教育部科学技术研究重点项目(209145)
- 作品数：7 被引量：52H指数：4
- 相关作者：关统伟张利莉夏占峰车振明赵珂更多>>
- 相关机构：塔里木大学四川农业大学西华大学更多>>
- 发文基金：教育部科学技术研究重点项目国家自然科学基金教育部“春晖计划”更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 新疆于田盐池放线菌群落结构被引量：13
- 2009年
- 应用免培养技术和基于16SrRNA基因序列的系统发育分析对新疆于田盐池土壤放线菌群落结构进行研究。结果表明,41个克隆序列属于26个OTUs,分别分布于放线菌门放线菌亚纲(Actinobacteridae)的7个亚目和酸微菌亚纲(Acidimicrobidae),其中链孢囊菌亚目(Streptosporangi-neae)中放线菌组成丰富,占到了全部挑选克隆的42.3%,是于田盐池放线菌群落中的优势菌,而链霉菌不是高盐环境放线菌的优势菌群。在这些克隆序列中有71.8%的克隆序列同已知序列的相似性低于97%,属于放线菌的新类群,这些可能的新类群中有15.3%的克隆序列与已知菌株的相似性小于85%,这些克隆序列的分类地位都在科一级的分类单元上,有的可能分类地位更高。这些研究结果说明于田盐池中存在有较为丰富的放线菌系统发育多样性,并且潜藏着新类型的放线菌资源。另外,由于微生态效应的存在,不同高盐环境之间放线菌群落也存在明显差异。
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- 关键词：系统发育
- 一株极端嗜盐多孢放线菌新种的分类研究
- 2013年
- 通过多相分类技术证明一株分离自中国西北部新疆盐湖环境的放线菌新种XHU139．采用微生物的表型、生理生化特征、细胞化学及其分子遗传学手段研究放线菌新种XHUl39的系统分类地位．16SrRNA基因序列系统发育分析表明：菌株XHU139在多孢放线菌菌属中形成一个独立的分支单元，同近缘物种Actinopolyspora alba、Actinopolysporax iniiangensis和Actinopolyspora erythraea的同源性分别为97．6％、97．6％和97．1％，与它们的DNA—DNA杂交值分别为36．4％、31．3％和26．1％，因此被考虑作为多孢放线菌属的一个新成员．菌株XHUl39的最适生长温度是35℃，最适生长pH7．0，最适生长盐浓度12％～1f{％；细胞水解糖为xylos、glucose、ribose和arabinose，主要的醌型是MK-9（H4）（49．8％）和MK-10（H4）（24．2％），主要的脂肪酸是iso—C16：0（28．0％）和anteiso—C17：o（27．6％），细胞磷脂是diphosphatidylglycerol、phosphatidylglycer01、phosphatidylcholine、phosphatidylinosit01和2个未知的磷脂类型．多相分类研究结果表明，菌株XHUl39为多孢放线菌属的一个新物种．
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- 关键词：嗜盐放线菌新物种
- 1株喜盐Actinopolyspora菌属新种的系统分类
- 2013年
- 1株嗜盐、产丝放线菌新种TRM4064分离自四川大英盐湖。它的分类地位通过多相分类技术被证明。16S rRNA基因序列系统发育分析表明:菌株TRM4064在多孢放线菌属中形成一个独立的分支单元,同近缘物种Actinopolyspora mortivallis的同源性为98.8%,与它的DNA-DNA杂交值为23.2%,同Actinopolyspora菌属另外有效命名物种的相似性小于97%。菌株TRM4064的最适生长温度是37℃,最适生长pH为7.0,最适生长盐浓度为13%;细胞水解糖为木糖、葡萄糖、核糖和阿拉伯糖,主要的醌型是MK-10(H4)(38.2%)、MK-9(H4)(25.1%)、MK-9(H2)(28.6%)和MK-8(H4)(7.3%),主要的脂肪酸是anteiso-C17:0(36.9%)和iso-C17:0(19.3%),细胞磷脂是心磷脂、磷脂酰甘油、卵磷脂、磷脂酰肌醇和2个未知的磷脂类型。综合其表型、化学型及其分子遗传学等指标表明菌株TRM4064为多孢放线菌属的一个新成员。
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- 关键词：嗜盐放线菌新物种
- 罗布泊盐湖沉积物放线菌的群落结构被引量：6
- 2013年
- 为开发盐湖生态放线菌资源,应用16S rRNA基因文库构建和序列的系统发育分析对罗布泊盐湖沉积物中放线菌的群落结构进行了研究.结果显示罗布泊盐湖放线菌群落组成丰富,共获得Ilumatobacter、Saccharopolyspora、Streptomyces、Actinopolyspora、Kocuria、Streptomonospora、Streptosporangium、Amycolatopsis、Isoptericola、Nocardiopsis、Dietzia和Glycomyces共12个属的放线菌;罗布泊盐湖中存在有大量放线菌新类群,58.82%克隆的序列与有效命名的菌株同源性≤97%,其中36.78%的序列与有效命名的菌株的同源性低于90%而无法归入任何一个属,预示着可能是一些科一级或更高的新的放线菌分类单元.罗布泊放线菌群落中占优势的菌群为Glycomyces(20.10%)、Dietzia(16.13%)、Isoptericola(10.30%)和Nocardiopsis(5.88%),而不是链霉菌Streptomyces(1.47%).研究表明盐湖生态存在丰富的放线菌资源和新类群,从而为其开发提供了理论数据.
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- 关键词：放线菌群落结构系统发育
- 艾丁湖沉积物放线菌多样性被引量：24
- 2011年
- 【目的】为了研究新疆艾丁湖低海拔、高盐环境中的放线菌多样性。【方法】本研究应用基于16S rRNA基因序列系统发育分析的免培养方法和选择性分离培养方法相结合的方式对艾丁湖沉积物样品进行放线菌多样性分析。利用放线菌特异性引物扩增16S rRNA基因并构建了16S rRNA基因克隆文库,对文库中的插入序列进行RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism限制性片段长度多态性)分析。采用不同盐浓度的9种选择性培养基分离样品中的放线菌。【结果】通过对16S rRNA基因克隆文库分析,273个克隆分布于放线菌纲(Actinobacteria)的放线菌亚纲(Actinobacteridae 208个)、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae 13个)和红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae 52个)。该环境中优势放线菌为微球菌科的罗斯氏菌属(Rothia),占到克隆总数的37%。有45.8%的序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,部分序列形成了几个独立的进化分支,可能代表着放线菌新的类群。通过分离培养,共得到55株放线菌,分布在放线菌目的6个亚目中,以链霉菌属(Streptomyces)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)为主要类群。有6株菌的16S rRNA基因序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,为潜在的放线菌新分类单元。【结论】研究表明,艾丁湖中的放线菌具有较高的多样性,并蕴藏着多种新类型,有进一步研究价值。
- 夏占峰关统伟阮继生黄英张利莉
- 关键词：放线菌多样性
- 新疆高盐环境土壤放线菌分离培养基比较被引量：13
- 2010年
- 根据采样点及其样品相关信息结合近几年对高盐环境放线菌的分离经验,设计出一种含有10%～30%复合盐的CMKA培养基,同时以补充10%～30%复合盐的高氏一号琼脂培养基(GA)、ISP4培养基、淀粉酪素琼脂培养基(SCK)和HV培养基为对照,对采集于新疆阿克陶盐山、罗布泊洼地和阿克苏盐碱地的3份土壤样品利用上述5种培养基进行了分离.结果表明,CMKA培养基分离效果最好,共分离到7个属的放线菌(Actinopolyspora、Streptomonospora、Nocardiopsis、Saccharomonospora、Brevibacterium、Streptomyces和Amycolatopsis),并且获得1个放线菌新种(TRM F103).ISP4、GA、HV和SCK培养基分离效果较差,获得的属级分类单元少.同时,CMKA培养基的出菌率也是最高的,说明比较适合分离高盐环境土壤放线菌,而用于分离普通环境中放线菌的ISP4、GA、HV和SCK培养基则不适于高盐环境放线菌的分离.此外,新疆的高盐环境土壤中存在着丰富的放线菌资源,包括一些新类群的存在.
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- 关键词：高盐环境放线菌
- 新疆硝尔库勒盐湖放线菌分离方法的初步研究被引量：3
- 2012年
- 为了研究新疆硝尔库勒盐湖中的放线菌多样性,以微生物抗高渗透压的生理机制为指导,结合盐湖高盐、寡营养的特点,设计了含有在嗜盐微生物细胞中起渗透调节作用的多种碳源和氮源的分离培养基,以TP培养基、GW1培养基和F6培养基为对照,对新疆硝尔库勒湖沉积物样品进行分离。结果表明,海藻糖-肌酸培养基(B3)分离效果最好,能分离到10个属16个不同种的放线菌;海藻糖-天冬氨酸培养基(B1)和海藻糖-谷氨酸培养基(B2)分离效果次之,均能分离到5个属7个不同种的放线菌,并有2个潜在的放线菌新物种被发现(菌株编号为41376、41293)。这说明以渗透调节物作为碳源和氮源是高盐环境放线菌分离比较理想的选择,为以后高盐环境微生物的分离培养提供了理论指导。
- 陈正军关统伟张利莉
- 关键词：放线菌
