南方医科大学公共卫生学院环境卫生学系
- 作品数：4 被引量：59H指数：3
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- 各地区炎症性肠病患者肠道菌群特征观察性研究被引量：8
- 2018年
- 目的识别不同地区炎症性肠病（IBD）患者肠道菌群生物标志物，建立预测模型，并探索其菌群功能变化特征。方法收集中国、美国（RISK）、美国（PRISM）、德国、印度和立陶宛6个队列1 510例IBD患者和496名健康对照（HC）16 srRNA基因序列。使用微生物组分析软件QIIME（v1.9.1）分析肠道菌群组成和多样性指标，使用微生物多样性分析软件LEfSe比较IBD患者与健康对照有统计学差异的肠菌标志物。随机森林法建立预测模型。PICRUSt预测菌群功能变化特征。结果IBD患者肠道菌群α多样性显著低于HC（Wilcoxon秩和检验，P〈0.05）。中国、美国（RISK）、美国（PRISM）、立陶宛和德国队列IBD患者肠道菌群和HC菌差异具有统计学意义（Adonis，P〈0.05），而印度队列未发现统计学差异。LEfSe分析显示，中国和美国（RISK）队列IBD患者肠道菌群变化较为一致，而德国、立陶宛和印度IBD患者肠道菌群变化具有较强的本地化特征。肠球菌属（Enterococcus）在中国、美国（RISK）和德国队列IBD患者中显著增加，肠杆菌科（Enterobacteriaceae）在中国和美国（RISK）队列IBD患者肠道显著增加，瘤胃球菌属（Ruminococcus）在中国、美国（RISK）、美国（PRISM）和印度队列IBD患者肠道中显著减少。各国队列分别建模预测当地人群，受试者工作特征（ROC）曲线下面积（AUC）为（86.48±4.91）%。以其中任一队列模型预测其他队列，中国、美国（RISK）和美国（PRISM）相互间预测AUC较高，其他两者间预测AUC较低。全样本整体建模预测中国、美国（RISK）、美国（PRISM）、德国、立陶宛和印度队列，AUC依次为90.1%、82.3%、79.6%、61.9%、65.5%和54.2%。功能分析显示，中国、美国（RISK）、美国（PRISM）和印度队列IBD患者肠道菌群谷胱甘肽代谢水平明显升高，醌类在中国、美国（RISK）、美国（PRISM）和印度队列IBD
- 王忠伟何彦曾念宜唐文丽周宏伟
- 关键词：炎性肠疾病生态失调氧化性应激
- 人体肠道细菌的培养组学研究进展被引量：5
- 2020年
- 人体微生物组学研究显示肠道细菌与健康关系极为密切。人体肠道丰富多样的细菌构成了肠道细菌组,是人体微生物组数量最多的部分。研究肠道细菌时使用较多的是宏基因组学方法,但技术本身存在“深度偏差”等缺点亟待解决。肠道细菌的培养组学是近年来的一个研究热点,该方法可以在一定程度上减小宏基因组学带来的误差,培养条件的多样化亦可帮助研究者找到目标菌种相对适宜的生长条件,极大提高培养效率等。还综述了近些年国内外人体肠道细菌培养组研究的最新进展,分别从人体肠道细菌的组成特征、肠道细菌培养组学的研究成果,培养组学的不足等方面进行了论述,探讨了肠道细菌的培养组学在人体疾病防治领域应用的可行性。虽然作为一个新兴的研究思路,培养组学还存在很多不够成熟的方面,但不可否认的是它的发展前景十分可观。培养组学和其他研究方法的互补或许会成为下一个研究微生物的突破口。
- 牛尚博蔡嘉裕韦金涛黄嘉伟方舒婷吴继国张国霞
- 生活方式对60岁及以上老年女性健康状态的影响被引量：2
- 2017年
- 目的探讨生活方式对60岁及以上老年女性健康状态的影响。方法采用中国老年人口健康状况调查问卷,了解8 476名老年女性的生活方式,并对其健康情况进行评估。结果饮食及心理因素明显影响老年女性的健康情况,通过等级回归分析获得概率模型,可用于预测老年女性健康情况(非常好,好,一般和差)的发生概率。结论老年女性调整饮食结构和生活态度可提高其健康水平,老年女性生活方式可预测其健康状态。
- 关颖尹瑞杰张国霞
- 关键词：饮食结构
- 高危型人乳头状瘤病毒感染与阴道菌群的相关性研究被引量：44
- 2016年
- 目的探索高危型人乳头瘤状病毒(high-risk human papillomavirus,HR-HPV)感染阴性与阳性女性之间阴道菌群构成的差异。方法采集2014年9月至2015年9月间于我科就诊的33例未感染HR-HPV(HPV^-)女性及98例感染HR-HPV(HPV^+)患者的阴道分泌物,分别对每个样本进行细菌总基因组DNA提取、16S rRNA V4区基因扩增及采用Illumina高通量测序技术对扩增的PCR产物进行测序等步骤,然后通过BIPES、TSC、GAST等程序,分析阴道菌群物种丰度和结构,并对两组女性的阴道菌群构成进行比较。结果 HPV^-组女性阴道菌群以乳酸杆菌为优势菌属,占81.54%,同时含有少量的加德纳菌属、链球菌属、普氏菌属等。HPV^+组患者阴道菌群中乳酸杆菌属则显著减少(40.48%),加德纳菌属显著增加(32.35%),同时普氏菌属、奇异菌属、厌氧球菌属等多种厌氧菌属相对丰度也有所增加。在HPV^+组女性的阴道菌群中发现布鲁菌属的存在,而HPV^-组中未见此菌属。结论阴道菌群失调与HR-HPV感染之间存在相关性,HR-HPV感染者阴道菌群中乳酸杆菌属显著减少,加德纳菌属等多种厌氧菌属过度增殖,并发现有布鲁菌属存在。
- 潘颖盛华芳康玲马啸郑慧敏周宏伟刘木彪
- 关键词：人乳头状瘤病毒阴道菌群高通量测序
