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TENP-PBS预处理在提取土壤DNA中的应用被引量：3: 2010年; 以一种土壤DNA直接提取法为基础,比较了TENP-PBS预处理在土壤DNA提取中的应用效果。OD260/OD230和OD260/OD280以及PCR扩增结果表明,在提取DNA之前用TENP-PBS对土壤进行预处理可以有效去除腐殖酸污染,提高DNA纯度。; 宋培勇马莉莉; 关键词：DNA提取 PCR

稻田土壤DNA的提取及nifA基因的PCR扩增: 2011年; 为弄清茅贡米土壤微生物群落结构和生物固氮等代谢活动机制,采用试剂盒、SDS高盐和土壤预处理+SDS高盐3种土壤DNA提取方法,以从贵州茅贡米基地采集的土样提取的宏基因组DNA为模板,进行nifA基因的PCR扩增,比较了3种土壤DNA提取方法的效果。结果表明,试剂盒提取的DNA扩增到约200bp和900bp的nifA基因片段,SDS高盐法、预处理+SDS高盐法提取的DNA仅扩增到约200bp的nifA基因片段,土壤预处理对提高DNA纯度有一定的效果;3种方法都可以从土壤中提取到约23kb大小的DNA片段,但DNA得率和纯度存在一定的差异。; 魏志琴宋培勇杨秀荣马莉莉; 关键词：稻田土壤 DNA提取方法宏基因组 NIFA基因聚合酶链式反应

赤水河流域土壤放线菌及其拮抗活性研究被引量：1: 2013年; 从贵州赤水河流域茅台镇及周边地区采集土样,用高氏1号培养基从6份土样中共分离到放线菌32株,根据形态学和生理生化特征,从中筛选15株进行分子鉴定和系统发育树分析,16S rDNA测序比对结果表明:MA06为白色类诺卡氏菌(Nocardioides albus),MA24为原小单孢菌(Promicromonospora),其余13株为链霉菌(Streptomyces),其中MA03为极暗黄链霉菌(Streptomyces fulvissimus),MA14为Streptomyces europaeiscabiei,MA07属Streptomyces sp.。通过构建系统发育树发现:15株放线菌分离株聚为三支,MA06和MA24各单列一支,其余的聚为第三大支,进一步表明了链霉菌属、类诺卡氏菌属和原小单孢菌属相互之间亲缘关系较远。抗菌活性检测发现M07、M25、M30和M32抗菌作用强,预示其作为生防资源菌和抗生素产生菌的潜在价值。; 宋培勇郑亚强李斌肖仲久; 关键词：赤水河流域土壤放线菌 RDNA 系统发育分析抗菌活性

南方红豆杉内生细菌分离鉴定及系统发育分析被引量：5: 2012年; 目的:了解南方红豆杉内生细菌类群及其系统发育关系;方法:对分离菌株进行形态学、生理生化和分子鉴定,并做系统发育分析。结果:从南方红豆杉茎、皮和叶中共分离到内生细菌52株。对12株内生细菌16S rDNA进行PCR扩增,扩增产物大小约为1 400 bp,对11株内生细菌16S rDNA测序结果,用BLAST软件进行相似性比对,发现TB02株为Enterobacter属,相似性99%;9株为Bacillus属,相似性99%～100%;TB13株为Lysinibacillus,相似性97%。通过构建系统发育树发现这11株内生细菌明显聚为两大支。结论:11株内生细菌分别鉴定为肠杆菌、芽孢杆菌和Lysinibacillus,芽孢杆菌为南方红豆杉内生细菌优势菌属。芽孢杆菌和Lysinibacillus亲缘关系较近,二者和肠杆菌之间亲缘关系较远。; 宋培勇兰琴英鲁卓越; 关键词：南方红豆杉内生细菌系统发育分析

宏基因组学——研究环境微生物的钥匙被引量：6: 2009年; 介绍了宏基因组学的发展概况、基本研究方法和在微生物研究中的应用,并对该学科的发展前景进行了展望。; 马莉莉宗浩宋培勇; 关键词：宏基因组微生物基因文库

4株桫椤内生细菌的分离鉴定及系统发育分析被引量：5: 2013年; 为了探索植物桫椤内生细菌及其进化关系,对用植物内生菌一般分离培养方法获得的4株内生细菌,从形态学、生理生化特征以及16S rDNA PCR扩增、测序和BLAST比对等进行了综合鉴定和系统发育分析.根据形态学和生理生化特征以及16S rDNA相似性比对,将内生细菌ASP17和ASL21初步鉴定为苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis);将ASL24初步鉴定为Lysinibacillus属,而ASL23可能为与Lysinibacillus相近但不同的属.系统发育分析表明:4株内生细菌中ASP17和ASL21聚为一支,亲缘关系较近;ASL23和ASL24聚为一支,亲缘关系较近.; 宋培勇李林肖仲久李小霞; 关键词：桫椤内生细菌 RDNA 系统发育分析

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贵州省科学技术基金(20082103)