国家自然科学基金(31000002)
- 作品数:3 被引量:8H指数:2
- 相关作者:谷峻张静苗吴燕玲贾瑞宗陈文新更多>>
- 相关机构:华南师范大学中国农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 山蚂蝗慢生根瘤菌的遗传多样性及系统发育被引量:4
- 2011年
- 【目的】研究我国亚热带和温带地区与山蚂蝗共生的慢生根瘤菌遗传多样性和系统发育。【方法】采用BOX-PCR和多位点基因序列分析(nifH,nodC和recA基因)方法对分离自我国不同地区的29株山蚂蝗慢生根瘤菌进行遗传多样性和系统发育分析。【结果】BOX-PCR分析表明供试的山蚂蝗慢生根瘤菌形成25个基因遗传型,具有丰富的基因组多样性。多位点基因序列分析发现代表菌株位于慢生根瘤菌的3个分支上,分别与埃氏慢生根瘤菌(Bradyrhizobium elkanii),大豆慢生根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum)和圆明慢生根瘤菌(Bradyrhizobium yuanmingense)亲缘关系近。【结论】我国山蚂蝗慢生根瘤菌具有丰富的遗传多样性,共生基因系统发育分析表明它们多与持家基因共同进化,并以垂直进化为主。
- 谷峻张静苗贾瑞宗陈文新
- 关键词:BOX-PCR系统发育
- 广金钱草根瘤菌抗逆性和遗传多样性分析被引量:2
- 2013年
- 分析了14株广金钱草根瘤菌对不同盐度、温度、酸碱度和重金属耐受性,并采用BOX-PCR指纹图谱和recA基因序列分析技术分析其遗传多样性.结果表明,供试菌株对不同盐度和酸碱度表现出相似的耐受性;对不同温度和不同种类的重金属则表现出不同的耐受性,其中4株供试菌株能够耐受4℃的低温.几乎所有供试的广金钱草根瘤菌都能够在含有4 mmol/L的Zn2+、Pb2+和含锌、铅双盐的YMA平板上生长,而仅有2株供试菌株能够在添加4 mmol/L Cu2+的YMA平板上生长.BOX-PCR指纹图谱分析表明,与广金钱草共生的根瘤菌在基因组水平上与已知的埃氏慢生根瘤菌相似,代表菌株的recA基因序列的系统发育分析与BOX-PCR聚类结果基本一致,供试的广金钱草根瘤菌除1株位于根瘤菌属外,其余根瘤菌均为慢生根瘤菌属.
- 谷峻张静苗张碧瑶马杏贤李良冰吴燕玲
- 关键词:抗逆性
- 基于非培养和培养的方法比较花生根瘤菌遗传多样性被引量:2
- 2015年
- 【目的】比较非培养和培养方法揭示的花生根瘤菌遗传多样性差异,以期建立慢生根瘤菌快速检测占瘤率技术。【方法】采用经典分离培养技术获得花生根瘤菌和非培养方法直接从根瘤中收获类菌体分别提取DNA后,比较分析BOX-PCR指纹图谱,根据多样性指数评价基于非培养和培养方法的BOX-PCR指纹图谱技术揭示花生根瘤菌遗传多样性的差异。【结果】基于非培养方法检测的花生根瘤类菌体为81.8%,获得85种遗传群;基于培养方法分离花生根瘤菌菌株为72.7%,获得71种遗传群;两种方法共同检测到17种BOX-PCR遗传图谱相一致。根据多样性指数基于非培养方法反映不同地区花生根瘤菌遗传多样性结果较一致,基于培养方法反映各地区的花生根瘤菌遗传多样性结果存在明显差异。【结论】基于非培养方法检测根瘤类菌体的遗传多样性,能够更快速、真实反映不同土壤花生根瘤中的优势遗传群,快速地统计根瘤菌菌株占瘤率;与培养方法相结合有利于获得花生根瘤菌竞争结瘤能力强的土著菌株,从而为筛选高效根瘤菌菌株奠定基础。
- 陈静瑜冯翊果吴燕玲孟祥飞胡美娟陈文峰谷峻
- 关键词:BOX-PCR