中国热带农业科学院椰子研究所海南省热带油料作物生物学重点实验室
- 作品数：156 被引量：497H指数：11
- 相关作者：曹红星范海阔冯美利杨耀东张军更多>>
- 相关机构：湖南农业大学园艺园林学院海南大学园艺园林学院吉首大学生物资源与环境科学学院更多>>
- 发文基金：海南省自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程经济管理更多>>
- 不同染色剂对SDS-PAGE染色体系的影响被引量：2
- 2014年
- [目的]研究不同染色剂对SDS-PAGE染色体系的影响。[方法]通过SDS-PAGE染色体系中不同考马斯亮蓝染料、染色方法和染色时间的比较,探讨适合油棕和椰子的最佳染色体系。[结果]改进后的方法染色效果好,较好脱色,凝胶背景清晰,容易分析蛋白含量较低的条带。染色时间短(2 h),条带较少,一些低丰度的蛋白条带未能清晰地显示出来,适当延长染色时间(6 h或过夜)效果较好。3种不同染料均能较好地对蛋白质条带染色,R350和R250相比G250效果稍好些,条带着色深,蛋白质含量低的细小条带也能较好的染色。[结论]SDS-PAGE是开展蛋白质组学研究的关键技术,建立简易、稳定的染色方法具有重要意义。
- 林方养杨耀东万婕高丽娜马子龙吴翼
- 关键词：SDS-PAGE考马斯亮蓝染色
- 我国几个主要椰子品种花粉生活力研究被引量：8
- 2013年
- 采用蔗糖萌发、醋酸洋红染色、TTC染色、I2-KI染色、红墨水染色法,分别测定了6个椰子(Cocos nucifera L.)品种的花粉活力,并比较了各方法的优、缺点。试验结果表明:前4种方法的测定效果较好;在6个品种中,杂交种文椰78F1的花粉活力最高,海南高种的花粉活力较高。
- 李和帅王承民王波超范海阔
- 关键词：椰子花粉
- 幼龄椰树下不同花生品种农艺性状及产量分析
- 2021年
- 椰树行间间距大,林下间种花生能够提高椰园非生产期的经济效益,同时有利于改善土壤质量。通过幼龄椰树林下栽培15个花生品种,分析农艺性状及各性状之间的相关性。结果表明,不同品种之间农艺性状差异大。以当地东方种为对照,四粒红、中花12号、桂花36号、桂花771、桂花红132的植株长势显著优于当地东方种,中花26号的单株饱果数显著高于当地东方种,中花16号、中花24号、中花26号、桂花黑1号的单位面积产量显著高于当地东方种,中花6号、中花9号、中花12号、桂花771的单位面积产量显著低于当地东方种。变异分析表明,无效果数、秕果数的变异系数较大,出仁率、饱果率的变异系数相对较小。相关性分析表明,单位面积产量与单株饱果数、百果质量、单株结果数、结果枝数、百仁质量呈极显著正相关;主茎高与侧枝长,结果枝数与总分枝数、单株结果数、单株饱果数、百仁质量,单株结果数与单株饱果数、百仁质量,百果质量与百仁质量,呈极显著正相关;主茎高与总分枝数、结果枝数,侧枝长与总分枝数、结果枝数,总分枝数与百仁质量,呈极显著负相关。综合分析,在一定范围内,主茎越高,侧枝越长,分枝数和结果枝数越少,单株结果数、单株饱果数和秕果数也越少,百果质量与百仁质量也相对越小。
- 尹欣幸杨伟波
- 关键词：花生农艺性状
- 一种适合油棕不同组织RNA提取的方法被引量：1
- 2014年
- 获得高质量的RNA是开展油棕果实发育相关分子生物学基础研究的重要前提和保障。以油棕成熟果肉、胚乳、胚和胚芽4种组织为材料,分别采用Invitrogen公司的Trizol试剂和MRIP法提取总RNA,并比较其提取效果。结果表明:MRIP法提取的RNA质量较好,其中胚芽中的总RNA提取量高达2 139.0 ng/μL,而胚乳中的含量相比较低,仅为1 083.6 ng/μL;MRIP法的总体提取效果优于Trizol试剂,包括RNA完整性、含量、纯度等,适用于油棕及棕榈科植物总RNA提取。
- 李静王永杨耀东雷新涛肖勇夏薇
- 关键词：油棕果实
- 棕榈科植物基因克隆方法的优化
- 2014年
- 【目的】优化棕榈科植物基因克隆方法,为其基因组学研究和分子育种奠定基础。【方法】通过优化DNA提取和目的片段回收步骤,检测其对提取DNA质量和纯度、目的片段回收率与阳性克隆等的影响。【结果】DNA提取方法优化后,提取获得的DNA完整性好,无杂质、无弥散现象,质量较好,其OD260/OD280在1.88-1.93;优化前不同样品提取的DNA仅为40.0-60.0 ng/μL,优化后样品DNA在104.5-214.8 ng/μL,为优化前的2-3倍;目的片段回收方法经优化后,可以从扩增的PCR产物中回收获得条带较清晰的目的片段,其胶回收率较高;对回收的目的片段进行亚克隆,以gyspy74引物鉴定阳性克隆,每个样品的菌落均在700 bp左右扩增获得清晰的目的条带,且其中3个菌落的目的条带测序结果与预期核酸序列一致。【结论】优化后的方法适用于棕榈科植物基因克隆。
- 李静王永杨耀东雷新涛夏薇
- 关键词：棕榈科植物基因克隆
- 油棕EgGRF转录因子家族的全基因组鉴定与表达分析被引量：1
- 2021年
- 生长调控因子(Growth regulating factor,GRF)是植物中重要的转录因子,参与植物生长、发育和逆境胁迫响应等多种生物学过程。本研究从油棕(Elaeis guineensis)基因组中鉴定出15个EgGRF基因家族成员,并对其理化性质、染色体定位、基因结构、保守功能域、进化关系、启动子顺式作用元件、组织表达模式和果肉不同时期表达模式进行分析。结果表明:EgGRF基因家族成员编码的肽链平均为409个氨基酸,分子量为27.62~65.51 kDa,等电点为6.24~9.38,蛋白不稳定指数为47.24~68.37,脂溶指数为47.52~67.69,总平均亲水性为–0.945~–0.400。EgGRF基因家族成员含有3~5个外显子,均含有特征结构域QLQ(Gln、Leu、Gln)和WRC(Trp、Arg、Cys),基于系统进化关系将EgGRF家族分为5个亚族,油棕EgGRF的亲缘性与拟南芥较近。启动子上鉴定出大量植物激素响应、逆境胁迫响应、光响应和分生组织特异表达顺式作用元件。不同组织的转录组数据分析结果表明,EgGRF基因家族在茎尖和花中表达量较高,8个EgGRF在果肉的不同时期特异表达。本研究为进一步探索EgGRF调控油棕生长发育过程的机制奠定基础。
- 金龙飞尹欣幸曹红星
- 关键词：油棕生物信息学基因表达
- 椰子CESA基因家族鉴定及生物信息学分析
- 2024年
- 中国加工椰糠与椰壳纤维所需的椰衣、椰壳主要从国外进口,国内原材料供给不足,市场潜力巨大,因此培育椰子高品质深加工新品种具有重要意义。本研究利用已发表的椰子基因组数据,共鉴定出10个椰子CESA基因家族成员并对其进行了基因结构分析、蛋白理化性质分析、亚细胞定位预测、蛋白质保守结构域预测、超二级结构预测分析、三级结构同源建模、蛋白跨膜螺旋预测、系统进化树构建及表达谱分析。蛋白理化性质与亚细胞定位分析显示,椰子CESA成员蛋白多为酸性蛋白,且主要定位于细胞质膜上。进化分析显示,椰子CESA基因家族成员可分为5组,组内基因同源性较高,组间差异较小,所有家族成员均含有N端锌指结构域和纤维素合酶结构域,基因结构相似。聚类及表达谱分析显示,CoCESA3、CoCESA4、CoCESA6、CoCESA8与已报道的拟南芥、水稻初生细胞壁合成相关CESA基因聚类在一起,并在成熟叶片、幼叶、胚、胚乳和愈伤组织中都有较高的表达量,其可能参与了初生细胞壁合成且在整个植物生长发育过程中发挥作用。本研究鉴定了10个椰子CESA基因家族成员并对其进行了生物信息学分析,为椰子CESA基因家族功能的进一步研究提供基础,并为高质量深加工椰子新品种的分子育种提供候选基因。
- 孙熹微杨耀东弓淑芳王永肖勇
- 关键词：生物信息学
- 椰子抗寒相关生理生化指标筛选及评价被引量：6
- 2016年
- 以2年生海南高种椰子、红矮椰子和香水椰子3个椰子品种的幼苗为材料,根据温度的日变化规律,设置不同的低温度处理,分别为CK(自然温度处理)、16℃(T1处理)、12℃(T2处理)、8℃(T3处理),利用相关性分析、聚类分析和主成分分析法研究了低温胁迫下椰子叶片MDA含量、可溶性糖含量、可溶性蛋白质含量、游离脯氨酸含量、超氧化物歧化酶(SOD)活性、过氧化物酶(POD)活性、过氧化氢酶(CAT)活性和抗坏血酸过氧化物酶(APX)活性的变化,对抗寒密切相关的生理生化指标进行筛选,对不同椰子品种的抗寒性进行评价。结果表明:根据不同品种抗寒性相关生理生化指标变化幅度的不同,抗寒性强弱依次为海南高种椰子>红矮椰子>香水椰子。脯氨酸含量和POD活性与其他指标相关性高,不同低温处理间差异较大,可以聚为不同类分别代表渗透调节物质和保护酶类的指标,主成分分析结果表明,这2个指标可反映其他指标信息,可作为椰子抗寒鉴定指标。
- 曹红星雷新涛刘艳菊孙程旭张如莲
- 关键词：低温胁迫椰子生理生化指标
- 不同果皮处理方法对椰果发芽及幼苗生长的影响被引量：4
- 2011年
- 采用5种不同的果皮处理方法对椰果进行处理,研究不同果皮处理方法对椰子种果发芽率、成苗率、发芽时间和幼苗生长发育的影响。结果表明,果皮对发芽率影响不显著,对发芽时间和幼苗的生长发育有阻碍作用,但有利于提高成苗率。认为去除大部分外、中果皮的同时保留一定量的中果皮是最佳种果育苗的果皮处理方法。
- 李杰周焕起黄丽云冯美利唐龙祥
- 关键词：果皮成苗率
- 椰子保守microRNA预测和特征分析被引量：2
- 2014年
- 根据释放的椰子转录组序列和miRBase数据库中的microRNA （miRNA）序列信息,分析椰子中保守miRNA及其相应靶基因的特征.根据miRBase数据库中植物miRNA序列,共预测了41个miRNA,分别属于22个miRNA家族.这些miRNA家族中13个家族在植物中非常保守,miRBase至少在19个物种中检测到,而miR902、miR2673和miR414这3个家族不保守,仅在1～2个物种中检测到.这些预测的miRNA的成熟序列长度大多为21个碱基（59.5％）,而前体序列的长度大多为50～100个碱基（61.9％）.分析miR396家族前体序列时发现,成熟miRNA和成熟miRNA＊（成熟miRNA形成发卡结构互补的序列）序列很保守,但是中间的序列变异很大.此外,预测miRNA的靶基因发现保守的miRNA家族的靶基因为一些重要的转录因子家族,与植物的生长发育相关,而不太保守的miRNA家族的靶基因编码与表型控制相关的蛋白.
- 夏薇李静周丽霞杨耀东肖勇马子龙
- 关键词：椰子靶基因
