辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划(LJQ2011122)
- 作品数：5 被引量：5H指数：2
- 相关作者：李春杨闫张盈盈刘俊宏白凤翎更多>>
- 相关机构：渤海大学更多>>
- 发文基金：辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划辽宁省“百千万人才工程”资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术化学工程轻工技术与工程更多>>
- DNA序列基于k-字的数值刻画及其应用被引量：1
- 2013年
- 借助DNA序列中k-字的频数,将序列转化成一个340维向量,进而计算物种间的进化距离。作为应用:分别以15个物种的β球蛋白基因、13种汉坦病毒的S片段以及26个闭壳龟线粒体基因为例,构建系统发生树,所得结果与前人的结论一致,说明了该方法的有效性。
- 刘俊宏李春
- 关键词：系统发生树
- 基于多重集逆序数的DNA序列的数值刻画及其应用被引量：2
- 2014年
- 随着人类和其它一些模式生物基因组计划的实施与完成,DNA序列的数量呈指数方式增长,这使得序列分析成为生物信息学的核心问题之一。众所周知,序列之所以称为"序列",自然而然地包含了2个重要因素:元素及其之间的序关系。本文介绍一种全新的考虑元素之间序关系的方法,首先将传统集合上的排列的逆序数推广到多重集上,从而提出带有重复元素的排列的逆序数的概念;在此基础上通过将数字1、2、3、4分别赋值给4个碱基,将DNA原始序列转化为多重集上的数字排列,进而借助逆序数构造出DNA序列的24维向量表示;基于3个数据集的系统发生分析,证实了该方法的有效性。
- 张盈盈李春杨闫贾美多
- 关键词：逆序数系统发生分析
- 蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用被引量：2
- 2014年
- 基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进化距离,进而对两组蛋白质序列进行系统发生分析,结果证实了该方法的有效性。
- 贾美多杨闫张盈盈李春
- 关键词：系统发生分析
- 一种新的蛋白质结构类预测方法
- 2012年
- 基于氨基酸的16种分类模型,给出蛋白质序列的派生序列,进而结合加权拟熵和LZ复杂度构造出34维特征向量来表示蛋白质序列。借助于贝叶斯分类器对同源性不超过25%的640数据集进行蛋白质结构类预测,准确度达到71.28%。
- 李楠李春
- 关键词：氨基酸贝叶斯分类器
- 基于拟熵权重和ALE指标的食品安全风险综合评估模型
- 2014年
- 食品安全风险综合评估是以食品的污染物检测数据为依据,评估其对相应食品的危害程度。本文研究了基于拟熵及矩阵不变量——ALE指标的食品安全风险综合评估方法,建立了茶叶安全风险综合评估的数学模型,取得了比较满意的结果。
- 杨闫贾美多李春白凤翎
- 关键词：食品安全综合评估污染物
