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浙江省科技攻关计划(2004C23001)

作品数：1 被引量：2H指数：1
相关作者：卢亦愚徐昌平莫世华赵斐斐冯燕更多>>
相关机构：浙江省疾病预防控制中心宁波大学更多>>
发文基金：浙江省科技攻关计划更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇序列同源性
  • 1篇遗传学
  • 1篇同源性
  • 1篇全序列
  • 1篇流感
  • 1篇流感病毒
  • 1篇流感病毒A型
  • 1篇H3N2亚型
  • 1篇病毒

机构

  • 1篇宁波大学
  • 1篇浙江省疾病预...

作者

  • 1篇冯燕
  • 1篇赵斐斐
  • 1篇莫世华
  • 1篇徐昌平
  • 1篇卢亦愚

传媒

  • 1篇中华预防医学...

年份

  • 1篇2011
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
1998-2009年浙江省H3N2亚型流行性感冒病毒全序列变异的研究被引量：2
2011年
目的比较1998-2009年浙江省H3N2业型流行性感冒（简称流感）流行株HA基因进化与全基因进化状况的一致性，并探讨全基因组序列上可能存在的潜在抗原区域。方法选择浙江省CDC流感实验室于1998-2009年流感疫情中分离保存的H3N2亚型流感流行代表株19株，采用RT—PCR法进行全基因组序列扩增，并将这些毒株与10株同期H3N2亚型流感疫苗株进行全序列及HA1基因的系统进化比较；通过氨基酸替换比较、熵值计算及正向选择位点的筛选，确定各基因上的氨基酸易变位点。结果H3N2亚型流感病毒的全序列长度为4466个氨基酸，其中有137个氨基酸位点发牛稳定变异。在HA基因上第144和158位氨基酸分别经历了4次和3次替换，NA基因的第93、143、307、370、372位氨基酸和NP基因的第450位氨基酸经历了2次替换，且HA基因和NA基因上分别有29％（12／41）和77％（24／31）的变异位点位于已知抗原决定簇之外的区域。氨基酸位点熵值分析显示，HA基因非抗原决定簇的3、225、361位，NA基因非抗原决定簇的93、143、147、150、372位，PB1基因的113、576、586位，朋基因的101、256、382、421、437位，NP基因的377、450位，M1基因的218位及M2基因的31位氨基酸均为易变位点。结论浙江省1998-2009年H3N2业型流感病毒在HA和NA已知抗原决定簇之外的区域与部分内部基因上，可能存在着一些尚未被发现或者新形成的抗原位点。与HA基因的系统进化比较，全序列能更为伞面地反映出流感流行株之间的亲缘关系与进化规律。
赵斐斐卢亦愚冯燕徐昌平莫世华
关键词：流感病毒A型H3N2亚型序列同源性
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