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广东省自然科学基金(5001672)
作品数:
3
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相关作者:
方丛
庄广伦
徐艳文
凌家炜
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相关机构:
中山大学附属第一医院
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发文基金:
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中山大学附属...
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中山大学学报...
1篇
中华生物医学...
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2010
2篇
2009
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不同体外受精周期所获生殖泡期卵母细胞体外成熟后结果比较
2009年
【目的】研究对比体外受精-单精子卵胞浆内注射(IVF-ICSI)周期所获生殖泡期(GV)不成熟卵母细胞以及体外成熟(IVM)周期所获GV期卵母细胞体外培养成熟后的胚胎发育情况。【方法】163个IVF-ICSI周期中所获987个成熟卵为Ⅰ组,所获GV期卵进行体外培养后成熟的132个卵为Ⅱ组,另有37个IVM周期中所获GV期卵体外培养后成熟的235个卵为Ⅲ组。对3组均进行ICSI,并对其受精率、卵裂率及胚胎发育进行比较。【结果】Ⅰ组的受精率、卵裂率以及优质胚胎率均显著高于Ⅱ组及Ⅲ组(分别为84.9%,98.1%和61.6%;72.0%,90.5%和22.1%;75.3%,94.4%和25.1%)。Ⅰ组的胚胎卵裂球数目及胚胎形态评分均显著优于Ⅱ组及Ⅲ组(P<0.05);Ⅱ组与Ⅲ组相比差异无统计学意义。【结论】体内成熟卵形成的胚胎形态好于生殖泡期卵体外培养成熟者,IVF-ICSI周期的生殖泡期不成熟卵形成的胚胎形态学上与IVM周期的类似。
方丛
苗本郁
钟依平
周灿权
庄广伦
关键词:
ICSI
体外成熟
利用基因芯片对少量细胞进行非整倍体检测的影响因素分析
2009年
目的评估利用微阵列-比较基因组杂交技术检测少量细胞非整倍体的准确率及相关影响因素。方法结合10K2.0单核苷酸多态性(SNP)基因分型芯片平台与多重置换扩增技术(MDA),计算并比较扩增模板为1.10个细胞时各染色体拷贝数分析的准确率,评估影响芯片平台的拷贝数准确率的有关因素及其对染色体拷贝数异常的实际分辨率。结果使用MDA—DNA作参照时,拷贝数分析的准确率[(79.3±2.9)%~(100.0±1.7)%]高于使用gDNA作参照时的准确率[(66.7±3.4)%~(89.5±3.3)%](P〈0.001)。随着模板增加至10细胞,芯片可在1M平滑化处理的同时获得94%的分析准确率。对于单细胞MDA产物,缺失型非整倍体具有比获得型非整倍体更高的分析准确率[1C组(71.9±4.1)%~(95.5±2.0)%;1C—sDel-4组(81.4±3.7)%~(99.6±2.8)%],各组间差异均有统计学意义(P〈0.01)。结论10K2.0SNP基因分型芯片平台结合多重置换扩增技术可有效对少量细胞进行非整倍体检测,选择MDA-DNA作为参照是提高分析准确率的最关键因素,而增加细胞模板与提升分析中的平滑化参数(即降低芯片的分辨率要求)也有助于改善拷贝数准确率,在同样的条件下,芯片更容易准确检出缺失型非整倍体。
凌家炜
方丛
徐艳文
庄广伦
曹宝强
关键词:
基因
核酸扩增技术
非整倍性
比较基因组杂交
少量细胞模板下多重置换扩增技术的保真度评估
2010年
目的应用单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片,检测以少量细胞(1~10个)为模板的多重置换扩增(multiple displacement amplification,MDA)产物的保真度。方法结合10K2.0SNP芯片平台与MDA,以纤维母细胞系GM02732(47,XY,+18)作为模板,共分6组进行实验,其中A组与B组分别为阳性对照组(细胞gDNA)与阴性对照组(无模板MDA);C-F组为实验组,分别以1、2、5和10个细胞为模板进行MDA扩增,产物与芯片杂交,检测并比较各组产物的基因组覆盖率、等位基因杂合性缺失(loss of heterozygosity,LOH)率以及等位基因脱扣(allele dropout,ADO)率。结果阴性对照组的MDA产物与gDNA序列有3.2%的重叠。随着起始模板从单细胞提升至10细胞,MDA产物的基因组覆盖率从86.4%逐步上升至96.4%,平均LOH率和ADO率则逐渐下降,各组之间比较差异均有统计学意义(P〈0.05)。结论多重置换扩增技术是一种高效而可靠的全基因组扩增方法,随着模板细胞的增加,MDA产物的保真度可获得明显的改善。10K 2.0SNP芯片可快速准确地在全基因组水平对DNA扩增产物进行保真度分析,但应注意区分LOH中的ADO和等位基因优势扩增,以避免产生误差。
凌家炜
方丛
徐艳文
庄广伦
曹宝强
关键词:
单核苷酸多态性
单细胞
多重置换扩增
微阵列芯片
保真度
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