西北农林科技大学农学院陕西省农业分子生物学重点实验室
- 作品数：4 被引量：38H指数：4
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- 苦荞和甜荞查尔酮合成酶基因的克隆及序列比较被引量：16
- 2008年
- 以苦荞品种‘西农9920’和甜荞品种‘西农9976’为材料,根据其它植物查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)基因DNA序列的保守区域设计的一对简并引物,进行PCR扩增,从2种荞麦基因组中克隆出了长度均为860 bp的CHS基因片段,对其进行回收、克隆,挑选阳性克隆测序;序列分析表明这2个片段含有CHS基因的N端和C端的结构域,分别为苦荞和甜荞的CHS基因片段,命名为FtCHS和FeCHS。对获得的2种荞麦CHS基因的DNA序列进行比较分析,发现两者间存在多达43处单碱基多态性,这些单碱基多态性可能是苦荞和甜荞种子中类黄酮含量差异的重要原因之一。苦荞和甜荞CHS与其它植物CHS的氨基酸序列的进化分析表明,其与同为蓼科的掌叶大黄和石竹科的满天星的同源性较近。
- 张艳柴岩冯佰利胡银岗
- 关键词：苦荞甜荞查尔酮合成酶基因克隆
- 小麦种质N9436抗白粉病的特异基因表达谱分析被引量：5
- 2008年
- 为了解白粉菌诱导下抗白粉病小麦的抗病机制,构建了白粉菌接种初期小麦抗性种质N9436的抑制性消减杂交文库。从文库中随机挑取140个阳性克隆,测序结果表明,冗余重复序列占32.86%,其中谷胱甘肽转移酶表达频率最高,其次为参与能量代谢的二磷酸核酮糖大小亚基。去除冗余序列和重复序列后,得到94条EST,利用NCBI的BLAST在线序列比对工具对GenBank的核酸和蛋白质数据库进行同源性比对和功能分析。BlastX比对结果表明,有49条EST与已知功能蛋白同源性较高,主要涉及抗病与防御(包括生物及非生物胁迫)、能量代谢、细胞结构、蛋白质合成及加工、转运及信号转导等过程的相关蛋白。BlastN比对NCBI的非冗余核酸数据库,其中69条序列与EST数据库中的Unigene具有较高的同源性,20条与EST数据库中的同源性较高,另外5条序列找不到同源序列。通过对核酸和蛋白质同源性的比较和功能分析发现,比对结果一致的序列有33条,涉及白粉病抗性的相关蛋白22个,其中与抗病信号传导相关的蛋白6个,过敏性坏死反应(HR)体系表达蛋白2个,系统获得性抗性(SAR)体系病程相关蛋白4个,SAR体系诱导防卫蛋白10个。
- 吴金华胡银岗张宏王长有王秋英吉万全
- 关键词：小麦白粉病抑制性消减杂交表达序列标签
- 小麦抗白粉病SSH-cDNA文库中差异基因的表达模式被引量：8
- 2008年
- 为了解白粉菌诱导下抗白粉病小麦的抗病机制,构建了白粉菌接种初期的抑制性消减杂交cDNA(SSH-cDNA)文库。从中随机挑取140个阳性克隆进行测序,去除冗余序列和重复序列后,得到94条EST,利用NCBI的BLAST在线序列比对工具对GenBank的蛋白质数据库进行同源性比对及功能分类。结果表明,49个EST与已知功能蛋白同源性较高,主要涉及初级代谢(2%)、能量代谢(24%)、细胞结构(2%)、转录(2%)、蛋白质合成加工与储藏(16%)、转运(4%)、信号转导(4%)和抗病与防御(30%)。经文库比较,筛选出与病程相关蛋白基因同源的EST(Z25-1)和与谷胱甘肽硫转移酶同源的EST(Z440-1),GenBank登录号为EX567369和EX567360。以其EST序列为依据设计引物,通过RT-PCR分析它们在白粉菌诱导下的表达模式,结果该2基因表达存在明显差异。其中,Z25-1在未接种白粉菌时具有一定的表达量,白粉菌侵染后表达量开始上升,侵染72h时表达量最高,然后下降;Z440-1在未接种时也具有一定的表达量,但在接种初期表达微弱,甚至不表达,24h后表达开始上升,到72h时达最高,然后下降。本研究表明,病程相关蛋白和谷胱甘肽硫转移酶属于诱导型表达基因,且参与白粉病抗病反应,在白粉菌诱导72h时表达量最高。
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- 关键词：小麦白粉病
