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国家自然科学基金(30630051)

作品数：19 被引量：106H指数：7
相关作者：李思发唐文乔唐首杰毕详张飞明更多>>
相关机构：上海海洋大学上海市松江区水产良种场湖南师范大学更多>>
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相关领域：农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 19篇中文期刊文章

领域

  • 15篇农业科学
  • 5篇生物学

主题

  • 7篇团头鲂
  • 4篇选育群体
  • 4篇长江
  • 3篇微卫星
  • 3篇微卫星分析
  • 3篇线粒体
  • 3篇基因
  • 2篇遗传变异分析
  • 2篇英文
  • 2篇四大家鱼
  • 2篇群体遗传变异
  • 2篇主要组织相容...
  • 2篇主要组织相容...
  • 2篇组织相容性
  • 2篇组织相容性复...
  • 2篇线粒体DNA
  • 2篇基因组
  • 2篇家鱼
  • 2篇复合体
  • 2篇AFLP分析

机构

  • 18篇上海海洋大学
  • 4篇上海市松江区...
  • 1篇湖南师范大学

作者

  • 12篇李思发
  • 8篇唐文乔
  • 6篇唐首杰
  • 4篇张友良
  • 4篇张飞明
  • 4篇毕详
  • 3篇于红霞
  • 3篇杨金权
  • 3篇王成辉
  • 2篇刘东
  • 2篇杨琴玲
  • 2篇郑德锋
  • 2篇赵金良
  • 2篇严骏骢
  • 2篇蔡完其
  • 2篇刘至治
  • 2篇徐嘉伟
  • 1篇冯维
  • 1篇刘少军
  • 1篇马晓茜

传媒

  • 3篇动物学杂志
  • 3篇Zoolog...
  • 2篇中国水产科学
  • 2篇上海海洋大学...
  • 1篇生物技术通报
  • 1篇江苏农业科学
  • 1篇淡水渔业
  • 1篇水产科技情报
  • 1篇水产学报
  • 1篇水生生物学报
  • 1篇浙江农业学报
  • 1篇中国科学：生...
  • 1篇南方水产科学

年份

  • 3篇2019
  • 1篇2017
  • 3篇2014
  • 2篇2012
  • 4篇2011
  • 3篇2010
  • 3篇2009
共 19 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
团头鲂3个选育群体遗传潜力的微卫星分析被引量：9
2017年
为从遗传多样性的角度了解团头鲂(Megalobrama amblycephala)3个选育群体的遗传潜力,该研究以团头鲂"浦江1号"选育奠基群体(F_0)为对照组,采用14个多态性转录组微卫星标记评估了团头鲂3个选育群体的遗传多样性,分析其遗传潜力。结果显示,3个选育群体平均每个位点的等位基因数(A)为7.928 6~8.785 7,有效等位基因数(A_E)为4.409 4~4.878 4,观察杂合度(H_O)为0.491 1~0.574 4,期望杂合度(HE)为0.741 3~0.751 8,多态信息含量(PIC)为0.691 2~0.705 2,近交系数(FIS)为0.229~0.352。3个选育群体的遗传多样性水平(AE、HE)均高于F0群体,但不存在显著差异(P>0.05)。3个选育群体的有效群体大小(N_e)为11.0~29.3,在近期可能经历过遗传瓶颈。3个选育群体间D_A、D_(SW)遗传距离分别为0.175 4~0.358 8、0.804 7~1.054 4。该结果表明,3个选育群体的遗传多样性较高,遗传潜力较大,但因有效群体数量较少和瓶颈效应的影响,存在杂合度下降和近交衰退的风险,今后需采取科学措施来保护选育群体的遗传潜力。
唐首杰毕详王成辉张飞明张友良谢志强
关键词：团头鲂选育群体微卫星
长江老江河国家级四大家鱼原种场鲢的生长特征被引量：16
2009年
鲢(Hypophthalmichthys molitrix)是我国传统食用鱼,也是国际上养殖产量最高的鱼种。长江是鲢生产的摇篮和优质基因库。本文分析了2008年1月及12月采自湖北监利县老江河国家级四大家鱼原种场151尾鲢样本的年龄和生长特征,结果显示,体长(L)与鳞长(R)呈直线关系L=205.96R-6.374 0(r=0.948 6),体重(W)与体长呈幂函数关系W=0.023 4L2.941 1(r=0.995 5),生长规律可用Von Bertalanffy方程Lt=93.77[1-e-0.208 7(t-0.031 1)]和Wt=19 293.35[1-e-0.208 7(t-0.031 1)]2.941 1表达。群体的生长拐点位于ti=5.14,拐点体长Lr=61.47 cm,拐点体重Wr=5 570.85 g。分析表明,渐近体长、渐近体重及拐点年龄等参数,老江河鲢的比20世纪80年代中期天鹅洲和90年代初湖口地区鲢的要低,生长参数发生了一些变化。
于红霞唐文乔李思发
关键词：长江中游
团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析被引量：10
2011年
为了解团头鲂MHCⅠ类基因的结构,采用cDNA末端快速扩增(Rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术,首次成功克隆了团头鲂"浦江Ⅰ号"F0基础群体及选育F8世代的MHCⅠ类基因,共获得3条cDNA全长序列。序列全长为2 040～2 079 bp,含有87～102 bp的5'-UTR,1 035～1 044 bp的编码区(包括信号肽,alpha 1、alpha 2和alpha 3三个结构域,跨膜区和胞质区)及911～946 bp的3'-UTR区,分别编码347、344个氨基酸。F8世代序列的核苷酸/氨基酸的同源性很高,为89.0%/93.0%,而与F0世代的同源性较低(75.3%～77.0%和71.1%～71.4%),呈现出明显的分子多态性。分析表明,团头鲂具有经典的MHCⅠ类分子的空间结构,与人类HLA-A2的抗原肽结合区的晶体结构相比,二者的差异主要集中在5个(I～V)区上。在Neighbor-joining(NJ)法构建的分子进化树中,团头鲂与草鱼的亲缘关系最近,与鲑鳟鱼类、爬行类、鸟类、哺乳类及人类的亲缘关系则渐远。RT-PCR组织表达分析表明,团头鲂MHCⅠ类基因在所检测的的8个组织中均表达,在鳃、头肾和血液中有较强的转录本,中等强度表达于肝脏和脾脏,在后肾、肠和肌肉中表达较弱。
马晓茜刘至治李思发唐文乔杨金权
关键词：团头鲂主要组织相容性复合体克隆
团头鲂野生、驯养、选育3类遗传生态群体遗传变异的线粒体DNA分析被引量：7
2011年
通过对线粒体DNA控制区和CO I基因序列的联合分析,研究了团头鲂(Megalobrama amblycephala)3类遗传生态群体(包含4个野生群体、2个驯养群体、1个选育良种"浦江1号"群体)的遗传多样性和遗传分化情况。结果表明:(1)在所分析的7个群体中,共确定了64种单倍型,群体间无共享单倍型。(2)4个野生群体内线粒体DNA的单倍型多样度(Hd)在0.857～0.943之间,核苷酸变异位点数在31～40之间,核苷酸多样性指数(π)在0.275%～0.461%之间,平均核苷酸差异数(K)的范围为4.043～6.800;2个驯养群体的相应参数变化范围分别为0.714～0.800、18～21、0.122%～0.175%、1.800～2.586,均低于野生群体;选育群体的相应参数分别为0.843、23、0.193%、2.843,低于4个野生群体,但高于2个驯养群体。以上4种多样性参数在7个群体中的变化趋势一致。(3)7个群体之间的平均遗传距离在0.000 6～0.003 5之间,遗传分化指数(FST)在0.010 9～0.133 1之间。4个野生群体间FST值差异不显著(P>0.05),而2个驯养群体间FST值差异显著(P<0.05),它们与选育群体间的FST值差异也显著(P<0.05)。以上结果表明,生存环境的殊异(敞开的天然水体,封闭的驯养池塘)和人工选择(严格有序的科学选育)对种群遗传结构影响巨大,导致鱼类不同遗传生态类型群体间产生遗传变异和遗传分化。
唐首杰李思发蔡完其
关键词：团头鲂野生群体选育群体
Microsatellite analysis of variation among wild, domesticated, and genetically improved populations of blunt snout bream （Megalobrama amblycephala）被引量：3
2014年
In the present study,the genetic diversity of one selected strain(Pujiang No.1),two domesticated populations(GA and HX)and four wild populations(LZ,YN,SS and JL)of blunt snout bream(Megalobrama amblycephala)was analyzed using 17microsatellite markers.The results showed that an average of 4.88-7.65 number of alleles(A);an average of 3.20-5.33 effective alleles(Ne);average observed heterozygosity(Ho)of 0.6985-0.9044;average expected heterozygosity(He)of 0.6501-0.7805;and the average polymorphism information content(PIC)at 0.5706-0.7226.Pairwise FST value between populations ranged from0.0307-0.1451,and Nei’s standard genetic distance between populations was 0.0938-0.4524.The expected heterozygosities in the domesticated populations(GA and HX)were significantly lower than those found in three wild populations(LZ,SS and JL),but no difference was detected when compared with the wild YN population.Likewise,no difference was found between the four wild populations or two domesticated populations.The expected heterozygosity in Pujiang No.1 was higher than the two domesticated populations and lower than the four wild populations.Regarding pairwise FST value between populations,permutation test P-values were significant between the GA,HX and PJ populations,but not between the four wild populations.These results showed that the expected heterozygosity in the selected strain of blunt snout bream,after seven generations of selective breeding,was lower than that of wild populations,but this strain retains higher levels of genetic diversity than domesticated populations.The genetic differences and differentiation amongst wild populations,domesticated populations and the genetically improved strain of blunt snout bream will provide important conservation criteria and guide the utilization of germplasm resources.
Shou-Jie TANGSi-Fa LIWan-Qi CAIYan ZHAO
关键词：野生种群微卫星分析微卫星标记分析
世界范围内“四大家鱼”入侵现状及其适应特性被引量：5
2012年
原产中国的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、鳙(Aristichthys nobilis)、草鱼(Ctenopharyngodon idella)和青鱼(Mylopharyngodon piceus),即"四大家鱼",已分别被引入到世界上很多个国家和地区,在其中将近一半的地区成功入侵,远高于一般入侵生物的建群概率。这与其自身的高繁殖力、宽广的生理耐受性和食性,以及遗传结构多样性等特征有关,还与新栖息地环境因素密切相关。四大家鱼野外繁殖所需的具有一定流量、流速、足够长且通畅的河道,是其成功入侵的必备环境因素;气候因素也影响四大家鱼成功入侵的概率。此外,入侵地的饵料丰度以及与其他入侵生物的协同作用,也能促进四大家鱼在引入地建群之后的入侵速度和程度。
刘东李思发唐文乔
关键词：四大家鱼生物入侵生物学特性
连续三代减数分裂雌核发育团头鲂的遗传多样性分析和RAPD鉴别方法的建立被引量：2
2019年
为评估连续三代减数分裂雌核发育团头鲂群体的遗传多样性和遗传纯合度,寻找区分不同团头鲂育种群体(团头鲂浦江1号选育系、连续三代减数分裂雌核发育团头鲂群体)的稳定的分子遗传标记,本研究以团头鲂(Megalobrama amblycephala)浦江1号选育系F 9群体为对照组,利用39条多态性RAPD随机引物比较分析了团头鲂人工减数分裂雌核发育一代群体(G 1)、二代群体(G 2)和三代群体(G 3)的遗传多样性和遗传结构,获得了用于鉴别不同团头鲂育种群体(F 9、G 1、G 2、G 3)的稳定的RAPD分子遗传标记,探讨了连续多代诱导减数分裂雌核发育对团头鲂基因纯化的效果。结果显示,39条RAPD随机引物在F 9、G 1、G 2和G 3群体中扩增条带总数分别为213条、202条、200条和190条,F 9、G 1、G 2和G 3群体的多态位点比例分别为36.15%、35.64%、27.00%和26.84%,F 9、G 1、G 2和G 3群体的Shannon信息指数分别为0.207 9、0.185 7、0.146 1和0.138 3。3个雌核发育群体的遗传多样性水平(多态位点比例、Shannon信息指数)均明显低于对照组F 9群体,随着雌核发育世代数的增加,遗传多样性水平呈现逐代降低的趋势,即G 1>G 2>G 3。4个群体的群体内个体间的平均遗传相似系数为0.828 5~0.906 0,3个雌核发育群体的群体内个体间平均遗传相似系数均明显高于对照组F 9群体;群体内个体间的平均遗传相似系数呈现随雌核发育世代数的增加而升高的趋势,即G 3>G 2>G 1。群体间成对F ST值为0.269 2~0.419 5,经置换检验得到的F ST值的P值为0.000 0~0.009 0,均达到极显著水平(P<0.01),表明4个群体间存在极显著的遗传分化。有5条随机引物在群体间产生了特异DNA片段,其中,4条随机引物(S3、S40、S58和S75)可用于区分G 3群体和其他3个群体(F 9、G 1和G 2),引物S3的鉴别可靠性最高;仅1条随机引物(S71)能用于区分G 2群体和其他3个群体(F 9、G 1和G 3)。本研究结果表明,连续�
唐首杰毕详张飞明张友良
关键词：团头鲂雌核发育RAPD标记
鲢长江群体与国外移居群体间遗传变异的主要组织相容性复合体分析被引量：2
2012年
利用MHCⅠ类α2结构域基因片段,分析鲢长江群体(YZL)与多瑙河群体(DAN)、密西西比河群体(MIS)间的遗传变异。从3群体共40尾个体的117个有效克隆中,获得MHCⅠ类α2结构域等位基因68个。主要结果为:(1)YZL、DAN和MIS群体的等位基因数分别为21、27和20个,且群体间核苷酸序列(54.1%～99.5%)、氨基酸序列(39.4%～98.6%)的同源性变异范围大,揭示3群体MHCⅠ类α2结构域的多态性都较丰富。(2)群体内平均核苷酸/氨基酸序列同源性的大小顺序为MIS>DAN>YZL;而群体内核苷酸/氨基酸多样性指数(π/πaa)的大小顺序恰与此相反,表明鲢YZL群体MHCⅠ类α2结构域的变异较DAN和MIS群体大。(3)以氨基酸序列进行AMOVA分析的结果表明,3群体间、国内群体与国外移居群体间都存在显著的遗传分化(P<0.05)。(4)3群体抗原结合区(PBR)的非同义碱基/同义碱基替换值ω的大小顺序为YZL(1.652 5)>MIS(1.499 5)>DAN(1.337 0)>1,且在PBR区检测到5个正向选择位点,揭示3群体鲢MHCⅠ类分子均受到正向选择压力的作用,其中YZL群体的选择压力最大。
冯维刘至治李思发李雪松唐文乔杨金权
关键词：主要组织相容性复合体
草鱼中国土著群体与欧美日移居群体遗传差异的线粒体序列分析被引量：9
2009年
草鱼是中国的土著鱼类,自20世纪60年代以来已被移居到100多个国家和地区,主要用来控制水草或水产养殖。本研究通过线粒体D-Loop区(764bp)和COII+tRNA基因(719bp)序列分析,了解草鱼的中国土著群体(长江、珠江、黑龙江)和国外移居群体(匈牙利多瑙河、美国密西西比河、日本利根川河)之间以及各地方群体间的遗传差异。结果表明,中国土著草鱼群体的遗传变异高于国外移居群体;分子方差分析(AMOVA)表明,不同草鱼群体的遗传变异主要来自群体内,而不同地域间的差异极少;群体两两间Fst值比较表明,大多数群体之间遗传差异极显著;由TCS构建的单倍型网络结构图显示,长江草鱼群体是最原始的群体,其他水系草鱼均由长江群体演化而来;通过基因流分析发现,匈牙利多瑙河群体和日本利根川河群体来自长江和黑龙江群体,美国密西西比河群体除引自长江、黑龙江水系外,还有部分引自于珠江水系。
宋晓李思发王成辉徐嘉伟杨琴玲
关键词：草鱼
鳙的线粒体基因组核苷酸全序列分析(英文)被引量：2
2009年
对采集自我国长江的鳙的线粒体DNA全序列进行了测定。结果表明,鳙的线粒体DNA全长为166221bp,其碱基因组成为A=31.6%;C=27.1%;G=16.0%;T=25.3%,A+T含量为56.9%。鳙线粒体基因组的排列、结构和组成与其它鲤科鱼类相似,包括37个基因,即13个蛋白质编码基因,2个rRNA基因,22个tRNA基因和一个非编码控制区(D-loop)。在13个蛋白编码基因中,除ND6由轻链编码外,其余12个基因均由重链编码。COI基因的起始密码子为GTG,而其它12个蛋白编码基因的起始密码子均为ATG。
杨琴玲李思发徐嘉伟陈琴王成辉
关键词：鳙鱼线粒体基因组全序列基因排列
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