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国家自然科学基金(60405001)
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相关作者:
孙秋凤
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基于混合核和加权SVM的microRNA前体识别算法
2013年
MicroRNA是一种单链RNA小分子,是由具有发夹结构的、更长的单链RNA前体经加工后生成。相比microRNA序列本身而言,其前体序列和二级结构隐含了更多的可识别特征与信息。因此可利用加权Levenshtein距离,结合其前体序列和二级结构构造一个指数核函数。结合SVM构造识别模型,鉴别真假前体。在用5折叠法得到最佳识别模型后,对人类数据进行测试。实验结果显示,新方法表现出了较好的识别精度,和较高的敏感性与特异性。
孙秋凤
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支持向量机
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