国家现代农业产业技术体系建设项目(CARS-30-yz-1)
- 作品数：37 被引量：349H指数：12
- 相关作者：刘崇怀姜建福樊秀彩张颖孙海生更多>>
- 相关机构：中国农业科学院郑州果树研究所河南科技大学郑州轻工业学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目农业部作物种质资源保护项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程经济管理更多>>
- 基于高通量测序组装‘赤霞珠’叶绿体基因组及其特征分析被引量：15
- 2017年
- 【目的】以欧亚种葡萄‘赤霞珠’(Cabernet Sauvignon)为试材,建立适于葡萄属(Vitis)植物完整叶绿体基因组组装及其特征分析的方法,为研究葡萄属植物的进化和系统发育提供方法指导。【方法】采用Illumina Hi Seq PE150双末端测序策略对其全基因组DNA建库测序,建库类型为350 bp DNA小片段文库,测序深度为10倍。以已发表的拟南芥(Arabidopsis thaliana)和欧亚种葡萄‘黑比诺’(Pinot Noir)的叶绿体基因组序列为参考,通过BLASTN比对提取葡萄叶绿体基因组序列,并用SOAPdenovo软件进行组装,得到‘赤霞珠’完整的叶绿体基因组并对其进行特征分析。【结果】基于高通量Illumina测序,共获得5.2 G的全基因组原始数据,其中,葡萄叶绿体基因组序列为0.42 G,约占全基因组序列的8%。用抽提出来的葡萄叶绿体基因组序列成功组装出‘赤霞珠’完整叶绿体基因组。特征分析表明,叶绿体基因组序列全长160 676 bp,包括大单拷贝区(large single copy,LSC)、小单拷贝区(small single copy,SSC)和2个反向重复序列(inverted repeat,IRA和IRB),长度分别为89 134、19 072和26 235 bp,具有典型被子植物叶绿体基因组环状四分体结构;共注释得到154个基因,包括99个蛋白编码基因、47个t RNA基因和8个r RNA基因;其叶绿体基因组的GC含量为37.43%;共检测到37个串联重复序列(tandem repeat sequence)和53个散在重复序列(dispersed repeats),其中,绝大部分串联重复序列的长度为11—42 bp,占叶绿体基因组序列的0.83%,而散在重复序列占叶绿体基因组序列的5.33%;此外,还检测到50个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)位点,大部分的SSRs均由A或T组成,同时SSRs在‘赤霞珠’叶绿体基因组上的分布是不均匀的,LSC区段含有39个SSRs,而SSC区段和IR区段分别仅有7个和4个SSRs;与蛋白编码基因对应的密码子偏好使用A/T碱基,并且编码亮氨酸(L)的密码子使用频率最高,而编码半
- 谢海坤焦健樊秀彩张颖姜建福孙海生刘崇怀
- 关键词：叶绿体基因组高通量测序系统发育分析
- 基于SSR标记构建葡萄种质资源分子身份证被引量：29
- 2013年
- 以国家葡萄品种资源圃内保存的80份葡萄种质为试材,对构建葡萄种质分子身份证的方法进行探讨研究。利用筛选后的SSR标记对供试品种进行区分,然后根据引物对不同品种扩增条带分子量的大小进行编码。从62对引物中筛选出来自葡萄19条染色体上的28对SSR引物,在供试种质间共检测出等位基因169个,每对引物平均检测到等位基因数为6.0个。将等位基因赋值后仅用9对引物构建了供试种质的分子身份证编码,平均每对引物区分种质达8.9份,达到了区分品种更加简洁明了,用最少的引物区分不同品种的目的,表明SSR标记技术可有效用于建立葡萄种质资源分子身份证。
- 杜晶晶刘国银魏军亚刘德兵杨小振
- 关键词：葡萄SSR分子身份证
- 我国葡萄及其产品地理标志现状分析被引量：9
- 2016年
- 地理标志作为知识产权的一种,对于保护区域特色品种,促进产业发展具有重要的意义。本文通过统计2002-2015年我国葡萄及其产品地理标志的申请与批准情况,以期为我国今后葡萄地理标志保护和发展提供参考。统计结果表明:我国葡萄及其产品地理标志总数逐年增加,但各个部门的审定个数不同,工商总局审定较多;不同省份间申请数量也有差异;我国境内的葡萄地理标志用途以鲜葡萄为主,境外则以葡萄酒居多;葡萄及产品地理标志不仅地理分布广泛,而且品种多样;但我国葡萄地理标志产品专用标志使用情况不佳。同时对产生的原因进行了分析,并据此提出了:我国地理及产品标志系统应进一步优化制度,减少管理成本和资源浪费;地方政府应加大地理标志的宣传力度、提高监管水平等相关建议。
- 严露露刘崇怀樊秀彩张颖孙海生李民陈延惠姜建福
- 关键词：葡萄地理标志
- 我国葡萄品种权保护现状与分析被引量：4
- 2015年
- 植物品种权对于维护育种者权益,促进产业发展具有重要的意义,文章对2004~2014年我国葡萄属植物新品种的申请与授权情况进行了统计与分析。结果表明,我国葡萄品种权在果树中申请数量最多,但整体上申请量仍偏少;申请者主要集中在科研院所和大学,企业育种较少;申请品种权品种以鲜食类型为主,不同省份间申请量数量存在差异。同时对产生的原因进行了分析,并据此提出了加大我国植物品种权的宣传力度;将品种审定（登记）与DUS测试有机地结合;育种体系需进一步优化,扶持企业开展育种创新;开展分子标记技术,加快测试进程等相关建议,以期为今后我国葡萄新品种权的保护和发展提供参考。
- 姜建福孙海生樊秀彩张颖刘崇怀
- 关键词：葡萄植物新品种保护品种权
- 鲜食葡萄新品种‘郑葡1号’的选育被引量：10
- 2016年
- ‘郑葡1号’是由‘红地球’ב早玫瑰’杂交选育出的中熟葡萄新品种。果穗圆柱形，平均穗质量685．0g，最大穗质量910．0g。果粒着生极紧，成熟一致，着色一致。果粒近圆形，红色，平均粒质量10．3g。果粒与果柄较难分离。果粉中等厚。每果实含种子2～4粒，多为2粒。果皮无涩味，果肉较脆，无香味。可溶性固形物含量为17．0％，品质中上。果实生育期90d左右，在郑州地区8月上中旬成熟。植株生长势中庸。每结果枝结果1-2穗，2穗居多。叶片对霜霉病较为敏感，果实易感染白腐病。适合在温暖、雨量少的气候条件下种植。进入结果期早，定植第2年开始结果，易早期丰产。棚、篱架均可栽培，以中、短梢修剪为主。
- 刘崇怀樊秀彩姜建福李民孙海生张颖刘三军王鹏乔宝营刘启山魏志峰吕中伟张晓锋
- 关键词：葡萄鲜食
- 早熟无核葡萄新品种‘郑艳无核’被引量：13
- 2015年
- ‘郑艳无核’葡萄是以‘京秀’与‘布朗无核’杂交选育出的早熟无核新品种。果穗圆锥形,平均单穗质量618.3g。果粒椭圆形,粉红色,平均单粒质量3.1g,无核。果肉中等脆,有草莓香味,可溶性固形物含量为19.9%。在郑州地区7月中旬果实成熟,早果性及丰产性强,抗病性较强。
- 刘崇怀樊秀彩李民孙海生姜建福张颖顾红刘三军魏志峰
- 关键词：葡萄早熟无核
- 中国野生种葡萄mybA转录因子SNP特征分析被引量：9
- 2013年
- 以中国野生葡萄14个种为材料,对控制花色苷合成的mybA转录因子进行克隆和序列分析,获得VvmybA1和VlmybA2两个转录因子的全长基因序列,共检测到121个SNP,表现出丰富的遗传多样性。3种中性检测方法比较序列变异模式,结果表明,中国野生种葡萄VvmybA1和VlmybA2基因没有偏离中性模型,反映出基因漂移和选择性中性突变之间的平衡。不同野生种材料的mybA基因结构存在很高的同源相似性。但是在启动子区、内含子区以及第3个外显子区存在不同程度碱基的缺失、插入和替换,而且野生种葡萄mybA基因存在一些特有序列或突变,这些突变可以作为分子标记区分不同的野生种材料。通过基因结构比对和系统进化树分析,可将野生种葡萄细分为5个类群。初步推测桦叶葡萄和变叶葡萄进化地位较为原始。
- 焦健刘崇怀樊秀彩张颖孙海生姜建福李民
- 关键词：中国野生葡萄花色苷SNP
- 河南不同地区赤霞珠葡萄表皮酵母菌多样性研究被引量：1
- 2019年
- 该研究采用富集分离方法,从河南省内不同地区(安阳、长垣和漯河)葡萄种植园的赤霞珠葡萄表皮分离酵母菌,并利用分子生物学技术结合形态观察对菌株进行鉴定。结果表明,共分离得到193株酵母菌,为10种表型,且被鉴定为4个属6个种,分别为仙人掌有孢汉逊酵母(Hanseniaspora opuntiae)、葡萄有孢汉逊酵母(Hanseniaspora uvarum)、陆生伊萨酵母(Issatchenkia terricola)、橡树假丝酵母(Candida quercitrusa)、葡萄酒有孢汉生酵母(Hanseniaspora vineae)和Pichia terricola。其中,H. opuntiae和H. uvarum分布范围广,且漯河地区所蕴含的酵母菌种类最多。不同地区的赤霞珠葡萄表皮蕴含着多种类型的酵母菌资源,且不同地区的酵母菌种类及数目上的分布存在一定差异。
- 张俊杰尚益民陈锦永陈锦永程大伟彭姗姗刘崇怀
- 关键词：赤霞珠酵母菌RDNAD1/D2
- 植物抗非生物胁迫microRNA研究进展被引量：1
- 2012年
- 非生物胁迫是导致全球作物减产的重要因素,在植物应对非生物胁迫的生命反应中,编码蛋白的基因起到了非常重要的作用。随着研究的不断深入,发现microRNA（miRNA）在植物抗非生物胁迫中发挥着非常重要的作用。microRNA是一类非编码的RNA,长度约22-24 nt,通过作用于靶基因的mRNA进行调控。miRNA可以在植物应对多种非生物胁迫中发挥作用,如过氧化、营养缺乏、盐碱、干旱及其他机械胁迫等。我们基于目前的研究进展,着重介绍了miRNA的生物合成、作用机制,及其在多种非生物胁迫中的作用。
- 张颖姜建福孙海生樊秀彩刘崇怀
- 关键词：非生物胁迫MICRORNA盐碱干旱植物
- 葡萄EST-SNP位点的信息与特征被引量：6
- 2012年
- 为了从不同基因型葡萄组织的表达序列标签(EST)中得到候选单核苷酸多态性(SNP)位点,从NCBI的dbEST数据库中下载来源于9个不同葡萄基因型的不同组织EST序列42 493条,利用CAP3软件拼接得到6 126个重叠群(contig),将拼接结果导入QualitySNP进行SNP筛选;同时,为提高候选SNP位点的可靠度,降低小规格contig开发SNP的假阳性率和大规格contig开发SNP的假阴性率,设置候选SNP位点的次要等位基因频率至少为30%,SNP侧翼序列保守度至少为5bp。结果表明:仅在1 195个contig中存在候选SNP位点,共5 032个,其中包括1 800个颠换类型,2 896个转换类型,336个单碱基的插入与缺失(indel),SNP的平均出现频率为4.2SNP.contig-1。利用CAPS(酶切扩增多态序列)分子标记和重测序方法对其中几个候选SNP位点进行验证表明,符合人工筛选原则且来自于小规格contig的候选SNP位点检测结果较好,可靠度最高。
- 李猛郭大龙刘崇怀张国海侯小改
- 关键词：葡萄表达序列标签单核苷酸多态性
