国家自然科学基金(30860319)
- 作品数：5 被引量：27H指数：3
- 相关作者：罗达亚朱伟锋熊小亮杨晓红刘卓琦更多>>
- 相关机构：南昌大学中央民族大学中国中医科学院望京医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江西省卫生厅科技计划项目江西省教育厅科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- CpG岛靶向siRNA诱导P16沉默的甲基化分析
- 2013年
- 目的探讨RNA介导DNA甲基化(RdDM)是否参与哺乳动物细胞中P16基因的甲基化沉默。方法将靶向P16基因CpG岛不同位点(启动子区和外显子区)的小干扰RNA(siRNA),分别转染人胃癌细胞系BGC823,用RTPCR、免疫印迹检测P16基因的表达,用甲基化特异性PCR(MSP)和克隆测序等分析DNA甲基化。结果靶向P16基因启动子与外显子区域的siRNA均能诱导P16基因表达的降低,但两者都不能诱导同源序列DNA甲基化。结论在BGC823细胞系上,siRNA不能通过甲基化诱导方式调控P16基因的表达。
- 杨晓红黄孝天朱伟锋刘卓琦余乐涵李华王晟罗达亚
- 关键词：CPG岛SIRNAP16
- 盐析法快速提取口腔拭子DNA被引量：4
- 2011年
- 目的建立盐析法快速从口腔拭子中提取基因组DNA的方法。方法首先以细胞裂解液和蛋白酶K消化口腔上皮细胞,然后用5 mol/L NaCl沉淀蛋白质,用异丙醇沉淀DNA,最后用70%乙醇洗涤得到的DNA并将其溶于TE(10mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L EDTA,pH 8.0)中。用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对TP53基因的rs1042522和CHRNA3基因的rs12910984位点进行分型。对不同基因型的样本测序验证。结果单支口腔拭子提取得到的DNA量在0.68～2.56μg之间,D260/D280比值在1.77～1.94之间。经PCR扩增和酶切消化,10个样本的两个单核苷酸多态性都得到了清楚分型。酶切结果与测序结果吻合。结论本实验所建立的盐析法可以快速、简便、经济地从口腔拭子得到高质量的基因组DNA。
- 朱伟锋罗达亚涂硕张霞丽揭克敏万福生
- 关键词：盐析DNA提取单核苷酸多态性
- INK4/ARF基因座甲基化协同调控与非小细胞肺癌的关系被引量：2
- 2011年
- 目的分析INK4/ARF基因座甲基化状态与非小细胞肺癌临床病理特征的相关性及探讨基因座内各编码基因甲基化协同调控的可能性。方法临床收集81例非小细胞肺癌患者手术切除的配对癌灶及癌旁石蜡组织标本,采用甲基化特异性PCR对石蜡组织标本DNA进行p16INK4a、p15INK4b及p14ARF基因甲基化检测,并分析其与临床病理特征的关系。结果癌灶组织中的p16INK4a基因甲基化在鳞状细胞癌中的分布明显高于腺癌(P<0.01),并与肿瘤大小密切相关(P<0.05)。癌灶组织中p16INK4a与p15INK4b基因甲基化状态密切相关(P<0.05)。结论 INK4/ARF基因座启动子区甲基化与非小细胞肺癌发生、发展相关,p16INK4a与p15INK4b基因甲基化状态的关联提示INK4/ARF基因座可能存在表观协同调控方式。
- 张建龙栾亚楠张璐林倍思刘艳华熊小亮罗达亚
- 关键词：甲基化非小细胞肺癌
- 蒙药草乌毒性研究进展被引量：15
- 2011年
- 1引言
草乌（蒙药名：泵阿）为毛莨科北乌头（Aconitum kusnezotfii Reichb．）的干燥块根。草乌生品有剧毒，据《无误蒙药鉴》记载，草乌是泵阿的一种。多数蒙药本草记载有草乌（泵阿分为白，红，黄，黑4种；前3种常被认为是无毒泵阿，而后1种为有毒或毒性较大）。根据文献记载及蒙医临床应用经验认定草乌为有毒泵阿。
- 李福全李志勇王朝鲁图雅张嫚
- 关键词：蒙药草乌
- 乳腺癌转移相关microRNA-200c调控的基因网络分析被引量：6
- 2013年
- 目的:结合生物信息学分析手段,筛选乳腺癌转移相关微RNA(microRNA,miRNA)-200c调控的基因网络。方法:采用Aymetrix miRNA生物芯片分析12株乳腺细胞中差异表达的miRNA;应用脂质体转染法将miR-200c模拟物(mimic)转入4株高转移性的乳腺癌细胞株(BT549、HS578T、MDA-MB-231和SUM159PT)中,再用Aymetrix mRNA生物芯片检测转染miR-200c mimic后高转移性乳腺癌细胞株中差异表达的基因。采用生物分子功能注释系统(Capital Bio Molecule Annotation System,MAS),筛选miR-200c调控的信号通路与基因网络。结果:12个乳腺细胞株中筛选出9个差异表达的miRNA(P<0.01,倍数值≥20或≤-20),其中以miR-200c在高转移性乳腺癌细胞株中下调幅度最显著。4个转染miR-200c mimic的乳腺癌细胞株中共有33个共上调基因及13个共下调基因。实时荧光定量-PCR与蛋白质印迹法验证结果显示,共调基因锌指E框结合同源框1(zinc finger E-box binding homeobox1,ZEB1)mRNA和蛋白在4个转染细胞株中均下调。MAS生物信息学分析结果显示,转染miR-200c mimic的乳腺癌细胞株中共有的差异表达基因相关信号通路包括嗅觉传导(olfactory transduction)通路、细胞因子-细胞因子受体关联(cytokine-cytokine receptor interaction)通路和细胞黏附分子(cell adhesion molecules,CAMs)通路等,不同的信号通路可以通过共调基因相互联系,在特定的信号通路中,共调基因间也存在密切的相互联系。结论:以高通量生物芯片检测为基础,运用生物信息学分析手段,多元化筛选获得miR-200c调控的基因网络,为后续展开miR-200c作用机制的研究提供了明确的方向。
- 王晟肖影群刘卓琦杨晓红熊小亮朱伟锋石慧东罗达亚
- 关键词：乳腺肿瘤微RNA肿瘤转移系统生物学
