙门氏菌在高盐环境下有多种重要糖蛋白的表达水平发生显著改变,这一结果对研究沙门氏菌SPI-1产生的效应糖蛋白表达情况以及寻找沙门氏菌致病机制有重要意义。; 陈香云杜旭东郑小煜周大炜; 关键词：鼠伤寒沙门氏菌

用酶联免疫吸附法检测蛋白质的聚合: 2015年; 许多蛋白质二聚化或多聚化在调节其功能方面发挥重要作用,研究蛋白质的聚合有助于阐明相关的生物学过程.本文使用酶联免疫吸附法,对分子量11 k D的马传染性贫血病毒核壳蛋白(nucleocapsid protein 11 k D,NCp11)的聚合进行检测.首先利用亲和层析分别纯化了NCp11以及N-端或C-端融合有FLAG标签的NCp11.然后将NCp11包被于聚苯乙烯96孔板底,加入带FLAG标签的NCp11与之聚合,再依次加入抗FLAG抗体、辣根过氧化物酶标记的二抗及底物,反应终止后于450 nm波长下读取吸收值.结果表明,酶联免疫吸附法适用于NCp11聚合的检测,可对聚合的特异性、剂量依赖效应和影响因素等进行定量评价.利用该方法不仅能检测蛋白质的聚合,而且具有灵敏度高、特异性好、通量高、成本低和快速简便等优点,有望获得广泛应用.; 钱云云郭玉莹安婧王颖; 关键词：酶联免疫吸附法核壳蛋白马传染性贫血病毒

鼠伤寒沙门菌7个未知功能岛在致病性中的作用: 2017年; 【目的】探索沙门菌在进化过程中通过水平转移获得的未知功能岛在其致病过程中的作用,发现新的与致病性相关的岛。【方法】以鼠伤寒沙门菌ATCC 14028为亲本株,利用λRed重组酶系统分别构建了7个未知功能岛(STM14_0667-0673、2682-2687、2885-2891、3721-3728、4247-4253、4823-4828、5331-5341)的突变株,通过细胞侵袭实验、巨噬细胞内复制力检测及小鼠实验比较了野生型和突变株的毒力差异。【结果】Δ2682-2687和Δ5331-5341对上皮细胞的侵袭力显著低于野生型(P<0.01);Δ2682-2687、Δ2885-2891和Δ5331-5341在巨噬细胞内的复制力、对小鼠的致死率以及在小鼠肠道和肝、脾的定殖能力均显著低于野生型(P<0.05);其余4个突变株(Δ0667-0673、Δ3721-3728、Δ4247-4253、Δ4823-4828)的侵袭力、胞内复制力以及对小鼠的致病力与野生型相比无显著差异。【结论】发现3个未知功能岛显著影响鼠伤寒沙门菌的致病力,为深入研究这些岛的功能及调控机制奠定了基础。; 蒋玲艳江小涵王培胜杨斌; 关键词：鼠伤寒沙门菌

粗纤维牛肝菌果冻制作工艺及优化被引量：1: 2022年; 研究粗纤维牛肝菌果冻最佳制作工艺。以荞麦粉、山药粉为原料,点柄粘盖牛肝菌色素为色素添加剂,以感官评价为指标,采用单因素试验和正交试验优化粗纤维牛肝菌果冻最佳制作工艺。结果表明,粗纤维牛肝菌果冻最佳制作工艺为荞麦粉添加量0.50%,山药粉添加量0.50%,点柄粘盖牛肝菌色素添加量0.10%,柠檬酸添加量0.10%,罗汉果甜苷添加量0.10%,卡拉胶添加量1.25%。按照此配方制作的果冻口感优良、色泽宜人,符合消费者健康饮食的理念且为新型保健果冻的研发提供参考。; 李京泓周佳蕊郭彤刘坤; 关键词：荞麦粉山药粉果冻

利用转录物组数据挖掘致脑膜炎大肠杆菌候选非编码RNA: 2021年; 细菌非编码RNA(ncRNAs)是细菌生长和感染过程中至关重要的转录调控因子,对致病菌快速响应环境变化,调整自身基因表达抵御环境胁迫尤为重要。本研究通过对新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218的高通量转录物组测序,发现新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218(NMEC)表达丰富的ncRNAs。经生物信息学分析,在新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218中,共发现45个潜在的ncRNAs。通过与非致病性大肠杆菌K-12基因组比对,发现新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218基因组有300个大于100 bp的特异性序列。结合分析获得的非编码RNA,发现共有9个ncRNAs是新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218特异的。随机选择Nsr21,用小鼠尾静脉注射模型验证其作用,发现与野生型RS218对照组相比,注射Δnsr21的小鼠血液中的含菌量显著增加(P<0.01)。说明缺失Nsr21后,更有利于新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218在小鼠血液内生存和繁殖。通过qRT-PCR检测Nsr21表达发现,与体外培养环境相比,小鼠血液环境中Nsr21的表达显著下调(P<0.001)。说明新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218,是通过下调Nsr21的表达使其更有利于在血液中生存和繁殖。本研究提示,新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218基因组中包含大量的ncRNA,这些ncRNA可能与调控NMEC致病性相关。NMEC在感染血液过程中,通过下调Nsr21的表达使NMEC在血液中的繁殖能力增加。; 孙昊宋雅君郑杨洋刘郁涛任薇万雪花; 关键词：非编码RNA

dTDP-L-鼠李糖生物合成路径的电喷雾多级串联质谱法表征: 2016年; 本研究以2’-脱氧胸苷-5’-二磷酸-L-鼠李糖(dTDP-L-Rha)生物合成路径涉及的系列酶促反应产物为研究对象,建立了电喷雾碰撞诱导解离串联质谱(CID-ESI-MSn)对罕见单糖生物合成路径的表征方法。该方法首先通过ESI-MS技术分析2’-脱氧胸苷-5’-二磷酸-D-葡萄糖-4,6-脱氢酶(RmlB)、2’-脱氧胸苷-5’-二磷酸-4-酮-6-脱氧-葡萄糖-3,5异构酶(RmlC)和2’-脱氧胸苷-5’-二磷酸-4-酮-鼠李糖还原酶(RmlD)酶活产物的形成,随后应用CID-ESI-MSn技术对酶促反应终产物L-鼠李糖(dTDP-L-Rha)的结构进行表征。结果表明:dTDP-L-Rha的生物合成始于2’-脱氧胸苷-5’-二磷酸-D-葡萄糖(dTDP-DGlc),依次涉及RmlB、RmlC和RmlD三个酶的参与。这与传统的高效液相色谱法(HPLC)监测、纯化制备,核磁共振(NMR)及ESI-MS结构表征的分析结果一致。该方法简单、灵敏、快速,适用于重要罕见单糖生物合成路径的表征。; 许莹莹董晨影周大炜

肠道菌群及其代谢物与动脉粥样硬化的关系: 2023年; 心血管疾病发病率和致死率较高,动脉粥样硬化(AS)则是临床上诱发心血管疾病的最主要因素。近年来,伴随基因组学和代谢组学等技术的快速发展,越来越多的研究显示肠道菌群(GM)及其代谢物与AS的发生、发展密切相关。研究还表明,通过改变GM的组成并人为添加某些代谢产物,有利于改善和缓解AS的进程,从而为该病的治疗提供了新的潜在方案。同时,一些天然产物也显示出改善和缓解AS的功效。该文就GM的组成及其代谢物与AS的关系,以及某些特定GM和天然产物作为AS治疗的潜在手段等研究现状进行综述,并总结了现有研究存在的不足,提出了改进策略。; 黄俊杰郭玺; 关键词：心血管疾病动脉粥样硬化肠道菌群代谢产物

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