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东北农业大学动物科学技术学院农业部鸡遗传育种重点实验室: 作品数：22 被引量：124H指数：6; 相关作者：王海霞李敏乔书培史铭欣周纬男更多>>; 相关机构：石河子大学医学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>; 相关领域：农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>

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石河子大学医学院

鸡mir-17-92基因簇的结构、功能及其调控被引量：6: 2012年; mir-17-92基因簇(mir-17-92cluster)是脊椎动物的一个保守miRNA基因簇,在哺乳动物细胞增殖、分化、凋亡及发育等多种生物学过程中起重要的调控作用。同时,mir-17-92基因簇又是一个癌基因,在多种肿瘤中表达。尽管对mir-17-92基因簇的研究非常广泛,但其作用机制还不完全清楚。鸡mir-17-92基因簇的结构组成特点、功能及其作用机制尚未见研究报道。该文根据同一miRNA基因簇的miRNAs在功能上相关的特点,以鸡mir-17-92基因簇序列为研究对象,采用生物信息学研究方法和手段,开展了鸡mir-17-92基因簇的基因组结构、miRNAs序列组成、靶生物学过程和信号通路以及miRNAs结合位点分布特点等分析研究。结果发现,鸡mir-17-92基因簇调控MAPK、Wnt和TGF-β等多个重要细胞信号通路;miRNA结合位点分布分析显示,该miRNA基因簇多个成员共同作用于同一个靶基因,提示该基因簇的miRNAs成员以组合和协同的方式调控靶基因。该研究为深入了解mir-17-92基因簇如何调控癌症和发育中的关键细胞过程奠定了基础。; 闫晓红王志鹏王宁; 关键词：细胞信号通路

鸡Perilipin1基因启动子的克隆及分析被引量：4: 2016年; 旨在研究鸡脂滴包被蛋白基因(Perilipin1,Plin)启动子的结构及特征。本研究采用PCR方法扩增了鸡Perilipin1基因5′侧翼区约2kb的DNA片段,并对其进行了克隆、测序及生物信息学分析;同时,构建了其全长及系列截短突变的报告基因表达载体,瞬时转染鸡胚成纤维细胞系(DF-1),用双荧光素酶报告基因系统测定了荧光素酶活性,确定了该基因的核心启动子区域。生物信息学分析结果表明,鸡Perilipin1基因的启动子区不存在典型的TATA box结构和CpG岛,但可能存在TFIID、Sp1、AP2、PPAR、RXR、SREBP1、C/EBP、GATA、ER、KLF5等多个转录因子结合位点;报告基因分析结果表明,本研究克隆的鸡Perilipin1基因启动子能够极显著地启动报告基因的表达(P<0.01),并且随着启动子片段由5′端逐渐截短,报告基因活性表现出逐渐增强的趋势,其中-360/-11片段具有最强的报告基因活性。综上表明,鸡Perilipin1基因-360/-11区域的启动子片段具有最强的转录活性,包含该基因的核心启动子序列。; 周纬男史铭欣乔书培史洪岩王宇祥; 关键词：启动子克隆

鸡HOPX基因的克隆及表达分析被引量：1: 2012年; 前期研究发现,HOPX基因在鸡脂肪组织高表达,为了解该基因在脂肪发育过程中的作用,采用RT-PCR方法,扩增和克隆鸡HOPX基因全长CDS区,并进行序列分析;采用real-time RT-PCR和半定量RT-PCR的方法,开展了HOPX基因的组织表达谱分析、HOPX基因在东北农业大学肉鸡高、低脂双向选择品系脂肪组织发育过程中的表达差异分析以及鸡脂肪细胞分化过程中的表达分析。研究结果显示,鸡HOPX基因的全长CDS区为222 bp,编码73个氨基酸。HOPX基因在鸡的多种组织中表达,其中,在脂肪组织中的表达量最高;在高、低脂系肉鸡的脂肪组织生长发育过程中,HOPX基因的表达均随年龄增长而上升,且高脂系鸡HOPX基因的表达量高于低脂系;在鸡脂肪细胞分化过程中,HOPX基因的表达呈上升趋势。HOPX基因的表达分析结果提示,该基因在鸡脂肪组织生长发育过程中发挥作用。; 张坤张志威王维世闫晓红李辉王宁; 关键词：克隆基因表达脂肪组织

肉鸡腹脂双向选择系中RNA编辑位点的鉴定研究被引量：5: 2017年; 旨在准确获得肉鸡腹脂双向选择系脂肪组织中的RNA编辑位点信息,进而为脂肪相关研究提供更多的信息来源。本研究以东北农业大学肉鸡高、低腹脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,使用转录组测序(RNA-seq)和基因组测序数据识别肉鸡腹部脂肪组织RNA编辑位点。通过生物信息学手段,设定严格的数据过滤与筛选策略,构建RNA编辑位点候选集。结果表明,在候选集中,通过对RNA编辑位点的分类和注释,在低脂系肉鸡脂肪组织中发掘转换型RNA编辑位点28个,颠换型RNA编辑位点101个,插入缺失型RNA编辑位点71个;在高脂系肉鸡脂肪组织中,发掘转换型RNA编辑位点30个,颠换型RNA编辑位点84个,插入缺失型RNA编辑位点77个。绝大多数RNA编辑位点落在内含子、基因间区域及基因上游区域(内含子区41.91%,基因间区域33.08%,基因下游20.59%,基因上游2.94%和外显子区1.47%)。试验验证了4个候选RNA编辑位点,其中3个位点落在与脂肪形成有重要关系的ATP1B3、SLC6A6和FLNB基因区域。本研究鉴定和验证了存在于肉鸡脂肪组织中的RNA编辑位点,为进一步研究RNA编辑影响脂肪组织生长发育的分子机制奠定了基础。; 梁浩李敏董翔宇李辉杜志强; 关键词：肉鸡脂肪组织 RNA编辑

鸡FABPFABP2基因单倍型与生长和体组成性状的相关分析被引量：5: 2016年; 为探讨鸡FABP2基因多态性对肉鸡生长和体组成性状的影响,以东北农业大学F2资源群体为试验材料,对鸡FABP2基因3个多态性位点（c.601A＞T,c.1018C＞T和c.3267G＞A）利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）方法进行基因型分析,利用3个多态性位点基因型信息构建单倍型并分析单倍型与鸡生长和体组成性状的相关性.结果：FABP2基因3个多态性位点构建的单倍型对鸡2～12周龄体重、龙骨长和4周龄跖骨长有显著影响（P＜0.05）;对8和10周龄跖骨长、跖骨围、胸宽、腹脂率、胫骨长有一定的影响（P＜0.2）.由此推断：影响鸡体重和骨骼性状的QTL可能位于此单倍型区域内,ACG单倍型为提高体重和骨骼性状的有利单倍型.; 徐松松安荣荣陈耀峰程敏李辉王守志; 关键词：单倍型体重骨骼

绵羊Dlx3基因启动子活性及其多态性与羊毛品质性状的关联被引量：5: 2013年; 【目的】通过开展绵羊Dlx3基因启动子结构、活性、多态性及其与羊毛品质性状的关联等分析,揭示Dlx3基因在绵羊毛囊发育中的作用及其作用机制。【方法】采用PCR扩增Dlx3基因起始密码子上游1.5 kb区域,利用荧光素酶报告基因技术分析Dlx3基因启动子活性,采用测序方法寻找Dlx3基因启动子区SNP,并利用PCR-RFLP技术进行SNP分型。【结果】①Dlx3基因启动子近端序列的保守性较高,该区域内人、鼠及绵羊都具有23个保守的转录因子结合位点和一个CpG岛,而启动子的远端序列的保守性较低;②Dlx3基因的启动子在绵羊胚胎成纤维细胞中具有启动子活性;③Dlx3基因启动子的-1 551—-1 108 bp与-1 108—-707 bp区域对启动子活性影响较大;④Dlx3基因启动子区SNP位点(G-1166A)多态性与羊毛卷曲度显著相关。【结论】①Dlx3基因启动子在绵羊胚胎成纤维细胞中有活性;②Dlx3基因启动子的近端序列组成在人、鼠和绵羊中较为保守,而其远端序列的保守性较低,但是Dlx3基因启动子的远端序列对启动子活性影响较大;③Dlx3基因启动子区G-1166A位点是羊毛卷曲度的一个分子标记。; 裴文宇云杰荣恩光杨华王志鹏王守志李辉王宁; 关键词：绵羊启动子活性单核苷酸多态性

鸡PPARγ基因的表达特性及其对脂肪细胞增殖分化的影响被引量：37: 2012年; 为分析鸡PPARγ基因的组织表达特性及其在脂肪细胞增殖和分化过程中的功能,文章以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系肉鸡为实验材料,利用Western blotting方法,检测PPARγ基因的组织表达特性及其在高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织间的表达差异;采用RNAi技术,在鸡原代脂肪细胞中抑制PPARγ基因的表达后,通过MTT和油红O提取比色的方法,研究鸡PPARγ基因对脂肪细胞增殖和分化的调控作用;利用Real-timePCR和Western blotting技术,分析PPARγ基因表达下调后,其他脂肪细胞分化转录因子以及与脂肪细胞分化相关的重要基因的表达变化情况。结果表明,PPARγ基因在7周龄高脂系肉鸡腹部脂肪组织、肌胃、脾脏、肾脏组织中表达量较高,在心脏中表达量较低,在肝脏、胸肌、腿肌、十二指肠中未检测到表达信号;与高脂系相比,PPARγ基因在5和7周龄低脂系肉鸡腹部脂肪组织中的表达量较低(P<0.05);PPARγ基因的表达量下降后,鸡脂肪细胞的增殖能力增强,分化能力减弱;同时,C/EBPα、SREBP1、A-FABP、Perilipin1、LPL、IGFBP-2基因的表达量均下降(P<0.05)。由此可见,PPARγ基因的表达可能与肉鸡腹部脂肪的沉积有一定的关系,该基因可能是调控鸡脂肪细胞增殖与分化的关键因子。; 王丽那威王宇祥王彦博王宁王启贵李玉茂李辉; 关键词：PPARΓ基因 RNAI

动物转录因子相关数据库研究进展被引量：2: 2014年; 转录因子是真核生物中调控基因转录的一类重要的反式作用因子。目前,对动物群体的转录因子已经开展了较为深入的研究,科研人员不仅通过实验证实而且利用生物信息技术预测了全基因组范围内的转录因子,并基于上述数据构建了多个专用的二级数据库。概述了8个应用于动物群体的转录因子数据库,以期为进一步探明转录因子调控动物相关基因转录的分子机制提供理论基础。; 王志鹏郭媛媛梁美景; 关键词：转录因子真核细胞数据库生物信息

DNA与蛋白质的相互作用及其生物学研究方法被引量：2: 2018年; DNA和蛋白质是构成生物体最为重要的两类生物大分子,两者特异性或非特异性识别及相互作用在整个基因组表达调控过程中发挥着重要的作用,是了解生命活动基本过程的分子基础。为此,从DNA与蛋白质相互作用的概述及其作用形式入手,对目前应用较多的几种分子生物学检测方法,如电泳迁移率变动分析(EMSA)、DNase I足迹法(DNase I footprinting)、酵母单杂交技术(Y1H)以及染色质免疫沉淀技术(Ch IP)的原理、优缺点、优化方法及其最新应用等进行了综述。; 孙宇航王宇祥; 关键词：DNA 蛋白质相互作用

人乳头瘤病毒癌基因诱导细胞永生化的研究进展被引量：5: 2012年; 永生化细胞是研究细胞增殖、分化、凋亡及衰老等的理想细胞模型。目前人类已建立多种细胞永生的方法,其中人乳头瘤病毒(HPV)癌基因(E6和E7)被广泛用于永生化细胞研究。E6蛋白和E7蛋白主要通过灭活p53通路和pRb通路,从多个水平提高端粒酶的表达和活性,使细胞逃过细胞复制衰老而继续增殖,实现细胞永生化。综述人乳头瘤病毒癌基因E6和E7的最新研究进展,探讨未来研究的趋势和研究方向。; 王珊珊王伟于莹莹李辉王宁; 关键词：E6基因 E7基因

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