国家自然科学基金(31170300)
- 作品数：4 被引量：46H指数：4
- 相关作者：丁小余薛庆云侯北伟刘薇童文君更多>>
- 相关机构：南京师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 新型联合片段:nrDNA ITS+nad 1-intron 2在枫斗类石斛鉴定中的意义被引量：10
- 2015年
- 本文从线粒体基因片段入手,利用PCR技术扩增出17种枫斗类石斛39个个体的线粒体基因co I、nad 5部分序列及nad 1-intron 2序列,nr DNA ITS及叶绿体基因序列rbc L、mat K、psb A-trn H,同时筛选出合适的基因片段来研究多片段联合在枫斗类石斛植物鉴定方面的应用。结果表明:在7个基因片段中,nr DNA ITS、nad 1-intron 2和psb A-trn H的序列变异度较高,可用于枫斗类石斛的鉴定。但是,仅利用单一序列无法对细茎石斛及霍山石斛进行鉴别。而nr DNA ITS+nad 1-intron 2新型联合片段构建的UPGMA树与其他联合片段相比,更能有效的对枫斗类石斛基原植物进行鉴别并可区分细茎石斛及霍山石斛。此外,借助nr DNA ITS+nad 1-intron 2新型联合片段构建的UPGMA树对3个待检种进行了成功鉴别,分别为霍山石斛、细茎石斛和铁皮石斛。本研究首次将nr DNA ITS与线粒体基因片段联合用于枫斗类石斛的鉴定,为石斛药材的鉴别提供了可靠的科学依据,同时也将对规范枫斗类石斛市场提供理论指导。
- 耿丽霞郑瑞任洁牛志韬孙宇龙薛庆云刘薇丁小余
- 基于TRAP分子标记的铁皮石斛野生居群的分析与鉴别被引量：12
- 2016年
- 本文根据铁皮石斛多糖合成途径中磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因(PEPC)、尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)和生物碱合成过程中苯丙氨酸解氨酶基因(PAL)构建目标区域扩增多态性(TRAP)分子标记,对铁皮石斛野生居群及其杂交后代进行分子鉴别。结果表明,在54对TRAP引物中,筛选出的7对引物可将铁皮石斛野生居群鉴别开。同时,在杂交后代中均能检测到父母本特征条带和新产生条带,能够有效地将亲本及其杂交后代鉴别开来。聚类分析表明,当以云南广南铁皮石斛为亲本时,正反杂交后代均先与其聚为一支,再与另一亲本聚为一支,体现了子代与云南广南铁皮石斛的亲缘关系较近。采用TRAP分子标记对铁皮石斛野生居群及其杂交后代进行分子鉴别,有利于选择优质居群进行人工培育,实现了杂交后代的早期鉴别,提高种质质量的控制,为改善铁皮石斛品质提供理论依据。
- 刘玲吴睿牛志韬薛庆云刘薇丁小余
- 关键词：铁皮石斛野生居群杂交后代
- 不同产地美花石斛内生细菌分离及促生潜力比较被引量：18
- 2014年
- 对采自广西、云南和广东的美花石斛(Dendrobium loddigesii Rolfe)野生植株根、茎和叶内的内生细菌进行分离并测定其促生特性,采用扩增核糖体DNA限制性酶切分析(ARDRA)与UPGMA聚类分析相结合的方法对内生细菌菌株进行分类并确定优势属;在此基础上,对具有解磷、解钾和产生长素能力的菌株进行促生潜力评价。结果显示:从不同产地美花石斛植株不同部位共分离得到67株内生细菌菌株,其分布呈现出组织与地区的特异性;其中,来源于广西的植株中菌株数量最多(42株),分离自茎的菌株数量最多(34株)。67株内生细菌菌株可分为31个ARDRA簇,经16S rDNA序列比对鉴定为12个属,包括假单胞菌属(Pseudomonas)、微杆菌属(Microbacterium)、肠杆菌属(Enterobacter)、芽孢杆菌属(Bacillus)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、短波单胞菌属(Brevundimonas)、涅斯捷连科氏菌属(Nesterenkonia)、副球菌属(Paracoccus)、泛菌属(Pantoea)和沙雷氏菌属(Serratia),其中芽孢杆菌属、微杆菌属和肠杆菌属为优势属;来源于广西的植株中内生细菌的丰度与多样性均高于其他两地。在67株内生细菌菌株中,有30株菌株具有解无机磷和解有机磷的双重能力、22株具有解钾能力、24株具有产生长素能力,其中仅8株菌株兼具3种促生能力。组培实验结果显示:在培养基中接种1×106CFU·mL-1芽孢杆菌DLB20菌株,对株高2~3 cm和3~4 cm的美花石斛试管苗生长有促进作用,且更有利于株高3~4 cm试管苗的生根,表明具有解磷、解钾和产生长素能力的菌株对美花石斛试管苗有一定的促生潜力。
- 童文君张礼薛庆云侯北伟丁小余
- 关键词：内生细菌优势属ARDRA聚类分析
- 珍稀细茎石斛LEAFY同源基因的克隆及在石斛药材鉴定中的意义被引量：7
- 2013年
- 本文基于兰科已有的LEAFY(LFY)同源基因保守区设计引物,对细茎石斛(Dendrobium moniliforme(L.)Sw.)的该基因进行克隆及序列分析。通过普通PCR及Tail-PCR技术得到LFY同源基因——DenLFY,全长共3 575 bp,包含3个外显子和2个内含子。将DenLFY基因外显子序列提交到NCBI进行BLAST比对,发现该基因与兰科其他植物同源基因序列相似度很高,均达80%以上,其中与蝴蝶兰(Phalaenopsis hybrid cultivar)LFY同源基因(PhalLFY)和文心兰(Oncidium Gower Ramsey)LFY同源基因相似度分别达84%和90%。应用MP的方法,根据不同物种LFY同源基因进行系统发生关系分析,发现细茎石斛与文心兰、蝴蝶兰亲缘关系最近。氨基酸序列比对分析结果表明,该基因C端编码的氨基酸相对更为保守。从DenLFY基因外显子和内含子单独分析来看,外显子的获得及其编码氨基酸的推测对于LFY基因功能的研究是一个开端,而内含子2在细茎石斛和铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)中存在长度差异,在石斛药材鉴定方面有着很大的应用潜力。
- 邢文瑞侯北伟管婧姣罗晶丁小余
- 关键词：LEAFY同源基因
