国家自然科学基金(81170797)
- 作品数：8 被引量：12H指数：2
- 相关作者：赵亚萍郭锡熔季晨博史春梅徐广峰更多>>
- 相关机构：中国人民解放军南京医科大学南京医科大学附属南京妇幼保健院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金南京市科技发展计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 生物信息学预测hsa-miR-26b的作用靶标及功能被引量：3
- 2012年
- 目的通过生物信息学预测hsa-miR-26b的靶基因,进一步分析其潜在功能,为其后续功能研究提供理论依据。方法用pubmed、谷歌(google)等工具检索hsa-miR-26b相关文献;用miRbase、NCBI、UCSC Browser和Promoter scan等在线工具分析hsa-miR-26b序列及所在基因组特征;用TargetScan、PicTar及miRanda预测hsa-miR-26b的靶基因;通过功能富集分析(GOanalysis)和信号转导通路富集分析(Pathway analysis),预测所得靶基因和已证实的靶标基因。结果研究证实hsa-miR-26b与神经发育、心肌肥大及各种肿瘤发生、发展有关;hsa-miR-26b位于CTDSP1基因内含子内,但可能具有与该基因不同的启动子;3种方法预测结果取交集获得可能靶标基因33个,合并已知靶标基因14个;hsa-miR-26b靶基因主要参与钠离子转运、溶酶体组织和生物形成、抑制细胞增殖、转运等生物学过程,涉及Notch、氨基糖类代谢、ABC转运子、VEGF及TGF-β等信号转导通路。结论 hsa-miR-26b的功能较为广泛,与发育、代谢等密切相关。
- 徐广峰付海龙史春梅季晨博赵亚萍郭锡熔
- 关键词：微小RNA生物信息学靶基因
- miR-26b过表达对不同时间点人脂肪细胞分泌脂因子的影响被引量：2
- 2013年
- 目的探讨miR-26b过表达在人脂肪细胞分化过程中对各种脂因子分泌的影响。方法以miR-26b过表达病毒感染人脂肪前体细胞并诱导分化;收集不同时间点的细胞培养基上清,采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测各个时间点的脂因子(白介素-6、瘦素、抵抗素、肿瘤坏死因子-α)分泌量。结果与对照组比较,在miR-26b过表达病毒感染的人脂肪前体细胞分化过程中,白介素-6、瘦素分泌量降低,而抵抗素分泌量升高;两组均未检测到肿瘤坏死因子-α。结论 miR-26b在一定程度上可以改善人脂肪细胞炎症状态及改善胰岛素抵抗,为肥胖治疗提供潜在靶点。
- 史春梅徐广峰季晨博陈玲杨蕾庞玲霞赵亚萍郭锡熔
- 关键词：肥胖
- hsa-miR-26b表达沉默对脂肪细胞蛋白分泌的影响被引量：2
- 2014年
- 目的探讨hsa-miR-26b表达沉默对脂肪细胞蛋白分泌的影响。方法将hsa-miR-26b表达沉默组及对照组慢病毒感染人脂肪前体细胞,在诱导分化过程中收集不同时间点的细胞培养基上清液,采用ELISA法检测IL-6和瘦素(leptin)的分泌量。结果在细胞分化过程中,hsa-miR-26b表达沉默组IL-6与leptin表达量均较对照组降低(P<0.01或P<0.05)。结论降低hsa-miR-26b表达在一定程度上可以改善人脂肪细胞炎症状态及胰岛素抵抗,为肥胖治疗提供潜在靶点。
- 杨蕾徐广峰季晨博史春梅陈玲庞玲霞赵亚萍郭锡熔
- 关键词：脂肪细胞肥胖
- 高糖诱导分化对3T3-L1成熟脂肪细胞线粒体形态和功能的影响
- 2012年
- 目的观察高糖诱导分化对3T3-L1成熟脂肪细胞葡萄糖转运以及线粒体功能的影响。方法 3T3-L1前体脂肪细胞分别在含25 mmol/L葡萄糖(高糖组)及5 mmol/L葡萄糖(低糖组)的DMEM培养基中诱导分化。采用油红"O"染色法观察细胞的分化程度,采用液闪仪检测成熟脂肪细胞对[3H]-2-脱氧葡萄糖的摄取率,采用透射电镜观察脂肪细胞的线粒体形态,生物发光法检测脂肪细胞内ATP。结果两组3T3-L1前体脂肪细胞均可分化为成熟脂肪细胞,高糖组成熟脂肪细胞体积及胞质内脂滴均较低糖组大;高糖组成熟脂肪细胞基础状态及胰岛素刺激下的葡萄糖摄取率均低于低糖组脂肪细胞;高糖组成熟脂肪细胞线粒体形态异常,细胞内ATP的含量为(63.00±2.48)nM/mg protein,低糖组为(102.00±1.39)nM/mg protein,两组比较,P<0.05。结论采用含25mmol/L或5 mmol/L葡萄糖的DMEM培养基培养,对3T3-L1前体脂肪细胞向成熟脂肪细胞的分化进程无明显影响;高糖诱导分化可致成熟脂肪细胞产生胰岛素抵抗和线粒体功能损伤。
- 张向君王秀芳鲍子超吴钦良王加林赵亚萍
- 关键词：3T3-L1脂肪细胞分化线粒体
- hsa-miR-17-92 cluster及其同源体靶基因的生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 目的对hsa-miR-17-92duster及其同源体进行系统的生物信息学分析，预测其可能参与的生物学过程，为深入研究其在脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法1．应用PubMed、Google等信息搜索工具查找hsa-miR-17-92cluster及其同源体的所有研究，综述已有研究进展；2．应用miRBase获取hsa-miR-17-92cluster及其同源体的各成员序列，并分析其序列特征及保守性；3．应用美国国家生物技术信息中心（NCBI）blast、NCBImapviewer、基因组生物信息学（UCSC）Browser工具分析hsa-miR-17-92 cluster及其同源体所在基因组的序列特征；4．应用TargetScan5．1，PicTar及miRanda预测hsa-miR-17-92cluster及其同源体靶基因，取三者预测结果的交集，进一步进行功能注释和Pathway富集分析。结果1．现有研究提示hsa-miR-17-92 cluster及其同源体在脂肪细胞分化、肿瘤疾病、心脏及肺发育、免疫系统与血管形成等生物学过程中有重要作用；2．hsa-miR-17-92 cluster及其同源体进化上高度保守，根据种子序列同源性可分为4类，且在多物种问非常保守；3．hsa．miR-17-92 cluster及其同源体预测靶基因的功能与细胞周期、细胞黏附、Wnt、TGF-β信号、p53、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路有较大的相关性，可能参与了前列腺癌、胰腺癌、结肠癌等多种疾病通路。结论通过对hsa-miR-17-92 cluster及其同源体系统的生物信息学分析，初步阐明了hsa-miR一17-92 cluster及其同源体的基本生物学特征，并为hsa-miR-17-92 cluster后续研究提供了功能与机制的线索。
- 史春梅徐广峰陈玲赵亚萍倪毓辉杨蕾季晨博郭锡熔
- 关键词：CLUSTER生物信息学脂肪细胞
- miR-26b慢病毒载体构建及其在人前体脂肪细胞中的表达验证被引量：1
- 2014年
- 目的构建人miR-26b慢病毒表达载体,并检测其在人前体脂肪细胞中过表达效果。方法以人脂肪细胞基因组DNA为模板,PCR扩增包含miR-26b所在区域上下游100bp左右的基因组DNA,克隆慢病毒表达载体,进一步包装成慢病毒并感染人脂肪细胞,荧光定量PCR检测miR-26b表达。结果成功构建miR-26b慢病毒载体,病毒感染效率为75%左右,miR-26b过表达效率达2倍以上。结论成功构建了miR-26b慢病毒表达载体,可用于研究miR-26b在人脂肪细胞中的分子机制。
- 徐广峰赵亚萍史春梅陈玲杨蕾宋桂仙宋雷雷赵超季晨博郭锡熔
- 关键词：慢病毒载体前体脂肪细胞
- 肠道屏障在非酒精性脂肪性肝病发病机制中的研究进展被引量：3
- 2013年
- 近年来,非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的发病率呈逐年上升趋势,现已成为全球严重的公共健康问题之一。机械屏障、化学屏障、生物屏障、免疫屏障的作用不是孤立的,而是存在密切联系的。肠道屏障的损伤可以导致NAFLD,而NAFLD发展到一定阶段也会反过来影响肠道屏障功能,从而产生相互影响,形成恶性循环。该文主要从机械屏障、化学屏障、免疫屏障、生物屏障四个方面对肠道黏膜屏障在NAFLD发病中的作用进行系统叙述。
- 王秀芳张乃键赵亚萍
- 关键词：非酒精性脂肪性肝病肠道屏障发病机制
- hsa-miR-26b沉默载体的构建及验证
- 2013年
- 目的构建hsa-miR-26b沉默载体,与其靶基因PTEN共转染HEK-293T细胞验证其沉默效果。方法用miRNA海绵体技术设计并合成与hsa-miR-26b成熟序列反向互补的3个重复序列的双链DNA,将短发卡状RNA(shRNA)克隆入LV3-GFP-Puro载体,与靶基因PTEN共转染HEK-293T细胞,于24 h后收集细胞RNA,用real-time PCR检测hsa-miR-26b表达水平,同时用双荧光素报告系统检测其对靶基因的作用。结果成功构建了有效的hsa-miR-26b沉默载体,经测序验证与设计序列一致;real-time PCR验证hsa-miR-26b表达水平降低了75%;双荧光素报告系统验证其对靶基因无抑制作用(P>0.05)。结论成功构建hsa-miR-26b沉默载体,并验证其对靶基因PTEN无抑制作用。
- 史春梅徐广峰宋桂仙季晨博陈玲杨蕾庞玲霞赵亚萍郭锡熔
