公共文化服务平台

共 4 条记录，以下是 1-5

全选清除导出

排序方式：

非同位素反向Northern筛选法被引量：6: 2004年; 此文介绍了一种非同位素简单快速的反向Northern筛选方法。采用非同位素法标记探针,操作简便,不涉及污染环境。在杂交过程中采用三次校正,结果可靠,重复性好。该方法能有效地,高通量地验证差异表达基因。; 张宇伟来茂德; 关键词：非同位素 NORTHERN

结肠腺瘤-正常文库的生物信息学分析被引量：2: 2006年; 为进一步分析腺瘤相对正常SSH文库(A-N)的差异表达候选基因的表达谱,结合通用的生物信息学软件,自行开发、搭建包括核酸自动分析平台及GetUni软件包的生物信息学平台,实现了将A-N文库109个差异克隆序列与本地下载的非冗余核酸数据库、人UniGene数据库比对、聚类,至获取差异表达候选基因的自动化分析。对这些基因进行GOTM(GOTree Machine)初步生物信息学分析及RT-PCR验证。结果共发现62个候选基因,包括6个核糖体蛋白成员,6个免疫相关基因。Reg4和FAM46A两个基因出现频次最高,分别为13次和4次,半定量RT-PCR显示这两个基因分别在10/10和9/10例腺瘤相对正常黏膜表达上调。对于这些差异表达候选基因的进一步分析和研究将有助于揭示结肠腺瘤发生的分子机制。; 吕炳建崔晶徐静张昊罗敏捷朱益民来茂德; 关键词：结肠腺瘤黏膜基因表达 UNIGENE

结肠腺瘤-正常文库的分析: 目的系统分析结肠腺瘤相对正常结肠黏膜抑制性差减杂交(SSH)文库(A-N),获取差异基因表达谱,阐明结直肠癌发生发展的分子机制,寻找肿瘤早期诊断的分子标志物。方法自行开发软件、搭建了物信息学分析平台。利用该平台 A-N ...; 徐静吕炳建张昊罗敏捷来茂德; 关键词：SSH 基因表达核糖体蛋白; 文献传递

应用CGH数据和树模型探索癌症的发病机理被引量：1: 2008年; 比较基因组杂交技术(comparative genomic hybridization,CGH)主要用于检测肿瘤的染色体缺失和扩增,迄今已积累了大量的实验数据,为全基因组分析肿瘤的发生机制提供了可能。树模型在生物信息学领域通常被用于研究生物形成和进化的历史,物种之间的进化关系常以系统发生树来表示。树模型同样可以作为一种有力的生物信息学工具来分析CGH数据,探索癌症的发病机理。文中介绍了两种常见的树模型——分支树和距离树,详细叙述了重建树模型的基本原理和方法,分析了创建树模型时要注意的几个技术问题,并对其在肿瘤研究中的应用进行了回顾和总结。肿瘤的树状模型作为单路径线性模型的泛化,克服了以往单路径线性模型的缺点,理论上能更加精确地概括到肿瘤的多基因、多路径、多阶段的发生发展模式,从不同角度探讨肿瘤发生发展的分子机制。该模型除可用于分析肿瘤的CGH数据外,还可用于分析其他多种类型的数据,包括微阵列CGH(array-CGH)技术等产生的高分辨率数据。; 李小波陈俭吕炳建来茂德; 关键词：树模型

结肠正常黏膜和腺癌中差异表达基因的生物信息学分析被引量：8: 2004年; 目的 :系统地分析由 SSH方法获得的结肠正常黏膜和腺癌的差异表达基因。方法 :构建基于 L inux的核酸自动分析平台 ,对用 SSH方法获得的 3个文库之一的 T- N差减文库进行分析。用半定量 RT- PCR对部分结果进行验证。结果 :成功构建了基于 Linux的核酸自动分析平台 ,得到了 15个 contigs,其中与已知基因相匹配的有 13个(T- N) ,未与已知基因匹配或者意义未明的有 2个 ;部分基因的半定量 RT- PCR发现 ,人胸腺素 β4 (H omo Sapiensthymosin beta4 ,THY)和人乙型肝炎病毒 x抗原反式活化蛋白 2 (H omo Sapiens H bx Ag transactivated protein2 ,XTP)的表达从正常黏膜 -腺癌有逐步增高的趋势。结论 :构建基于 L inux的核酸自动分析平台是系统分析核酸序列的有效方法 ,根据对 3个文库的系统分析结果 ,为进一步阐明结肠肿瘤分子机制提供了许多有价值的信息。; 谷雪梅张昊来茂德; 关键词：结肠腺癌

全选清除导出

共1页<1>

国家自然科学基金(30371605)