浙江省科技攻关计划(2007C23G2090017)
- 作品数:3 被引量:6H指数:2
- 相关作者:黄振校廖志苏李文峰方潇碧张春鸿更多>>
- 相关机构:温州医学院附属第一医院温州医学院更多>>
- 发文基金:温州市科技局科研基金浙江省科技攻关计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 初发鼻咽癌差异基因的染色体定位及功能分析被引量:6
- 2010年
- 目的利用基因芯片技术探索初发鼻咽癌(primary nasopharyngeal carcinoma,pNPC)与鼻咽黏膜慢性炎症组织(chronic nasopharyngitis tissue)差异基因的染色体定位和功能分析。方法用Affymetrix Gene1.0ST芯片检测pNPC与鼻咽黏膜慢性炎症组织基因表达谱差异,并利用生物信息学方法对差异基因进行染色体定位和功能分析。结果差异倍数3倍以上共有102个基因,其中表达上调25个,表达下调77个;差异基因染色体定位分析,发现5个差异基因未知其定位,其余97个差异基因在1号染色体上分布最多,包含16个,其次为3号染色体,包含13个;从差异基因功能分类看,属于酶活性基因最多,其余依次为蛋白结合、免疫、钙黏合等,以上4大类共占差异基因总数65.6%。结论 pNPC差异基因散在分布在各染色体,以1、3号染色体最多;4大类(酶活性、蛋白结合、免疫相关、钙黏合)相关基因异常在癌变过程中发挥重要作用。
- 林森黄振校李文峰张春鸿方潇碧廖志苏
- 关键词:基因表达谱染色体定位分子功能
- 初发鼻咽癌与复发鼻咽癌差异表达基因的研究
- 2009年
- 目的:通过全基因组基因芯片研究初发鼻咽癌(pNPC)与复发鼻咽癌(rNPC)之间的差异表达基因。方法:选择rNPC和pNPC组织标本,应用Affymetrix Gene1.0 ST芯片,构建表达谱,检测两者之间的差异表达基因。结果:rNPC组与pNPC组比对,发现差异基因46个,下调基因38个,上调基因8个。这些基因参与钙结合、蛋白结合、酶活性调节等过程。结论:rNPC和pNPC之间存在基因差异表达,为了解rNPC的发生机制的研究起了一定的作用。
- 黄振校李文峰杜季梅黄亚谭映霞方渭清廖志苏
- 关键词:复发鼻咽肿瘤基因芯片基因表达
- 复发鼻咽癌差异基因分析及染色体定位初步研究被引量:3
- 2010年
- 目的通过基因芯片和生物信息学来筛选复发鼻咽癌(recurrent nasopharyngeal carcinoma,rNPC)差异基因及染色体定位和功能分析。方法选择初发鼻咽癌(primary nasopharyngeal carcinonla,pNPC)和rNPC,应用Affymetrix Genel.0ST芯片筛选差异基因;应用生物信息学对差异基因进行染色体定位和功能分析。结果差异基因共44个,其中下调基因36个,上调基因8个。基因功能分类显示,下调基因大部分属于酶活性基因(10个,27.8%),其次为钙黏合基因(7个,19.4%)、蛋白结合基因(5个,13.9%),这3类基因占了下调基因总数的61.1%,另外,受体活性基因(4个,11.1%),转录因子基因和三磷酸腺苷黏合基因各2个(各占5.6%),细胞外基质黏合基因和生长因子黏合基因各1个(各占2.8%),4个基因的功能未知(11.1%);上调基因中,3个基因的功能未知(37.5%),酶活性基因(2个,25.O%),受体活性、钙黏合、电压门压通道调控基因各1个,各占12.5%。这些差异基因分布在大多数染色体上,主要分布在1和17号染色体上。1号染色体上包含10个基因(22.7%),17号染色体包含5个基因(11.3%)。结论差异基因分布在大多数染色体上,但主要分布在1和17号染色体上,酶活性、钙黏合及蛋白结合基因这三类差异基因可能在rNPC中扮演着重要的角色,需要进一步深入研究。
- 黄振校李文峰林森黄亚杜季梅谭映霞方潇碧张春鸿方渭清廖志苏
- 关键词:鼻咽肿瘤肿瘤复发寡核苷酸序列分析染色体定位