广西教育厅科研项目(200809MS095)
- 作品数：5 被引量：11H指数：3
- 相关作者：宋忠魁蔡小辉彭银辉赵鹏聂振平更多>>
- 相关机构：广西海洋研究所钦州学院南华大学更多>>
- 发文基金：广西教育厅科研项目广西壮族自治区自然科学基金广西海洋生物技术重点实验室主任基金更多>>
- 相关领域：生物学天文地球更多>>
- 拟穴青蟹不同大小个体遗传多样性分析被引量：1
- 2012年
- 在拟穴青蟹(Scylla paramamosain)育种实践中,建立了一种选择个体大小的策略,应用ISSR和RAPD标记技术并以拟穴青蟹雄性个体组建供试群体检验所建立的选择策略的有效性.ISSR与RAPD标记方法的分析数据都表明,大、中、小个体组的几个对应遗传参数值高低依次按中个体组、大个体组、小个体组排列.其基因多样性的Nei’s分析表明,ISSR分析所得到的总遗传多样性(Ht=0.322 3)、平均遗传多样性(Hs=0.270 1)、遗传分化系数(Gst=0.162 2),均高于RAPD分析得出的对应遗传参数值(Ht=0.274 6,Hs=0.233 6,Gst=0.149 3).基于ISSR数据的遗传分化系数表明大、中、小个体组组间遗传分化程度达到较高水平,而基于RAPD数据的遗传分化系数表明大、中、小个体组组间遗传分化程度达到中等水平.上述结果表明应用ISSR标记技术比应用RAPD标记技术能揭示出更加丰富的遗传变异信息.基于ISSR和RAPD分析数据的组间遗传分化系数表明,大个体组与小个体组间的遗传分化系数最高(Gst值分别为0.165 8、0.139 9),与中个体组间的次之(Gst值分别为0.156 6、0.127 2),中个体组与小个体组间的遗传分化系数最低(Gst值分别为0.050 5、0.082 4).基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类分析结果表明,ISSR和RAPD分析数据均支持大个体组优先分离.基于Dice’s系数的个体聚类分析结果也揭示了大个体组个体优先分离并呈现出单独聚类趋势.这表明ISSR与RAPD分析数据均支持了拟穴青蟹个体大小选择策略的有效性.此外,研究结果也表明:拟穴青蟹供试群体遗传多样性高低分布趋势与群体内的不同个体类型的数量分布趋势基本一致,呈正态分布趋势;大个体组的遗传多样性高于小个体组,或小个体组的遗传多样性高于大个体组并不影响大个体组作为育种材料的潜力.
- 宋忠魁孙奉玉赵鹏蔡小辉王芳宇聂振平
- 关键词：海洋生物学拟穴青蟹育种ISSRRAPD
- 二种体色拟穴青蟹群体ISSR分析被引量：4
- 2011年
- 应用ISSR分子标记技术分析二种体色拟穴青蟹群体的遗传多样性.10条ISSR引物共扩增出81条带,其中73条表现出多态性,占总条带数的90.12%.暗红色和深绿色拟穴青蟹群体的多态性位点比率分别为81.48%和77.78%,暗红色群体的Nei’s基因多样性指数(He=0.318 9)和Shannon’s信息指数(I=0.469 0)略高于深绿色群体(He=0.305 4,I=0.449 1).群体间的Nei’s遗传相似性(0.948 4)和遗传距离(0.052 9)表明,群体间遗传分化属于种内遗传分化.POPGENE和AMOVA分析表明,总的遗传变异主要来源于群体内个体间,群体间发生中等程度遗传分化,群体间存在强大的基因流.UPGMA聚类图可视化群体间和群体内的遗传变异,显示60个个体并没有按体色聚类.
- 蔡小辉宋忠魁彭银辉聂振平赵鹏苏琼
- 关键词：海洋生物学拟穴青蟹体色ISSR
- 拟穴青蟹ISSR-PCR条件的优化被引量：3
- 2010年
- 分析DNA模板、Mg2+、dNTPs、引物和Taq DNA聚合酶及甲酰胺、二甲基亚砜等对拟穴青蟹ISSR-PCR反应的影响。研究结果确定了获得清晰条带的模板DNA、Mg2+、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶的浓度范围分别为:模板DNA 8～50 ng/μl,Taq DNA聚合酶0.75～1.0 U,Mg2+1.0～2.0mmol/L(与引物密切相关),dNTP 0.15～0.20 mmol/L,引物浓度0.6～0.8μmol/L。甲酰胺的添加并不能优化拟穴青蟹ISSR-PCR反应结果,而低浓度的二甲基亚砜可提高扩增产物的清晰度,但与引物相关。
- 蔡小辉彭银辉彭重威周文红赖成民乐宋忠魁
- 关键词：拟穴青蟹ISSR标记
- 非伤害性取样方法获取的拟穴青蟹DNA质量研究被引量：2
- 2010年
- 选取5只采自广西北海的野生拟穴青蟹（Scylla paramamosain）,分别采用非伤害性（血淋巴）和伤害性（肌肉组织）取样方法提取基因组DNA进行COI扩增和ISSR扩增,检测DNA质量。结果表明,非伤害性（血淋巴）和伤害性（肌肉组织）取样方法获得的拟穴青蟹全基因组DNA的OD260/OD280分别为1.75~2.01和1.81~1.94,全基因组DNA纯度均较高,质量不相上下。同时,两种取样方法获取的DNA扩增片段大小均在600bp左右,同一个体扩增带型也是一致的。非伤害性（血淋巴）取样方法提取的基因组DNA,在质量上可以媲美伤害性取样（肌肉组织）提取的DNA,可以用于其它分子生物学实验研究。
- 蔡小辉彭银辉文雪彭重威宋忠魁
- 关键词：取样方法拟穴青蟹
- 北部湾6个拟穴青蟹群体遗传多样性的ISSR分析被引量：3
- 2012年
- 应用ISSR标记技术分析来自北部湾的拟穴青蟹6个地理群体(清化、党江、钦州湾、流沙湾、珍珠湾、闸口)的遗传变异和遗传结构,8条ISSR引物扩增111个个体,分析其中的66个位点,56个位点表现出多态性,表明拟穴青蟹在物种水平上的多态位点百分率是84.85%。拟穴青蟹6个群体的多态位点百分率为51.52%～63.64%,平均为57.58%。群体的遗传多样性按自高至低顺序排列为清化群体>党江群体>钦州湾群体>流沙湾群体>珍珠湾群体>闸口群体。拟穴青蟹在种水平或群体水平上的多态位点百分率和Shannon信息指数表明,拟穴青蟹遗传多样性在甲壳类动物中处于较高层次,但比甲壳类以外的几类经济海产动物遗传多样性低。总的遗传分化系数GST值为0.1841,表明,总遗传变异的绝大部分存在于群体内,群体间的遗传分化程度较大。但是,绝大部分两两群体间的遗传分化系数值在0.0689～0.1276,为中等程度的遗传分化。AMOVA分析表明,群体内遗传变异占87.97%,群体间遗传变异占12.03%,群体间遗传分化程度中等但分化显著。Manteltest结果表明,拟穴青蟹6个群体间的遗传距离与地理距离之间的相关性不显著。聚类分析表明,来自广西沿海的4个群体聚成一支。
- 宋忠魁孙奉玉李梦芸赵鹏聂振平苏琼
- 关键词：拟穴青蟹ISSR遗传分化
