国家自然科学基金(30860158)
- 作品数：7 被引量：18H指数：2
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- 小立碗藓LysM型类受体激酶基因家族生物信息学分析被引量：3
- 2021年
- 植物LysM型类受体激酶(lysin motif receptor-like kinase,LYKs)是植物中发现的一类重要的RLK,在植物生长发育、抵御逆境胁迫等方面具有不可忽视的作用,是植物中基因功能的研究热点。为更好地了解小立碗藓中的LYK基因,该文利用生物信息学的方法对小立碗藓(Physcomitrella patens)LysM型类受体激酶基因家族成员进行鉴定及分析。通过分析小立碗藓LYK家族成员的基本物理信息、基因结构、染色体定位及系统发生关系,初步探讨了其LYK基因结构、进化与功能间的联系。结果表明:(1)小立碗藓中共有21个LYK基因,其氨基酸序列大小在625~755 aa之间,分子量为69.54~82.02 kDa,等电点在5.98~7.78之间。(2)将小立碗藓所有LYK蛋白与3种典型模式植物(水稻、拟南芥和蒺藜苜蓿)的LYK蛋白共同构建系统进化树,所有LYK蛋白被分为4个亚组(LYK-I、LYK-Ⅱ、LYR-I和LYR-Ⅱ)。小立碗藓各亚组内成员的基因结构、保守域特征显示出较为相似的特征,由此推测其可能具有相同或相似的功能。(3)染色体定位发现21个LYK基因集中分布于4条染色体上并出现小型基因簇,这可能与基因功能相联系。该文分析了小立碗藓LysM型类受体蛋白激酶基因家族的基本信息,可为后续深入研究其LYK基因家族成员的生理生化功能奠定基础。
- 高梅辛健康姜山
- 关键词：小立碗藓基因家族染色体定位系统进化关系
- 药用苔藓植物银叶真藓和泥炭藓组织培养基配方研究被引量：7
- 2012年
- 该实验用银叶真藓和泥炭藓为外植体,以不同体积质量分数的Knop培养基、微量元素、酒石酸铵和糖类为因子,采用正交试验设计的方法,研究影响两种苔藓植物配子托和银叶真藓原丝体生长的主要因子.研究结果显示:①在以上4种因子中,糖类是影响两种苔藓植物生长的主要因子,葡萄糖或蔗糖的体积质量分数在接近5g/L时最有利于两种苔藓植物生长;②银叶真藓原丝体液体培养,采用未经稀释的knop培养基效果最好,而在固体培养基上培养银叶真藓和泥炭藓配子托,采用稀释2倍的Knop培养基效果最好;③酒石酸铵对泥炭藓配子托生长的影响程度仅次于糖类,是比较重要的因子.
- 姜山田学武
- 关键词：泥炭藓
- 小立碗藓C3H基因敲除载体的构建及C3H1-nptⅡ?C3H2目的片段最佳PCR条件筛选被引量：2
- 2016年
- 以小立碗藓作为试材,将总长为1 981bp的小立碗藓C3H基因分为上游片段(1 000bp),下游片段(981bp),并以此设计引物,得到上游臂(C3H1,735bp)、下游臂(C3H2,700bp)。在C3H1引物设计时引入XhoI、EcoRV酶切位点到两端,C3H2设计时引入NdeI、BamHI酶切位点到两端。以小立碗藓总DNA为模板,通过PCR扩增得到C3H1和C3H2片段。将C3H1和C3H2插入到pTN182载体中,获得敲除载体(C3H1-pTN182-C3H2质粒),通过PCR获得C3H1-nptⅡ?C3H2目的片段,并且采用单因素方法研究引物浓度与退火温度对PCR产物浓度及特异性的影响。结果表明:引物浓度为0.20μmol/L,退火温度为58.7℃,PCR产物特异性最高且产物浓度较高。
- 崔彩云晏国洪姜山
- 关键词：H基因基因敲除退火温度
- 苔藓植物化学成分及抑菌作用的研究进展被引量：2
- 2012年
- 苔藓植物是没有维管束的陆生植物,分为藓纲、苔纲和角苔纲3类。近年来的研究表明,苔藓植物能产生萜类、黄酮类及联苄类等生物活性物质,其中许多对病原真菌和细菌具有良好的抑制作用,是天然抗菌药物的重要来源。本文主要介绍苔藓植物的化学组成及其抑菌作用的研究情况。
- 余治锦姜山
- 关键词：苔藓植物化学成分抗细菌活性抗真菌活性
- 小立碗藓扩展蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析被引量：2
- 2020年
- 扩展蛋白(Expansins,EXP)是一类基因家族,几乎参与了植物发育的全过程,从种子萌发到果实成熟都有扩展蛋白的参与。该研究利用生物信息学的方法对小立碗藓(Physcomitrella patens)Expansin基因家族成员进行鉴定,分析了其基因结构、染色体定位以及系统发生关系。结果表明:小立碗藓基因组中含有Expansin A(EXPA)32个、Expansin-like A(EXLA)6个,并未发现Expansin-like B(EXLB)及Expansin B(EXPB)。扩展蛋白氨基酸序列长度在228~290 aa之间,编码蛋白质具有两个保守的结构域Pollenallerg1和DPBB1。蛋白质亚细胞定位预测结果表明:运用CELLO在线工具预测发现小立碗藓中约4/5的EXP家族基因定位于细胞外;而Euk-mPLoc预测结果则显示小立碗藓EXP基因家族成员全定位于细胞外。基因结构分析表明,小立碗藓中约68%Expansin基因有含有1~3个内含子。以上结果可为深入研究小立碗藓扩展蛋白基因的分子进化与生物学功能奠定基础。
- 蓝雨纯黄彬韦娇姜山
- 关键词：小立碗藓基因家族生物信息学
- 长期保存活力低下的大肠杆菌制备感受态细胞条件的优化被引量：2
- 2015年
- 研究了Ca Cl2溶液处理方法、长期保存的原始菌种活化次数、离心条件对感受态细胞最终转化效率的影响,并分析其最佳转化效率参数、优化感受态制备和转化方法。结果发现:使用过滤处理的Ca Cl2比灭菌处理的Ca Cl2制备的感受态细胞转化效率高。在其他条件相同的情况下,长期保存的大肠杆菌菌种活化3次以上的转化率最高;制备感受态细胞第1次离心在4℃、4 000 g条件下离心15 min,第2次离心时在4℃、4 000 g条件下离心5 min得到的感受态细胞转化率最高。
- 晏国洪姜山
- 关键词：大肠杆菌感受态细胞转化率
- 小立碗藓CAD1基因敲除载体的构建及酶切方法优化被引量：1
- 2016年
- 苔藓植物能否合成木质素目前还存在一定的争议。肉桂醇脱氢酶(CAD)催化木质素单体合成的最后一步反应,Real-TimePCR表达分析表明,小立碗藓CAD1基因在接种灰霉菌后的第2天表达量迅速上升。本试验利用PCR技术,以小立碗藓基因组DNA为模板,使用Primer5-Cracked设计的引物,扩增出小立碗藓CAD1基因的上、下游同源臂基因片段。酶切CAD1上游同源臂和pTN182原始质粒,经连接酶连接、转化至感受态大肠杆菌,筛选出阳性株。采用裂解液裂解、质粒DNA提取、质粒PCR以及酶切进行验证,得到CAD11-pTN182。采用同样的方法把下游片段转入CAD11-pTN182,即得CAD11-pTN182-CAD12,最后进行测序分析。结果表明,已成功构建CAD11-pTN182-CAD12敲除载体,并将该重组质粒转入目的菌株大肠杆菌中保存备用,可为后续进行小立碗藓CAD1基因敲除,验证小立碗藓CAD1基因功能,进一步了解模式植物小立碗藓防卫反应机理研究奠定良好基础。
- 赵春燕晏国洪姜山
- 关键词：小立碗藓基因克隆酶切
