国家自然科学基金(21211140340)
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
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- DNA碱基(对)及其Zn^(2+)复合物对CO_2,N_2,H_2小分子的吸附被引量：2
- 2014年
- 用M062X/6-31+G*方法探讨了腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)及其碱基对(AT,GC)以及Zn2+复合物(AAA-Zn2+,AAT-Zn2+和GGC-Zn2+)对混合小分子H2,N2,CO2的吸附情况,系统研究了其相互作用模式及吸附强度,预测了常见混合气体分子与碱基(对)及复合物的吸附位置.研究表明,CO2倾向于以氢键的形式结合到碱基(对)的氨基氢或亚氨基氢上,而N2和H2分子则倾向于结合到这些碱基(对)的平面π电子上,以堆垛的形式存在.根据吸附强度大小,预测了由这些碱基为骨架合成的金属有机骨架(MOF)吸附材料对小分子的选择性吸附顺序为H2
- 师帅黄曦明艾洪奇
- 关键词：氢键金属有机骨架材料
- 质子化作用对Aβ_(1—16)单体结构特征和聚集机理的影响被引量：1
- 2013年
- 利用副本交换分子动力学模拟研究了Aβ肽(β-Amyloid peptide)N末端部分Aβ1—16单体在pH为7.0,6.3及5.5水溶液状态下的结构特征以及聚集机理.通过建模确定了不同pH状态下Aβ1—16肽链的质子化位置(残基),通过模拟比较了不同酸性溶液状态下Aβ1—16单体的结构和能量变化.结果表明,在中性条件下,Aβ1—16单体保持自由卷曲结构,而在酸性状态下,其结构由最初的无序状态向有序状态转变,模拟过程中β-折叠结构会间歇性产生,预示着单体可以发生自聚集现象.本文所得结论,即酸性状态下的Aβ1—16单体质子化位及模拟过程中的结构变化,可用于酸性状态下金属离子与Aβ1—16可能的残基结合位及结合数量的有效预测和评估.
- 石虎程珊珊艾洪奇
- 关键词：分子动力学模拟质子化作用结构特征
