江西省自然科学基金(0430014)
- 作品数：7 被引量：48H指数：4
- 相关作者：朱笃李思光江玉梅鲁顺保李艳更多>>
- 相关机构：江西师范大学南昌大学江西省林业科学院更多>>
- 发文基金：江西省自然科学基金江西师范大学青年成长基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学化学工程更多>>
- 江西穗花杉自然居群遗传多样性的ISSR分析被引量：5
- 2008年
- 采用ISSR分子标记技术对江西5个自然穗花杉居群的遗传多样性水平和居群遗传结构进行了研究。用10个引物对5个居群58个样品进行扩增，共得到61条清晰的扩增带。在物种水平上，多态性百分率（PPB）83．61％，Nei’s基因多样性指数（H）为0．3146，Shannon’s信息多样性指数（HO）为0．4654。在居群水平上，多态性位点百分率在54．10％～72．13％之间，Nei’s基因多样性指数为0．1561～0．2809，Shannon’s信息多样性指数为0．2276～0．4105。大西坑（DK）和小西坑（XK）两个居群的遗传多样性水平较高，西平（XP）和明月山（MY）居群遗传多样性水平较低。居群间产生了较大的遗传分化（Gst=0．2710，Фst=26．62％）。由UPGMA聚类分析可知，大西坑和小西坑两个居群优先聚类，西平和遂川聚为一支，居群的亲缘关系与地理距离有一定相关性。鉴于穗花杉对生境改变适应性差和对人为干扰敏感，群落稳定性在穗花杉居群遗传多样性保护中的特殊地位，建议把大西坑（DK）和小西坑（XK）居群划入官山自然保护区核心保护范围，对其生存空间进行长期、有效的保护。另一方面，在居群间进行植株和幼苗的相互移栽，以提高居群间基因交流，以最大限度保护穗花杉的遗传多样性。
- 李艳朱柏芳江玉梅鲁顺保朱笃
- 关键词：穗花杉ISSR
- RAPD法研究穗花杉遗传多样性的反应条件优化被引量：1
- 2005年
- 以改进CTAB法抽提的中国特有濒危植物穗花杉嫩叶总DNA为模板,进行随机扩增多态性DNA(RAPD)最佳条件优化,结果表明:RAPD分析最佳反应体系为10×Buffer缓冲液2μL,模板70ng,Mg2+2.0mmol/L,dNTPs0.2mmol/L,引物0.60μmol/L,Taq酶1.5U,PCR反应体积为20μL.最佳扩增程序为94℃5min,1个循环;94℃1min、37℃1min、72℃2min,40个循环;72℃10min,1个循环.
- 朱柏芳朱笃李思光刘如龙邓荣根
- 关键词：穗花杉随机扩增多态性最佳反应体系MG^2+总DNAMOL
- 江西三清山华东黄杉种群遗传多样性研究被引量：2
- 2009年
- 采用ISSR分子标记技术分析江西三清山5个华东黄杉居群的遗传多样性水平和居群遗传结构。用10个引物对5个居群共45个样品进行扩增，共得到76条清晰的扩增带，其中68个位点为多态性位点。在物种水平上，多态性百分率（PPB）为89．47％，Nei＇s基因多样性指数（H）为0．2827，Shannon＇s信息多样性指数（I）为0．4322。在居群水平上，多态性位点百分率在56．58％-85．53％，Nei＇s基因多样性指数为0．1913～0．2827，Shannon＇s信息多样性指数为0．2905—0．4322。物种和居群遗传多样性水平都较高，居群间产生了一定的遗传分化（Gst=0．2090，Фst=14．05％）。由UPGMA聚类分析可知，1（SGTH）和2（LQJ）两个居群优先聚类，4（LM）和5（YJF）聚为一支，居群的亲缘关系与地理距离及海拔高度有一定的相关性。
- 李艳鲁顺保刘晓燕江玉梅李思光朱笃
- 关键词：ISSR
- 穗花杉ISSR引物反应条件的优化与筛选被引量：25
- 2006年
- 在研究穗花杉（Amentotaxus aragotaenia）的遗传多样性过程中，为了获得清晰、重复性好ISSR扩增结果，对影响ISSR-PCR的多个因素包括模板浓度、Taq酶的选择和用量、Mg^2＋和dNTPs浓度及退火温度等指标等进行了筛选和优化，确定了穗花杉ISSRPCR分析的最适扩增条件：20μL PCR反应体系中，2μL 10×Taq酶配套缓冲液，1．8UTaq聚合酶（上海生工公司），0．2μmol·L^-1引物，0．18mmol·L^-1 dNTP，1．5～2．5mmol·L^-1 MgCl2，10ng·μL^-1模板DNA。用来自不同居群7个个体，以100个ISSR引物进行PCR扩增，筛选出扩增效果较好的10个引物。得到了92个位点，其中45个多态性位点，多态性位点比例为49％。
- 朱柏芳朱笃邓荣根李思光
- 关键词：ISSR引物筛选穗花杉
- 濒危植物华东黄杉种群遗传多样性ISSR分析被引量：4
- 2010年
- 采用ISSR分子标记技术分析了5个华东黄杉居群的遗传多样性水平和居群遗传结构。用10个引物对5个居群共76个样品进行扩增,共得到76条清晰的扩增带,其中69个位点为多态性位点。在物种水平上,多态性百分率(PPB)为90.79%,Nei’s基因多样性指数(H)为0.3361,Shannon’s信息多样性指数(I)为0.4974。在居群水平上,多态性位点百分率在56.58%～85.53%之间,Nei’s基因多样性指数为0.2084～0.2675,Shannon’s信息多样性指数为0.2695～0.4076。物种和居群遗传多样性水平都较高,居群间产生了一定的遗传分化(Gst=0.2366,Φst=26.88%)。由UPGMA聚类分析可知,在5个居群中,湖南阳明山两支与浙江临安先聚为一支,再与安徽休宁聚为一支,最后与江西三清山聚合。鉴于华东黄杉生境的特殊性和人为大量的砍伐,华东黄杉的数量逐渐减少,建议在华东黄杉分布区建立自然保护区,对其生存空间进行长期、有效的保护。
- 李艳鲁顺保刘晓燕江玉梅李思光朱笃
- 关键词：ISSR
- 突托蜡梅ISSR引物反应条件的优化与筛选被引量：9
- 2008年
- 为从突托蜡梅(Chimonanthus grammatus)叶片中提取高质量的总DNA,比较了CTAB法、改良的CTAB法、SDS法、高盐低pH值法、SDS-CTAB法、SDS-蛋白酶K法。结果表明:改良的CTAB是提取突托蜡梅基因组DNA的有效方法。以U811(GA)8C为引物,确立了适合突托蜡梅的ISSR反应体系:在20μL反应体系(50 ng DNA、0.6μmol/L引物、1.5 mmol/L Mg2+、0.15 mmol/L dNTPs、2.0 UTaqDNA聚合酶)中,反应程序为:94℃预变性5 min、94℃变性1 min、57.2℃退火45 s、72℃延伸2 min,循环40次,最后于72℃延伸5 min。用来自不同居群的7个个体,以100个ISSR引物进行PCR扩增,筛选出了扩增效果较好的10个引物,得到了74个位点,其中39个为多态位点,多态性位点比例为52.7%。
- 李艳江玉梅鲁顺保彭九生朱笃
- 关键词：DNA提取ISSR引物筛选
- 华东黄杉ISSR引物反应体系的优化与筛选被引量：3
- 2007年
- 在研究华东黄杉（Pseudotsuga gaussenii Flous）的遗传多样性过程中，为了获得清晰、重复性好的ISSR扩增结果，对影响ISSR—PCR的多个因素包括模板浓度、Mg^2＋浓度、dNTPs浓度、Taq酶的用量、退火温度和循环次数等指标进行了筛选和优化，确定了华东黄杉ISSR—PCR分析的最佳扩增条件为：20μL PCR反应体系中，2μL10×Taq酶配套缓冲液，1．5UTaq聚合酶（上海Promega公司），1．5—2．5mmol／L MgCl2，0．2μmol／L引物，0．2mmol／LdNTPs，10ng／L模板DNA。用来自江西三清山的4个个体，以100个ISSR引物进行PCR扩增，筛选出扩增效果较好的12个引物。
- 刘晓燕鲁顺保江玉梅李思光朱笃陈晖
- 关键词：ISSR引物筛选
