国家自然科学基金(41002123) 作品数:3 被引量:30 H指数:2 相关作者: 蒋宏忱 吴耿 孙永娟 赖忠平 董海良 更多>> 相关机构: 中国科学院 中国地质大学 中国科学院大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 更多>>
柴达木盆地达布逊盐湖微生物多样性研究 被引量:24 2013年 本研究采用高通量测序与传统培养技术相结合的方式研究达布逊湖微生物的多样性。结果显示,达布逊盐湖中的细菌多样性与丰度远高于古菌。高通量测序所得的16SrRNA基因序列分别归属广古菌门(Euryarchaeota),放线菌门(Actinobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),变形菌门(Proteobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia)。广古菌门序列占原核微生物(细菌与古菌之和)的5.5%,以嗜盐的盐杆菌科(Halobacteriaceae)为主,而属于放线菌门、拟杆菌门、变形菌门和疣微菌门的细菌序列分别占原核微生物的53.0%、25.8%、14.1%和1.6%。定量PCR结果显示,达布逊盐湖水体中的细菌和古菌16S rRNA基因丰度分别为3.27×107和4.35×104拷贝/毫升。培养分离获得的纯细菌菌株分别属于假单胞菌属(Pseudomonas)和芽孢杆菌属(Bacillus)。古菌菌株则分别属于盐杆菌科的盐盒菌属(Haloarcula)、盐红菌属(Halorubrum)和盐棍菌属(Halorhabdus)。本研究为青藏高原盐湖微生物资源的开发和利用提供了有利的数据支持。 赵婉雨 杨渐 董海良 吴耿 王尚 孙永娟 赖忠平 蒋宏忱关键词:嗜盐微生物 古菌 细菌 多样性 Onshore Contribution to the Microbial Communities in the Lakes on the Qing-Tibetan Plateau 2014年 The inland lakes on the Tibetan Plateau are inhabited by diverse microbial communities,which play a significant role in biogeochemical cycles of biogenic elements(e.g.carbon,nitrogen).Onshore inputs provide essential JIANG Hongchen YANG Jian DONG Hailiang MA Li'an WU Liyou ZHOU Jizhong关键词:LAKES 青藏高原湖泊沉积物硫酸盐还原菌种群分布 被引量:6 2013年 采用聚合酶链式反应(PCR,Polymerase Chain Reaction)、变性梯度凝胶电泳(DGGE,Denaturing Gra-dient Gel Electrophoresis)与实时荧光定量聚合酶链式反应(Q-PCR,Quantitative PCR)相结合的综合分析技术,研究了青藏高原洱海、青海湖、尕海1、尕海2、小柴旦湖沉积物硫酸盐还原菌多样性及丰度。研究结果显示,5个盐湖沉积物中dsrB(编码亚硫酸还原酶β亚基,为硫酸盐还原菌所共有)基因的丰度为每克沉积物1.71×108~1.55×109拷贝,与盐度无明显相关性;所获得的dsrB基因序列分属于3个科:Desulfobacter-aceae,Desulfobulbaceae和Peptococcaceae。其中,Desulfobacteraceae科是主要类群。硫酸盐还原菌多样性(DGGE结果)与盐度呈现出负相关性。故在所研究的盐湖中,盐度可能不是影响硫酸盐还原菌种群分布的唯一因素,可能还受其它未知环境因素的影响,有待于进一步研究。 杨渐 蒋宏忱 孙永娟 吴耿 侯卫国 董海良 赖忠平关键词:DGGE 硫酸盐还原菌