国家自然科学基金(11104164)
- 作品数:3 被引量:7H指数:2
- 相关作者:王伟陈建中梁志强刘晓阳张庆刚更多>>
- 相关机构:山东交通学院山东师范大学济南职业学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金山东省自然科学基金博士科研启动基金更多>>
- 相关领域:生物学电子电信更多>>
- HIV-1蛋白酶与抑制剂3G3相互作用机制的分子动力学研究被引量:2
- 2013年
- HIV-1蛋白酶已经成为治疗艾滋病药物设计的重要靶标.本文采用分子动力学模拟和MM-PB/SA方法计算了抑制剂3G3与HIV-1蛋白酶的结合自由能,结果表明范德华作用驱动了3G3与蛋白酶的结合.同时也采用了基于残基的自由能分解方法计算了抑制剂-残基相互作用,结果证明残基Ala28,Val32/Val32′,Ile47,Gly49,Ile50/Ile50′,Ile84/Ile84′和Pro81′能与蛋白酶产生较为强烈的相互作用,同时也表明CH-π,π-π和CH-O相互作用控制了3G3与蛋白酶的结合.我们期望这个研究能为抗艾滋病的药物设计提供理论上的指导.
- 伊长虹梁志强王伟尹妍妍李洪云陈建中
- 关键词:分子动力学模拟
- 基于高重复频率飞秒激光直写技术制作衍射光栅的研究被引量:2
- 2016年
- 基于由光子晶体光纤飞秒激光器产生的高重复频率飞秒激光搭建了飞秒激光微加工系统,利用LabVIEW编写程序精密控制三维移动平台的移动路径和高速快门,在加工功率为1.5W、移动速率为1mm/s时,利用直写技术在无胶铬版上得到了微米量级的任意形状的平面衍射光栅。利用CCD相机对光栅制备过程进行实时监视,保证了光栅的加工质量。制备的光栅在显微镜下观察,条纹边缘清晰、线纹粗细均匀。使用He-Ne激光照射加工的光栅,可以获得清晰、稳定、与理论符合很好的夫琅和费(Frauhofer)衍射图样,显示了所加工的光栅具有良好的光学性能。实验结果也表明了光子晶体光纤飞秒激光在光栅制作过程中所具备的良好的加工性能。
- 王伟梁志强陈建中
- 关键词:超快光学光子晶体光纤光栅
- 分子动力学研究抑制剂pDI6W与MDM2的相互作用机制被引量:3
- 2012年
- p53-MDM2相互作用已经成为治疗癌症药物设计的重要靶标.本文采用分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics-Possion-Boltzmann surface area)方法计算了肽类抑制剂pD16W与MDM2的结合自由能,结果证明范德华作用是pD16W与MDM2结合的主要力量.相关矩阵的计算结果表明pD16W的结合主要诱导了MDM2内部的反相关运动.基于成对残基的自由能分解计算不仅证明pD16W的5个残基Phe19′,Trp22′,Trp23′,Leu26′和Thr27′能够与MDM2产生较强的相互作用,而且确认了CH-π,CH-CH和π-πc相互作用驱动了pD16W在MDM2疏水裂缝中的结合.这为抗癌药物的设计提供了理论上的指导.
- 陈建中梁志强张庆刚刘晓阳王伟刘进庆
- 关键词:分子动力学MDM2相关矩阵