重庆大学医学院 作品数:80 被引量:167 H指数:5 相关作者: 李金 王运良 魏光辉 何大维 孙劲松 更多>> 相关机构: 川北医学院医学影像学院 北京大学公共卫生学院 北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 重庆市自然科学基金 中央高校基本科研业务费专项资金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 文化科学 理学 更多>>
金属有机框架纳米酶在临床检测中的应用 2023年 酶作为天然的生物催化剂,在生物化学反应中发挥着重要的作用。由于天然酶受限其固有的缺点(稳定性低、成本高、储存困难等),具有催化活性的人工模拟酶应运而生。近年来,随着纳米材料迅速发展,仿酶催化纳米材料(纳米酶)逐渐受到研究者们的关注。纳米酶是一类具有类似天然酶活性的纳米材料,其制备过程简单、成本较低,有一定环境耐受性。然而大多数纳米酶类酶活性较低,稳定性相对较差,在生物分析应用中存在诸多困难。其中,金属有机框架(MOF)纳米酶具有高比表面积及孔隙率、活性位点均匀、较强的催化活性及稳定性等性质,且合成简单可控、成本低;此外,较天然酶而言,MOF纳米酶也以其独特的生物化学优势,在临床检测中发挥着巨大应用价值。本文主要基于MOF纳米酶的不同酶活性分类(过氧化物酶、氧化酶、过氧化氢酶、超氧化物歧化酶、水解酶),对其在核酸、蛋白质及小分子三大生物标志物在临床检测中的应用进行概述,并进一步展望了其在临床检测中面临的机遇与挑战,以推动MOF纳米酶的临床应用转化。 罗文浩 袁睿 孙金元 周连群 罗小河 罗阳关键词:核酸检测 蛋白质分析 基于“任务驱动+SPOC”的研究生分子生物学技术课程教学设计与实践 2024年 “新医科”对医学研究生的创新能力培养提出了更高的要求。怎样在实验课中开展创新性教育,培养医学研究生的科研思维,提高其科研素养,完善其自主创新的能力显得至关重要。笔者以我校基础医学和临床医学研究生分子生物学技术实验课程为例,运用“顶层设计”的思想,以“任务驱动”的模式确定任务目标,构建分子生物学技术课程体系,并构建了基于SPOC的线上线下混合教学模式,取得了良好的教学效果。 贺诗雨 冯辉 顾玮关键词:分子生物学技术 课程建设 教学改革 增强子及相关调控组在肠型胃癌中的重塑特征及其预后预测模型 2024年 目的研究组蛋白H3K27ac修饰在肠型胃癌的全基因组分布情况,探讨其增强子及相关调控组重塑特征,建立临床预后评估模型。方法收集于2022年1-12月在我院消化内科就诊患者的15例肠型胃癌组织与18例正常胃黏膜组织进行靶向H3K27ac修饰的染色质靶向捕获(cleavage under targets and tagmentation,CUT&Tag)测序,采用生物信息学分析,比较两种组织H3K27ac修饰在基因组的分布差异;基于H3K27ac修饰分布特征,鉴定增强子元件,探讨增强子及相关调控组的重塑特征;采用单因素Cox和多因素Cox等回归分析方法,构建增强子相关靶基因的预后预测模型。结果两种组织的H3K27ac修饰的基因组分布特征无明显差异,主要位于增强子区域;与正常胃黏膜相比,肠型胃癌增强子H3K27ac修饰的整体水平更高;共鉴定出8847个在肠型胃癌中活性增加的增强子(获得性增强子),占所有增强子的8.3%,其可能促进胃癌细胞增殖、黏附等恶性行为;联合6个获得性增强子相关靶基因(BHLHE41、CEP97、CHI3L2、NR6A1、SUPT3H和TOMM20)构建的预测模型,能够较好地推测患者总体生存期。结论增强子重塑是肠型胃癌显著的表观遗传学特征之一,增强子可能通过上调MYC、E2F3等基因表达促进癌细胞恶性增殖与黏附行为,并基于增强子靶基因构建预后模型。 陈旭 储召乐 秦苾珺 刘碧颖 李先锋 王涛 刘文康 王斌关键词:肠型胃癌 增强子 预后 IVIM-DWI全域直方图参数鉴别孤立性肺结节良恶性的价值 被引量:1 2023年 目的:探讨体素内不相干运动扩散加权成像(IVIM-DWI)全域直方图参数对良、恶性孤立性肺结节(SPN)的鉴别诊断价值。方法:回顾性将CT难以明确诊断而进一步行MRI检查的90例SPN患者纳入研究。根据病理结果将SPN分为良性组(30例)和恶性组(60例)。采用两独立样本t检验(正态分布)或Mann-Whitney U检验(非正态分布)比较良、恶性组的ADC和IVIM-DWI参数(D、D^(*)、f)的全域直方图参数值的差异;采用受试者工作特征(ROC)曲线评估直方图参数的诊断效能并确定最佳阈值,采用DeLong法比较各直方图参数AUC的差异;采用Spearman秩相关检验分析全域直方图参数与恶性SPN的相关性。结果:恶性SPN组的D值和ADC值的多项全域直方图参数(均值、标准差、P10、P90、四分位间距、最大值、中位数、最小值、范围、能量、熵、均匀性和异质性)的测量值均显著低于良性SPN组(P<0.05);且这些直方图参数均与恶性SPN呈负相关(P<0.05)。D和ADC的直方图参数均能有效鉴别SPN的良恶性,且各项直方图参数AUC的差异无统计学意义(P>0.05)。以D值的多项全域直方图参数建立的联合模型预测恶性SPN的效能最高,AUC为0.966、敏感度为88.3%、特异度为96.7%。结论:IVIM-DWI参数中D值的全域直方图参数可有效鉴别良、恶性SPN,且诊断效能优于ADC值的直方图参数,D值多项全域直方图参数构建的联合模型的诊断效能高于单一参数。 向露 秦宇 杨红 曾文兵关键词:孤立性肺结节 直方图分析 基于纸基微流控的核酸分子快速检测技术研究进展 被引量:1 2022年 核酸分子具有丰富的遗传信息,对疾病诊断具有关键价值。传统核酸检测技术受限于耗时长、需大型仪器设备等局限,严重制约了其在大规模、突发性疾病检测中的应用。纸基微流控具有便携、自驱动等优势,在整合等温扩增技术后,为核酸分子快速、准确的检测提供可能。本文从纸基微流控的设计出发,综述纸基微流控在核酸分子检测中的研究进展,分析影响其检测灵敏度、稳定性等的干扰因素,为推动纸基微流控向临床转化提供重要参考。 杨毅 孙金元 陈嘉瑞 杨滨瑞 丁柯 罗阳 张洪关键词:微流控 核酸检测 一起新冠灭活疫苗对接种环境造成气溶胶污染的案例 被引量:1 2021年 由于缺乏预防或治疗新冠肺炎的针对性药物,新冠病毒感染的高发病率和死亡率促进了全球疫苗的快速开发[1]。有序快速推进的新冠疫苗接种,在遏制新冠肺炎大流行方面取得了巨大成功[2]。保留了完整病毒外壳蛋白的灭活疫苗、减毒活疫苗,在接种环节中注射器排空气体,以及安瓿瓶和注射器内疫苗残留物的挥发。 陈利梅 陈晓辉 罗阳 邹静波 韩梅关键词:灭活疫苗 气溶胶 免疫接种 基于概况性综述的药物流行病学研究中时间相关性偏倚识别流程 2024年 目的总结近年来发表的以糖尿病患者为基础人群的药物流行病学研究在设计和分析上的各项特征,梳理出药物流行病学研究中时间相关性偏倚的识别流程。方法系统检索PubMed、Embase、中国知网和万方数据知识服务平台等中英文数据库,发表时间限定为2012年1月1日至2022年9月26日。双人独立筛选文献、提取信息,然后结合各类时间相关性偏倚的产生机制和纳入文献在研究设计、分析方法等方面的特征,构建针对不同种类时间相关性偏倚的识别流程。结果共纳入文献281篇,其中58篇(20.64%)文献明确提及研究关注了哪些时间相关性偏倚。在概况性综述结果的基础上,研究总结归纳了识别时间相关性偏倚的关键问题,涉及数据来源、研究类型、对照类型、对比药物、病程匹配情况、洗脱期设置、诱导期/潜伏期设置、随访起点、暴露时间窗设置、统计分析方法、敏感性分析等设计及分析要素,构成了药物流行病学研究中时间相关性偏倚的识别流程。结论药物流行病学研究中时间相关性偏倚普遍存在且可能对结果产生重要影响。本研究在概况性综述结果的基础上,进一步梳理出了药物流行病学研究中时间相关性偏倚的识别流程,将有利于研究者在开展药物流行病学研究时识别并规避时间相关性偏倚,提高相关证据的可靠性。 邓思危 赵厚宇 詹思延关键词:药物流行病学 基于区域健康数据平台开发新诊断2型糖尿病患者糖尿病视网膜病变发病风险预测模型及其应用 2024年 目的开发新诊断2型糖尿病(T2DM)患者糖尿病视网膜病变(DR)发病风险的预测模型。方法选取2015年1月1日至2022年12月31日宁波市鄞州区域健康信息平台中新诊断T2DM患者为研究对象。使用Lasso-Cox比例风险回归模型筛选预测变量,采用Cox比例风险回归模型构建DR发病风险预测模型。采取Bootstrap 500次重抽样的方法进行内部验证,并使用C指数、受试者工作特征曲线、曲线下面积(AUC)和校准曲线评估模型的性能。结果最终模型纳入的预测变量包括T2DM发病年龄、文化程度、FPG、糖化血红蛋白、尿蛋白、估算肾小球滤过率、脂质调节剂和血管紧张素转化酶抑制剂用药史。最终模型C指数为0.622,校正后C指数均值为0.623(95%CI:0.607~0.634),预测DR 3、5、7年内发病风险的AUC值分别为0.631、0.620、0.624,校准曲线与理想曲线重合度较高。结论本研究构建了简洁且实用的DR发病风险预测模型,为新诊断T2DM患者制定个体化DR筛查和干预方案提供参考。 陈晓薇 刘力嘉 于业贤 章萌 李沛 李沛 孙烨祥 孙宏玉 孙宏玉 孙玉梅 刘学洋 林鸿波 沈鹏 詹思延关键词:糖尿病视网膜病变 队列研究 基于Vgg16-Unet模型的MRI图像下前列腺分区智能分割研究 被引量:1 2023年 目的基于前列腺核磁共振图像(MRI),构建深度学习智能分割模型,展开MRI图像下前列腺分区的智能分割研究。方法收集山西省肿瘤医院2018年1月至2020年10月33例经MRI扫描的前列腺癌患者T2WI本地数据,包括T1期6例,T2期15例,T3期9例,T4期3例。选取荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心提供的前列腺MRI公开数据集中前列腺癌患者的T2WI序列数据,共379例数据,所有数据按照7∶1∶2的比例随机划分为训练集265例、验证集38例和测试集76例。在Unet模型基础上以Vgg16模型为编码器,使用多层卷积层的同时利用迁移学习策略,构建Vgg16-Unet模型,以医师手工勾画和标注的前列腺分区(前纤维基质带、中央带、外周带、移形带)为金标准,在测试集上,采用Dice相似系数(Dice similarity coefficient,DSC)、95%豪斯多夫距离(95%Hausdorff surface Distance,HD95)评估模型对前列腺分区的分割精度。结果模型在测试集上对前纤维基质带、中央带、外周带、移形带实现了较为准确的分割,其平均DSC分别为56.95%、47.28%、80.78%、90.63%,平均HD95分别为20.84、20.02、15.39、11.20 mm。模型智能分割与手工标注测量的体积一致性较好,其差值均位于95%一致性区间内。结论构建的Vgg16-Unet模型分割精度优于Unet、Unet++、ResUnet++3个Unet经典变种网络,能够显著提高前列腺癌MRI图像分割效率,减轻医师工作量。 呼延若曦 吴哲 许杉杉 崔慧林 曹锡梅 马晋锋 马晋锋 吴毅关键词:前列腺肿瘤 核磁共振成像 基于人工智能的影像组学与数字病理学研究在脑胶质瘤诊断中的应用进展 被引量:1 2020年 随着计算效能的指数级增长、大数据时代的到来以及“医工结合”等新学科交叉的兴起,人工智能(AI)在医学领域开启了一个全新的时代。AI可应用于疾病诊断、数据分析、临床决策等方面。脑胶质瘤的精准诊断和病理分级一直以来都是临床工作中的一个难点。本文围绕AI在脑胶质瘤影像诊断与病理分级中的应用、前景与挑战等方面进行综述。 曹勇勇 付饶 吕宏尧 易旻晗 尹宏鹏 吕胜青关键词:脑胶质瘤 人工智能