中央高校基本科研业务费专项资金(JUSRP111A46)
- 作品数:6 被引量:10H指数:2
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- 环糊精葡萄糖基转移酶N-端热稳定性研究
- 2012年
- 环糊精葡萄糖基转移酶(CGTase;EC2.4.1.19)是生产环糊精的重要工业用酶,由于工业生产条件的高温加热,使得CGTase的使用受到很大限制。除了筛选合适菌种外,人们更希望利用蛋白质工程手段改造CGTase的热稳定性。文中采用分子动力学模拟取样研究了CGTase的N-端环状区域中氢键与盐桥对其耐热性的影响作用。结果表明:随着模拟温度的升高,非电荷-非电荷氢键占有率显著降低,带电荷-带电荷氢键占有率并没有太大变化,高温下能够保持稳定的氢键几乎都是和带电氨基酸有关;由盐桥的断裂次序的分析,发现在高温下多数盐桥的占有率并没有显著降低,即盐桥的稳定存在对于抵抗高温是有效的。无论是氢键还是盐桥,它们的相同点都是带电荷-带电荷之间的反应受温度影响不大。这一结果说明在蛋白质CGTase中合适的位置增加带电氨基酸数量,增强电荷间静电相互作用,对于提高CGTase的热稳定性是有效的。
- 傅毅陈志国丁彦蕊孙俊须文波
- 关键词:环糊精葡萄糖基转移酶热稳定氢键分子动力学模拟
- 软硬协同在嵌入式系统教学中的探讨被引量:1
- 2013年
- 针对嵌入式系统课程教学中存在的问题,以"提高学生分析问题、解决问题的能力"为出发点,探索软硬协同的嵌入式系统教学改革,并提出嵌入式软硬协同教学的设计思路和方法。实践证明,嵌入式软硬协同教学法遵循"教学做合一"的教学理念,能有效化解课程中的难点,提高学生的实践能力。
- 陈志国傅毅孙俊
- 关键词:嵌入式系统教学改革
- 群体智能算法的遥感图像处理研究被引量:6
- 2013年
- 针对传统图像增强方法缺乏适应性的缺点,提出了一种用最优化过程进行图像增强的方法。首先对量子粒子群优化(quantum-behaved particle swarm optimization,QPSO)算法进行改进,提出了一种实变参数量子粒子群优化(time varying parameters QPSO,QPSO-tp)算法。标准测试函数的实验结果表明,改进后的算法在全局搜索能力和收敛精度上要优于原QPSO算法,具有调节参数少、随机性更强等优点。然后将遥感灰度图像的非线性变换增强过程用最优化问题进行处理,用QPSO-tp算法进行参数寻优。实验结果表明,图像的增强效果得到了较大提高。
- 陈志国傅毅孙俊
- 关键词:图像增强粒子群优化
- 分子动力学模拟研究CGTase酶活性区域的热稳定性被引量:3
- 2013年
- 环糊精葡萄糖基转移酶(cyclodextrin glycosyltransferase,CGTase,E.C.2.4.1.19)是食品、医药和化妆品等领域中的重要酶。文中通过分子动力学模拟研究了CGTase活性位点区域中分子内非共价键相互作用对蛋白质热稳定性的影响,以及在热压力下这些分子内非共价键相互作用又会如何发生变化。研究发现:在CGTase酶活性区域中分布着较多的盐桥和氢键网络体系,分析盐桥间的距离变化发现这些盐桥对高温具有很好的抗性,同时,高温下盐桥网络又比单个盐桥更加稳定;对该区域中氢键分析,发现随着模拟温度的升高,带电荷氨基酸之间形成的氢键在高温下具有很好的稳定性,同样,高温下氢键网络也比单个氢键更加稳定;通过对非共价键相互作用的分析中发现活性位点两侧的氨基酸残基与酶的热稳定性也有很大的关系。该蛋白酶的热稳定性与非共价键连接的数量、存在形式及形成非共价键相互作用的氨基酸空间位置都息息相关。该结果为用酶工程设计改造环糊精葡萄糖基转移酶热稳定性提供了突变方向,同时,为理解酶蛋白的热稳定机制,结构与功能关系的研究提供有益参考。
- 陈志国傅毅须文波
- 关键词:环糊精葡萄糖基转移酶热稳定蛋白质设计分子动力学模拟
- 群体智能和移动信标改进的DV-Hop算法
- 2013年
- 为了提高DV-Hop算法的性能,提出结合群体智能和移动信标的改进方法。首先提出一种最佳维变异的粒子群优化算法(Best Dimension Mutation Particle Swarm Optimization,BDMPSO),然后用BDMPSO算法校正DV-Hop算法的定位误差,最后用移动信标降低系统开销。仿真结果表明提出的算法性能稳定,提高了定位精度并降低了开销。
- 陈志国傅毅须文波孙俊
- 关键词:群体智能DV-HOP算法移动信标
- 最佳维变异粒子群优化算法在传感器调度中应用
- 2011年
- 粒子群优化(PSO)算法的主要特点是能快速得到问题的解,缺点是容易陷入局部最优。提出了一种利用最佳维变异技术和量子理论方法改进的PSO算法,并应用于目标跟踪传感器调度问题。目标的动力学模型为线性高斯模型,传感器观测值被高斯噪声污染并与目标状态线性相关。对于多传感器单目标跟踪的数学问题,引入提出的最佳维变异PSO算法,在整个时间轴上产生最小成本。仿真实验结果表明:提出的算法比已有的算法收敛速度更快,全局搜索能力更强,传感器调度效率更高。
- 陈志国傅毅须文波孙俊
- 关键词:粒子群优化目标跟踪