北京市教育委员会科技发展计划(KM20060025011)
- 作品数:1 被引量:1H指数:1
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- 蛋白质功能位点和结构域与人类蛋白质互作关联分析
- 蛋白质是实现生命活动的基本单位,蛋白质间的相互作用对于实现生物功能极其重要。功能位点和结构域作为蛋白质上的特征结构,具有重要的生物学意义。我们的工作是基于蛋白质功能位点和结构域数据,对蛋白质进行分类,并检验每个类别中存在...
- 王靖李霞高磊朱明珠杨德武
- 关键词:蛋白质功能位点结构域
- 文献传递
- 酵母基因表达相关性与蛋白质互作网络距离分析
- 随着基因芯片技术和蛋白质互作检测技术的发展,对基因表达相关性与蛋白质互作关系的研究已受到越来越多的关注,本文以研究相对比较完善的酵母物种作为研究对象,对2467个酵母基因表达谱数据和MIPS提供的15660条蛋白质互作数...
- 朱明珠高磊李霞
- 关键词:基因表达谱相关系数
- 文献传递
- 结合多种数据源的功能模块分析
- 基因型与表型间的相关关系研究是生物信息学中的一个热点问题。本文通过基因表达差异值和IBD值对单核苷酸多态位点(SNP)和基因之间的相关关系进行了分析。通过t值对SNP和基因对间的相关系进行评价,并找到了大量SNP-GEN...
- 高磊朱明珠刘志成李霞
- 关键词:基因表达谱IBD
- 文献传递
- 离子通道蛋白质互作网络中的拓扑特性分析
- 离子通道蛋白是细胞膜上控制离子进出的功能蛋白,在细胞生命活动中发挥着重要的作用。离子通道蛋白的研究对阐明生物体内跨膜蛋白的结构、互作和功能具有重要意义。本文基于目前可获得的人类蛋白质互作数据和人类离子通道蛋白质互作数据,...
- 王磊高磊刘志成李霞
- 关键词:离子通道拓扑特性
- 文献传递
- 人类蛋白质互作网络hub蛋白与其结构域关联分析被引量:1
- 2008年
- hub蛋白质作为参与较多互作的"中心蛋白",在实现蛋白质功能和生命活动中发挥着关键作用.而结构域作为蛋白质上的基本功能区域,决定着蛋白质功能及蛋白质互作的情况.互作网络中hub蛋白质和结构域对于蛋白质功能的实现均起到决定性的作用.对蛋白质互作与结构域的关系分析表明,蛋白质互作与结构域之间存在着密切的联系.对人类蛋白质互作网络中的hub蛋白与结构域进行关联分析,探讨hub蛋白及其互作partner与结构域数目之间的关系,并通过hub蛋白质之间的互作对相应结构域的关系进行进一步的论证.
- 王靖李霞朱明珠肖雪
- 关键词:蛋白质互作网络连通度结构域
- 离子通道基因表达谱及其亚型一致性的研究
- 本文从离子通道表达谱数据出发,采用了除噪、标准化、主成分分析等方法对此套数据进行分析,再用模糊C-均值算法对预处理后的数据进行分类,研究此分类与其生物学亚型之间的一致性。结果进一步证实了可以通过基因表达谱的分析实现对离子...
- 杨德武李霞朱明珠王靖肖雪
- 关键词:离子通道基因表达谱一致性
- 文献传递