河南省基础与前沿技术研究计划项目(102300413213)
- 作品数：6 被引量：6H指数：1
- 相关作者：杨献光秦丹李雨渠畅潘兆倩更多>>
- 相关机构：河南师范大学科技部更多>>
- 发文基金：河南省基础与前沿技术研究计划项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学自然科学总论文化科学更多>>
- 基于伪氨基酸组成和支持向量机预测人类蛋白质亚细胞定位的研究被引量：1
- 2012年
- 蛋白质亚细胞定位是当前生物信息学和蛋白质科学的重要研究领域,本研究从蛋白质一级序列出发,取伪氨基酸组成向量作为输入数据,运用支持向量机作为预测工具,对人类12类蛋白质亚细胞的定位进行预测,得到独立检验的结果为85.2%,Jackknife检验的结果为80.6%;结果显示,用较简单的预测方法,得到了较好的预测结果。
- 李雨杨献光
- 关键词：亚细胞定位支持向量机
- 大鼠肝再生中肝细胞基因表达与DNA裸露的相关性研究
- 2013年
- 为了解大鼠肝再生中肝细胞的基因表达与DNA裸露的相关性,分离大鼠肝细胞,提取裸露DNA,用SOLEXA方法对DNA测序,用BWA软件拼装测序片段,用IPA软件分析拼装的基因种类和作用,用Rat Genome230 2.0芯片检测基因的转录情况.研究表明,大鼠肝再生的12h(PH后12h),肝细胞的裸露DNA涉及16 912个基因,1 701个基因发生了有意义裸露量变化.其中,25个基因的裸露量上调,1 676个基因的裸露量下调.与Rat Genome 230 2.0芯片的检测的基因转录比对表明,肝细胞的AKR7A3,BMYC,CDC25B等26个基因的裸露量和表达量均下调,表明大鼠肝再生12h时,这些基因的表达可能受染色体结构调控.
- 张亚磊秦丹王改平徐存拴
- 关键词：大鼠肝细胞大鼠肝再生基因转录
- 大鼠肝再生相关基因Tax1bp1与绿色荧光蛋白融合表达的研究
- 2011年
- 目的构建大鼠肝再生相关基因Tax1bp1的真核表达载体,融合绿色荧光蛋白并在再生肝中高效表达,观察目的蛋白的表达情况。方法利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术以大鼠再生肝为材料克隆Tax1bp1基因的开放阅读框(ORF),然后亚克隆到表达载体上构建重组表达载体pEGFP-N1-Tax1bp1,再用尾静脉液压法转入大鼠再生肝中进行绿色荧光蛋白融合表达。结果 Tax1bp1ORF克隆正确,融合绿色荧光蛋白重组表达载体pEGFP-N1-Tax1bp1构建成功;部分肝切除转基因6、12、24、48 h后均有荧光表达,Tax1bp1融合蛋白在上述时间点绿色荧光融合蛋白细胞转染率分别为8.7%、11.2%、14.5%和1.2%,转染率趋势同空载体绿色荧光蛋白表达情况一致。结论重组表达载体pEGFP-N1-Tax1bp1构建成功,并实现了绿色荧光融合蛋白的高效表达,为进一步研究肝再生相关Tax1bp1基因功能奠定了基础。
- 范念斯杨献光潘兆倩渠畅
- 关键词：CDNA克隆
- 非编码DNA序列的功能及其鉴定被引量：5
- 2013年
- 非编码DNA序列是指基因组中不编码蛋白质的DNA序列。这些序列可以结合调节因子、转录为功能性RNA、单独或协同地调节生理活动和病理过程。文章围绕基因表达调控作用,总结了近几年非编码DNA序列的研究成果,对其结构、功能和可能的作用机制进行了初步阐述,介绍了目前鉴定非编码DNA序列中功能元件的计算方法和实验技术,并对非编码DNA未来的研究进行了展望。
- 秦丹徐存拴
- 关键词：基因表达调控转录因子结合位点非编码RNA表观遗传学
- 大鼠肝再生相关基因MafF与EGFP融合表达研究
- 2011年
- 以大鼠再生肝为材料成功克隆到肝再生相关基因MafF的开放阅读框(ORF)。该ORF全长471bp,编码由157个氨基酸组成的蛋白质。基因芯片研究表明,MafF基因在部分肝切除后表达水平迅速升高。为了研究该基因在肝再生进程中的作用,构建其真核表达载体pEGFP-N1-MafF,在肝再生模型中进行融合表达。结果表明,转入后6h即可检测到融合蛋白,24h到达高峰,绘制了融合蛋白的表达动态,为进一步功能研究奠定基础。
- 杨献光徐存拴
- 关键词：肝再生CDNA克隆
- 不同物种糖原合成酶激酶基因(gsk3)的进化分析
- 2011年
- 糖原合成酶激酶(GSK3)是一种广泛存在的丝/苏氨酸蛋白激酶,它涉及许多信号传导通路,在糖尿病等疾病发生中起重要作用.我们从NCBI数据库中搜索出22种物种的gsk3序列,利用DNAstar软件比对gsk3的基因长度、开放阅读框的序列长度、终止密码子的多样性和氨基酸序列同源性,并建立各物种之间的系统进化树,从而分析不同物种的gsk3基因在进化过程中的多样性.
- 杨献光翟欢欢徐存拴
