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国家自然科学基金(30470998)

作品数：11 被引量：86H指数：5
相关作者：章元明李广军程利国李河南万素琴更多>>
相关机构：南京农业大学临沂师范学院中国农业科学院棉花研究所更多>>
发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
相关领域：农业科学生物学理学更多>>

文献类型

  • 11篇中文期刊文章

领域

  • 6篇农业科学
  • 4篇生物学
  • 1篇理学

主题

  • 5篇性状
  • 5篇基因
  • 4篇性状基因
  • 4篇数量性状
  • 4篇数量性状基因
  • 4篇数量性状基因...
  • 4篇大豆
  • 3篇QTL
  • 3篇QTL定位
  • 2篇重组率
  • 2篇F
  • 1篇豆卷叶螟
  • 1篇多标记
  • 1篇叶绿
  • 1篇叶绿素
  • 1篇叶绿素含量
  • 1篇英文
  • 1篇质量性状
  • 1篇上位性
  • 1篇偏分离

机构

  • 10篇南京农业大学
  • 4篇临沂师范学院
  • 1篇中国农业科学...

作者

  • 10篇章元明
  • 6篇李广军
  • 5篇程利国
  • 4篇李河南
  • 2篇林飞
  • 2篇万素琴
  • 1篇王付华
  • 1篇张国政
  • 1篇邵艳华
  • 1篇朱成松
  • 1篇汪霞
  • 1篇何小红
  • 1篇袁有禄
  • 1篇张红生
  • 1篇吕海燕
  • 1篇王建飞

传媒

  • 2篇科学通报
  • 2篇南京农业大学...
  • 2篇作物学报
  • 1篇大豆科学
  • 1篇遗传
  • 1篇Journa...
  • 1篇中国油料作物...
  • 1篇Scienc...

年份

  • 1篇2010
  • 3篇2009
  • 2篇2007
  • 5篇2006
共 11 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
多QTL定位的压缩估计方法(英文)
2006年
本文综述了多标记分析和多QTL定位的压缩估计方法。对于前者,Xu(Genetics,2003,163:789-801)首先提出了Bayesian压缩估计方法。其关键在于让每个效应有一个特定的方差参数,而该方差又服从一定的先验分布,以致能从资料中估计之。由此,能够同时估计大量分子标记基因座的遗传效应,即使大多数标记的效应是可忽略的。然而,对于上位性遗传模型,其运算时间还是过长。为此,笔者将上述思想嵌入极大似然法,提出了惩罚最大似然方法。模拟研究显示:该方法能处理变量个数大于样本容量10倍左右的线性遗传模型。对于后者,本文详细介绍了基于固定区间和可变区间的Bayesian压缩估计方法。固定区间方法可处理中等密度的分子标记资料;可变区间方法则可分析高密度分子标记资料,甚至是上位性遗传模型。对于上位性检测,已介绍的惩罚最大似然方法和可变区间Bayesian压缩估计方法可供利用。应当指出,压缩估计方法在今后的eQTL和QTN定位以及基因互作网络分析等研究中也是有应用价值的。
章元明
关键词：上位性数量性状基因座
大豆对大豆花叶病毒Sa株系抗扩展特性的遗传分析被引量：4
2009年
作物抗性遗传研究可为抗性育种提供理论基础。在溧水中子黄豆×南农493-1杂交组合的244个F2∶3家系中,随机取171个F2∶3家系为材料,用150对SSR分子标记,通过JoinMap3.0软件构建了包括70对分子标记的25个连锁群;采用平均病级和综合病情指数两种指标,用Win QTL Cartographer V2.5软件的多区间作图法进行QTL定位。结果表明:大豆对大豆花叶病毒Sa株系的抗扩展平均病级和综合病情指数均有4个QTL,其中在C2-b连锁群的satt422-satt640标记间和D2-a连锁群有共同的QTL,两性状的4个和5个互作QTL可分别解释表型变异的15.14%和52.6%。这些结果为抗性性状的遗传剖析和标记辅助育种提供理论依据。
程利国李广军刘玉芹李河南章元明
关键词：大豆大豆花叶病毒数量性状基因座SSR
F_(2:3)设计全基因组标记的Bayesian分析被引量：1
2007年
数量性状的遗传率低时,常采用F2:3设计进行遗传分析,但往往忽略异质家系内QTL的混合分布特性。同时,用多QTL模型检测QTL会提高QTL检测的功效。因此,本文在利用F2:3设计异质F2:3家系内QTL混合分布特性基础上,提出F2:3设计全基因组多标记联合分析新方法。该方法充分利用了异质F2:3家系内的QTL混合分布,并采用多QTL遗传模型。Monte Carlo模拟研究表明,新方法能获得精确的QTL效应和位置的估计。此外,还比较了QTL效应抽样的两种策略。研究表明,新策略能显著提高QTL检测的功效。
万素琴邵艳华袁有禄章元明
关键词：数量性状基因座多标记
大豆对豆卷叶螟抗性的QTL定位被引量：3
2009年
豆卷叶螟是南京地区的主要食叶性害虫。以抗性亲本溧水中子黄豆和感性亲本南农493-1杂交组合正交F2群体为材料,在田间自然虫源条件下F2单株叶片损失率为抗性指标,利用已构建的SSR分子标记图谱和Windows QTL Cartographer V2.5软件包的复合区间作图法和多区间作图法,定位大豆对豆卷叶螟抗性的QTL。结果表明:利用复合区间作图法检测到位于D1b和K连锁群上的2个QTL;利用多区间作图法则检测到位于A2、D1b、K和N连锁群上的4个QTL和6个互作QTL;其中有两个共同的QTL,至少解释表型变异的19.2%。这些结果为抗性性状的遗传剖析和标记辅助育种提供理论依据。
李广军李河南程利国章元明
关键词：豆卷叶螟QTL大豆
回交、DH和RIL偏分离群体遗传图谱的重新构建被引量：8
2007年
分子标记偏离孟德尔分离比例(称偏分离)是一种普遍的生物学现象.虽然偏分离可能会影响标记间遗传距离的估计值和数量性状基因座(quantitative traitlocus,QTL)定位结果,但在遗传连锁图构建和QTL定位中偏分离的影响常常被忽视.在分子标记存在偏分离、显性和缺失情况下,根据隐马尔可夫模型,我们已发展了一种新的多点方法来重新构建F2群体分子标记连锁图,以解决偏分离对标记连锁图构建的影响.本文简化了上述方法以适用于回交、加倍单倍体和重组自交系群体.模拟研究表明:(ⅰ)两连锁偏分离基因座(segregation distortion locus,SDL)影响标记间遗传距离的程度随SDL遗传率和标记间遗传距离的增加而增加,但受样本容量的影响较小;(ⅱ)两连锁SDL一般会低估标记间遗传距离,但是,加性模型下两个SDL加性效应符号相反时会高估之,上位性模型下两SDL加性×加性效应为负时却不影响其估计;(ⅲ)用本文的方法均能矫正遗传距离估计值的偏差.将新发展的方法应用于已构建的一个存在严重偏分离的水稻(Oryza sativa L.)籼粳杂交组合IR28×大关稻的F7代重组自交系群体,重新构建了分子标记遗传图谱,并用Bootstrap法获得了遗传距离的95%置信区间.这些结果进一步印证了本文发展的新方法.这为数量性状和生活力性状的遗传分析提供了基础.为实际数据分析研制的DistortedMap计算机软件可供利用1).
朱成松王付华王建飞李广军张红生章元明
关键词：偏分离EM算法
大豆粒形的主基因＋多基因混合遗传被引量：9
2009年
大豆粒形直接与产量相关,对其粒长、粒宽的遗传规律分析可以为其数量性状基因座定位、分子标记辅助选择育种和基因克隆奠定基础。调查大豆杂交组合溧水中子黄豆(P1)×南农493-1(P2)正反交的P1、P2、F1和F2:3四个世代的粒长和粒宽的表型资料,运用四个世代联合的主基因+多基因混合遗传分析方法,对这两个性状分别进行了遗传分析。结果表明:正反交杂种F1粒长和粒宽有显著差异,存在母性效应;粒长性状受一对加性-显性主基因和加性-显性-上位性多基因共同控制;粒宽受多基因控制。
李河南汪霞李广军程利国何小红张国政章元明
关键词：粒长粒宽
大豆叶绿素含量动态表达的QTL分析被引量：11
2010年
叶绿素是光合作用中最重要的色素,与大豆籽粒产量密切相关。本研究采用溧水中子黄豆×南农493-1后代衍生的244个F2单株及筛选的150个SSR分子标记构建的连锁遗传图谱,在苗期至开花期测定F2衍生F2:3和F2:4家系生长正常单株的倒3复叶功能叶(非离体)的叶绿素含量13次,通过Windows QTL Cartographer v2.5软件包的复合区间法,动态定位了大豆叶绿素含量的QTL。结果表明,不同时间点共检测到20个QTL,其中,不同发育阶段间、年份间和地点间共同的QTL较少,不同时间点上的QTL差异较大,重复出现在N、D1a、F和K连锁群的QTL有3～4次。这些结果为叶绿素含量的遗传剖析和标记辅助育种提供理论依据。
李广军李河南程利国章元明
关键词：大豆叶绿素含量QTL
Advances on methods for mapping QTL in plant被引量：9
2006年
Advances on methods for mapping quantitative trait loci (QTL) are firstly summarized. Then, some new methods, including mapping multiple QTL, fine mapping of QTL, and mapping QTL for dynamic traits, are mainly described. Finally, some future prospects are proposed, including how to dig novel genes in the germplasm resource, map expression QTL (eQTL) by the use of all markers, phenotypes and micro-array data, identify QTL using genetic mating designs and detect viability loci. The purpose is to direct plant geneticists to choose a suitable method in the inheritance analysis of quantitative trait and in search of novel genes in germplasm resource so that more potential genetic information can be uncovered.
ZHANG Yuan-Ming
关键词：参量估计
含有致死基因型的质量性状基因定位的统计方法
2006年
假定某一质量性状受单基因控制,且在纯合显性(或纯合隐性)时会致死,造成不符合M endelian分离比。在F2群体中,根据分子标记和该基因的连锁关系,获得标记与性状的各种表型类别、频率和植株数,通过F isher最大似然法,推导出估计重组率的方程和标准误公式。Monte Carlo模拟研究表明,最大似然法得到的重组率估计值与真值接近,并验证了重组率估计值标准误公式。
林飞章元明
关键词：重组率
作物QTL定位方法研究进展被引量：43
2006年
论述了数量性状基因座(quantitativetraitlocus,QTL)定位方法的产生与发展;重点介绍了近几年提出的一些QTL定位方法,包括多QTL定位、QTL精细定位与动态性状的QTL定位等;展望了QTL定位方法的可能发展方向,包括育成品种群体新基因发掘的统计方法、表达数量性状基因座(expressionquantitativetraitlocus,eQTL)定位方法、遗传交配设计的QTL定位方法以及生活力基因定位方法等.目的在于引导植物遗传工作者在进行数量性状遗传分析和种质资源新基因挖掘等研究时选用适宜的统计方法,以揭示出更多的潜在遗传信息.
章元明
关键词：数量性状基因座参数估计最大似然法
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