四川省自然科学基金(2008JY0094)
- 作品数:2 被引量:13H指数:2
- 相关作者:张红宇吴先军徐培洲吴绍华薛晶晶更多>>
- 相关机构:四川农业大学江汉大学更多>>
- 发文基金:四川省自然科学基金国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 标题双胚苗水稻中单倍体和二倍体不同器官的cDNA-AFLP分析被引量:2
- 2009年
- SARII-628是四川农业大学水稻研究所的一个双胚苗自然群体,每年都能定期分离出单倍体与二倍体(n:2n)。文章对单倍体和对应的二倍体进行了cDNA-AFLP分析。合成了3个单倍体和1个二倍体的根、茎、穗和叶的cDNA,用EcoRI/MspI酶切组合,通过cDNA-AFLP技术统计这16个样本的表达差异。共选用30对引物,在633条扩增位点上筛选出49个有差异表达的序列。结果:(1)单倍化后cDNA-AFLP总体水平虽然在各单株间略有差异但变化不大,表达变化的位点所占比例平均为5.14%,高于二倍体的3.93%;(2)根据样本在根、茎、穗和叶中表达出带的有无,在扩增出的14种带型中,有4种只出现在单倍体中,其对应位点的表达具有单倍体的特异性;(3)对这3个单倍体在不同器官的激活和沉默位点进行汇总,发现在根和穗中,发生沉默的位点多于激活的位点数,而在茎和叶中的结果正好与之相反,但是在单倍体的所有器官中发生激活变化的位点多于沉默变化的位点;(4)对不同器官中的发生表达变化(激活+沉默)位点分析,发现根中的变化位点最多,在穗中的变化最少,说明位点的表达变化具有器官特异性。
- 张红宇彭海吴绍华黄静徐培洲汪旭东吴先军
- 关键词:水稻
- 双胚苗水稻单倍体及其杂交后代基因组DNA甲基化特异位点的分析及功能探讨被引量:11
- 2011年
- 采用甲基化敏感性扩增多态性技术对水稻单倍体SARⅡ-628及它与蜀恢527、蜀恢363的杂交后代基因组DNA甲基化位点进行了分析。用16对选择性扩增引物在双亲及杂交后代中共检测到765个DNA甲基化位点,与双亲相比,杂交后代DNA甲基化水平均有不同程度的降低。通过分析两个杂交组合与双亲的甲基化带型差异,发现非单倍体遗传及单倍体独立遗传两种甲基化差异位点。对部分甲基化位点的序列进行功能分析,发现这些位点主要涉及细胞构造、代谢途径、应激反应等生物学功能。推测这类功能基因的甲基化修饰调控着相关基因的开启与关闭,为植物的生存、生长、发育及进化提供动力。
- 吴绍华薛晶晶张红宇徐培洲吴先军
- 关键词:双胚苗水稻单倍体DNA甲基化