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国家科技支撑计划(2004BA526B10)
作品数:
2
被引量:6
H指数:2
相关作者:
汪登强
姚雁鸿
何文辉
何力
孔令富
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相关机构:
中国水产科学研究院长江水产研究所
上海海洋大学
云南农业大学
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发文基金:
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生物学
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2013
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湘西盲高原鳅线粒体DNA遗传多样性分析
被引量:4
2013年
对取自湖南湘西自治州龙山县乌龙山3个不同洞穴的湘阿卣高原鳅(Triplophysaxiangxiensis)群体82尾样本的线粒体细胞色素b(Cytb)基因序列和控制区(D—loop)序列进行了研究,分析了其遗传分化及遗传多样性。湘西占高原鳅线粒体Cytb堆W序列片段长1140bp,D—loop序列片段长934bp,在D—loop中发现6个多态位点且均为单一变异位点,D—loop序列中检测到7个啦倍体,其单倍型多样性指数(h)在0.083至0.282之间,其核苷酸多样性(pi)指数范嗣为0.00009~0.00032。3个采样群体的遗传多样性均较低。令部样本的Cytb序列均一致,小存在变异,4种碱基T、C、A、G含链分别是28.3%、28.6%、28.1%、15.0%,AT含量较高。D—loop的分子变异方差分析(AMOVA)结果显示湘西占高原鳅遗传变异系数Fst=-0.0089,总遗传变异中,各年度种群内变异为100.89%,年度种群问变异为-0.89%,变异主要来自年度种群内部。
姚雁鸿
牟东
汪登强
孔令富
何力
何文辉
关键词:
线粒体DNA
控制区
细胞色素B
湘西盲高原鳅遗传多样性的微卫星分析
被引量:2
2013年
利用筛选的16对微卫星标记对来自于湖南湘西龙山县乌龙山3个不同洞穴的盲高原鳅群体进行遗传多样性及遗传分化分析。通过计算多态信息含量、平均杂合度、等位基因数、遗传距离、基因流、F-统计量等参数,评估各盲高原鳅群体遗传多样性和各群体间遗传分化。16个微卫星标记在3个群体中共检测出83个等位基因。每个座位检测到3~8个等位基因不等。3个群体各个多态位点的平均观测杂合度分别为0.362 5~0.946 5,平均期望杂合度为0.538 6~0.906 5。3个群体多态微卫星位点的PIC分别为0.263 2、0.231 3、0.303 5,选取的16个微卫星位点中2个为高度多态,2个为低度多态,其余为中度多态。分子变异方差分析(AMOVA)结果表明,遗传变异大部分(92.84%)来自群体内,仅有7.16%的变异来自于群体间,数据表明3个群体处于未分化状态,遗传一致性较大。
姚雁鸿
孔令富
汪登强
何文辉
何力
余来宁
关键词:
微卫星
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