深圳市华大农业应用研究院 作品数:73 被引量:41 H指数:4 相关机构: 深圳华大生命科学研究院 深圳华大三生园科技有限公司 中国农业科学院深圳生物育种创新研究院 更多>> 发文基金: 深圳市科技计划项目 国家科技支撑计划 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 轻工技术与工程 医药卫生 生物学 更多>>
与山羊角型相关的核酸分子及其应用 提出了一种山羊角型相关的核酸分子,与山羊基因组1号染色体相比,所述核酸分子在g.129424780bp位点存在插入突变,插入突变的核酸片段为山羊基因组1号染色体g.150334286‑150818095bp区域至少一部分... 杨漫漫 李勇 魏强 苗泽圃 王然CRISPR/Cas9介导人HBB基因突变体在猪成纤维细胞的靶向敲入 被引量:2 2020年 目的将人地贫相关基因HBB(hHBB)的高频突变体基因型Condons41/42(-CTTT)靶向敲入猪成纤维细胞,并筛选出基因型阳性的纯合子细胞系。方法(1)合成人地贫相关基因HBB(hHBB)突变体,并构建猪HBB位点两条同源臂载体。(2)利用infusion技术将hHBB突变体插入两个同源臂之间,构建同源重组终载体。(3)用在线软件http://crispr.mit.edu/设计靶向猪HBB的sgRNA,并在猪PK15细胞中验证其活性。(4)利用电转染法把CRISPR/Cas9、sgRNA和目的载体共同转入巴马猪胎儿成纤维细胞中,筛选单细胞克隆。结果(1)合成了hHBB突变体,从野生型巴马猪基因组上扩增左同源臂(1.062×103)以及右同源臂(1.024×103),并将三者连接到终载体pGH-LA-hHBB-RA。(2)设计合成了11条靶向猪HBB基因的sgRNA,全部验证活性后最终挑选#2sgRNA和#11sgRNA用于后续实验。(3)通过CRISPR系统共制备出15株有hHBB突变体定点敲入的猪成纤维细胞系,其中6株细胞正常表达hHBB基因。结论本研究所制备的携带人源化HBB基因突变体的猪成纤维细胞,将为创制高度模拟人地贫的模型猪奠定基础。 张婷婷 杨漫漫 魏强 李燕莉 李林 王然 胡莉花 姜芳芳 刘瑜 赵卫华 李勇关键词:地中海贫血 同源重组 成纤维细胞 与三七总根重紧密连锁的SNP分子标记及其应用 本发明公开了一种与三七总根重紧密连锁的SNP分子标记及其应用。本发明提供了三七基因组中如下SNP位点或用于检测三七基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质在鉴定或辅助鉴定待测三七的总根重性状中的应用;所述SNP位点为... 张耕耘 夏秋菊 倪雪梅 董笑 张喆 雷雪静 段肖霞 程乐 杨金龙 谢长伟 魏福刚 余育启文献传递 一种与猪初生重性状相关的SNP标记及应用 本申请公开了一种与猪初生重性状相关的SNP标记及应用。本申请与猪初生重性状相关的SNP标记,位于猪国际基因组11.1版本参考序列的第4号染色体上第112031589核苷酸位点,具有G或A多态性。本申请与猪初生重性状相关的... 王然 杨漫漫 魏强文献传递 CRISPR/Cas9技术介导猪基因组单碱基编辑效率的研究 被引量:1 2020年 利用国际上最新的两种基于CRISPR/Cas9的BE3(Cytosine base editor,CBE)和ABE7.10(Adenine base editor,ABE)单碱基修饰技术对猪基因组靶基因位点进行编辑效率的分析研究。设计、合成并构建4个猪基因组靶基因位点gRNA表达载体,分别与CBE或ABE共转染PK15细胞,继续培养48 h,结合二代测序技术测定单碱基替换效率和indels发生率。结果表明,单碱基编辑系统BE3和ABE7.10对猪基因组靶位点碱基修饰的活性编辑窗口主要分别为5个核苷酸和4个核苷酸;两套单碱基编辑系统主要对编辑窗口内的目标碱基进行单碱基转换而非indel;两套单碱基编辑系统对猪基因组碱基置换有一定偏好性,其中CMAH、MC1R(1-2)、MC1R(2-1)基因编辑窗口内C→T的效率分别为2.2%、0.4%和1.3%;猪GGTA、MSTN-2窗口内A→G的效率分别为1.4%、1.4%。表明单碱基编辑系统BE3和ABE7.10均能够对猪细胞的基因组靶位点序列进行有效的单碱基置换。 张婷婷 陈涛 李燕莉 杨漫漫 魏强 王然 李林 李勇分子标记及其应用 本发明公开了分子标记及其应用。其中,该分子标记表现为SEQ ID NO:3所示核苷酸序列的插入/缺失长度多态性。本发明的分子标记与水稻的拒镉性状紧密相关,能够有效用于水稻拒镉性状基因定位、水稻拒镉性状检测以及水稻的分子标... 张耕耘 倪雪梅 侯军亮响应面法优化乳酸片球菌冻干保护剂配方 被引量:2 2018年 添加冻干保护剂能有效提高微生物冻干存活率。为了提高乳酸片球菌冻干存活率,采用Plackett Burman实验设计与最陡爬坡实验结合响应面法,研究了不同冻干保护剂对冻干存活率的影响。结果表明,海藻糖、甘露醇、硫酸锰浓度对菌体存活率影响显著,海藻糖与甘露醇交互作用显著,海藻糖与硫酸锰,甘露醇与硫酸锰交互作用不显著。最佳保护剂配方:海藻糖浓度为73.64 g/L,甘露醇浓度为43.76 g/L,硫酸锰浓度为1.91 g/L,冻干存活率为98.10%±1.03%。实验结果为益生菌生产提供了技术支持。 周小兵 林路英 彭灿 何小芬 李卉 苏敦关键词:乳酸片球菌 冻干保护剂 存活率 响应面法 水稻冷不回生性状相关的分子标记及其应用 本发明提出了一种水稻冷不回生性状相关的分子标记。该分子标记为靠近水稻6号染色体6718941‑6799600区间位置的核苷酸序列。发明人发现靠近所定位的冷不回生基因区段的核苷酸序列表现为插入/缺失长度多态性。发明人将靠近... 李泽桦 侯军亮 李刚 喻涵 蔡伟 杜国华 崔巨多 常锋 邹洪锋预测玉米含油率的试剂、试剂盒及方法 本发明涉及一种预测玉米含油率的试剂、试剂盒及方法。该试剂包括检测玉米基因组8号染色体上的SNP位点的试剂,所述SNP位点与玉米LOC103634724基因紧密连锁,所述玉米基因组以B73V5b+为参考基因组。玉米基因组8... 吴艳红 倪雪梅 谈聪 刘欢分子标记及RAD测序辅助选择改造两系不育系水稻粒型 被引量:3 2019年 长粒型稻米具有垩白度低,直链淀粉含量高,蒸煮后坚韧蓬松的优点。为了改良水稻粒型,本研究以‘R15’为长粒型基因供体材料,‘Y58S’光温敏两系不育系作为轮回亲本进行改良,开发出了与控制粒型的qGL7紧密连锁的分子标记R072774。利用该分子标记在每一代选出含有长粒型基因的株系进行建库测序,利用RAD重测序数据进行基因组选择,选择含有长粒型基因且基因组背景最接近轮回亲本‘Y58S’的个体。从F2代开始进行回交,经过4代回交和1代自交,F2代及回交后代与‘Y58S’遗传背景平均相似率为F2(37.07%) 侯军亮 席杏媛 李世明 李泽桦 李刚 伏琦 李云飞 鄢阳天 杨麒生 喻涵 夏秋菊 刘宝龙 李勇 张耕耘 赵山岑 倪雪梅关键词:分子标记辅助选择