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上海市教育委员会重点学科基金(B111)

作品数:27 被引量:59H指数:5
相关作者:钟扬黄强南蓬韩利平王庆彪更多>>
相关机构:复旦大学上海生物信息技术研究中心西藏大学更多>>
发文基金:上海市教育委员会重点学科基金国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学医药卫生理学农业科学更多>>

文献类型

  • 27篇期刊文章
  • 2篇会议论文

领域

  • 13篇生物学
  • 10篇医药卫生
  • 3篇农业科学
  • 3篇理学
  • 2篇化学工程
  • 1篇电子电信
  • 1篇一般工业技术

主题

  • 6篇基因
  • 4篇进化
  • 3篇通路
  • 3篇系统发育
  • 3篇基因组
  • 2篇蛋白
  • 2篇信息处理
  • 2篇原虫
  • 2篇植物
  • 2篇适应性进化
  • 2篇视皮层
  • 2篇疟原虫
  • 2篇皮层
  • 2篇青蒿
  • 2篇青蒿素
  • 2篇全基因
  • 2篇系统发育关系
  • 2篇核苷
  • 2篇分子对接
  • 2篇RBCL基因

机构

  • 14篇复旦大学
  • 4篇上海生物信息...
  • 2篇中国科学院
  • 2篇西藏大学
  • 1篇上海交通大学
  • 1篇中国科学院华...
  • 1篇中国科学院遗...
  • 1篇中国科学院植...
  • 1篇中国医学科学...
  • 1篇美国德州大学
  • 1篇上海美迪西生...

作者

  • 6篇钟扬
  • 4篇黄强
  • 3篇南蓬
  • 2篇陈婕
  • 2篇刘念
  • 2篇朱斌
  • 2篇卢大儒
  • 2篇朱勇
  • 2篇韩利平
  • 2篇王庆彪
  • 1篇朱青
  • 1篇卫海滨
  • 1篇杨永
  • 1篇简曙光
  • 1篇杨亚军
  • 1篇程明军
  • 1篇谈彧君
  • 1篇黄建
  • 1篇叶琳
  • 1篇康玉

传媒

  • 6篇Scienc...
  • 4篇科学通报
  • 2篇复旦学报(自...
  • 2篇生物物理学报
  • 2篇Genomi...
  • 2篇Scienc...
  • 2篇Protei...
  • 1篇中国科学(C...
  • 1篇遗传
  • 1篇西北师范大学...
  • 1篇自然科学进展
  • 1篇中国生物工程...
  • 1篇Scienc...
  • 1篇计算生物学
  • 1篇第十一次中国...

年份

  • 1篇2015
  • 3篇2014
  • 1篇2013
  • 3篇2012
  • 2篇2011
  • 7篇2010
  • 11篇2009
  • 1篇2008
27 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
建立标准化SEAP报告基因系统的研究
2011年
通过建立SEAP(分泌性碱性磷酸酶)产物的标准曲线,得出SEAP的吸光值与酶活力、蛋白质绝对值之间相互换算的公式,从酶动力常数、酶反应时间、不同量mRNA与酶吸光值之间的对应关系等方面进行研究.建立了在405 nm波长处,SEAP的吸光值与酶活力之间、酶活力和蛋白质绝对值之间相互换算的两个公式:y(酶活力)=(x(吸光值)+0.002 8)/19.13×10;1U(酶活力)=5.035 ng(蛋白质绝对量),并在细胞和小鼠实验中得到了验证.建立了提高SEAP检测系统灵敏度的方法,并进行了导入目的基因不同方法的效率之间的比较.结果表明,建立的换算标准可以使SEAP报告基因系统从定性水平上升到定量水平,而且灵敏度可以达到10-18mol的标准.
朱青卢大儒
关键词:SEAP报告基因
Phylogeographic analysis of human papillomavirus 58被引量:2
2009年
Human papillomavirus 58 (HPV58) is one type of HPV with high risk of causing cervical cancer. Unusually high prevalence of HPV58 has been reported in Asia, Africa and some other areas. However, due to the scattered distribution of global data, in addition to the lack of data of some HPV58 high-incidence nations and regions, like China's Mainland, a comprehensive analysis of the global geographical distribution of HPV58 remains blank so far. In this study, HPV58 from the human cervical cancer tissue was detected in China's Mainland, and 14 new HPV58-E6/L1 gene sequences were obtained. Moreover, phylogeographic analysis has been conducted combining the HPV58 sequences that have been deposited in GenBank since 1985. The study result shows that the sequences detected from the Shanghai, Jiangsu and Sichuan areas are homologous with those found in the past from Hong Kong and Xi'an, China, as well as Japan and other Southeast Asian areas. Furthermore, Western Africa is considered to be the "root" source of the HPV58 variant, while China's Mainland and Southeast Asia are "transit points" and the new sources of HPV58 after receiving the isolates from the "root" source; like HPV16 and HPV18, the HPV58 might also be one of the major HPV types associated with the development and spread of cervical cancer.
LI YanYun1, LI ZuoFeng2, HE YiFeng1, KANG Yu1, ZHANG XiaoYan1, CHENG MingJun1, ZHONG Yang2, 3· & XU CongJian1· 1 Obstetrics and Gynecology Hospital of Fudan University, Shanghai 200011, China
关键词:PAPILLOMAVIRUSCERVICALCANCERPHYLOGEOGRAPHYMOLECULAREVOLUTION
Evidence for the Projections from the Basal Nucleus of the Amygdala to the Primary Visual Cortex in the Cat
2009年
The amygdaloid complex receives information from all sensory systems, especially from vision. Some researches (Amaral DG, 2003) show that in the primate brain, the amygdala
Yuanxin Chen, Bin Zhu and Tiande Shou School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai, P.R.China
关键词:BASALNUCLEUSFLUOROGOLDEVOKED
Evidence for the Projections from the Basal Nucleus of the Amygdala to the Primary Visual Cortex in the Cat
<正>The amygdaloid complex receives information from all sensory systems,especially from vision.Some researches...
Yuanxin Chen,Bin Zhu and Tiande Shou School of Life Sciences,Fudan University,Shanghai,P.R.China
关键词:FLUOROGOLD
文献传递
人染色体8p11(CHRNB3-CHRNA6)区域基因多态性与中国汉族人群肺癌易感性的相关性被引量:3
2011年
为探讨人染色体8p11(CHRNB3-CHRNA6)区域基因多态性与中国汉族人群肺癌遗传易感性之间的关系,文章采用病例-对照研究,对784例肺癌患者和782例性别、年龄、籍贯频数与之相匹配的健康对照中该区域6个标签SNP位点进行基因分型,并统计分析其基因型频率分布与肺癌易感性的关系,以及吸烟在其中的影响。结果发现rs16891561位点TT基因型在60岁以上人群(校正OR=0.42,95%CI=0.20-0.88;P=0.022)、女性人群(校正OR=0.34,95%CI=0.13-0.87;P=0.025)、非吸烟人群中(校正OR=0.32,95%CI=0.13-0.79;P=0.013)对肺癌发生具有保护效应;rs4236926位点TT基因型在60岁以上人群(校正OR=0.48,95%CI=0.23-0.99;P=0.048)、非吸烟人群(校正OR=0.32,95%CI=0.13-0.80;P=0.014)中对肺癌发生具有保护效应,这两种保护效应主要是与腺癌相关。对这两个位点进行累积效应分析发现,含有3-4个变异等位基因型的非吸烟者罹患肺癌的风险显著降低(校正OR=0.29,95%CI=0.11-0.71;P=0.007),并且,含有3-4个变异等位基因型的个体累计吸烟量("包-年"平均数=13.2)与其他个体相比显著降低。由此可见人染色体8p11(CHRNB3-CHRNA6)区域基因多态性与中国汉族人群肺癌易感性和吸烟行为相关。
张晓博赵振宏陈红岩王久存钱吉杨亚军魏庆义黄建卢大儒
关键词:单核苷酸多态性肺癌易感性
基于恶性疟原虫全基因组蛋白信息预测青蒿素的潜在抗疟靶点
2009年
结合NCBI分类数据库和KEGG提供的恶性疟原虫3D7株相关蛋白质信号通路信息,筛选出8个处于信号通路关键位置的蛋白酶,分别与青蒿素进行分子对接研究.通过分析它们之间的结合模式,发现嘌呤核苷磷酸化酶(pfPNP)、肽脱甲酰基化酶(pfPDF)和核糖-5-磷酸异构酶(pfRpiA)等3种蛋白酶与青蒿素的抗疟作用有关,而青蒿素可能通过干预嘌呤代谢、嘧啶代谢、蛋氨酸代谢、乙醛酸和二羧酸代谢及磷酸戊糖途径产生抗疟效应.
韩利平黄强南蓬钟扬
关键词:青蒿素分子对接信号通路
一种碟式微流控结晶芯片与传统结晶板的蛋白质结晶能力比较
2015年
设计并制作了一种在微腔中对蛋白质进行微批量法(microbatch)结晶的碟式微流控结晶芯片,它是一种高通量、低成本、低耗样量(纳升级)、操作简便的蛋白质结晶筛选方法,这种芯片能成功地结晶溶菌酶(lysozyme)和青色荧光蛋白(CyPet).为了系统地比较这种微流控芯片与传统的使用蒸汽扩散法(vapor diffusion)的24孔结晶板的结晶能力,用3个Hampton结晶试剂盒(Crystal Screen KitⅠ、Crystal Screen KitⅡ和PEG/Ion Screen Kit),在4℃及20℃培养条件下分别对5种标准蛋白(溶菌酶(lysozyme)、木聚糖酶(xylanase)、脂肪酶B(lipase B)、葡萄糖异构酶(glucose isomerase)和嗜热菌蛋白酶(thermolysin))进行了结晶筛选实验.结果表明,在4℃时微流控芯片与24孔结晶板有相近数目的结晶条件(91 vs 98);在20℃时虽然微流控芯片上的结晶条件数少于24孔结晶板(67 vs 94),但主要是嗜热菌蛋白酶的结晶条件数显著减少,其他4种蛋白在两种方法上均有相近的结晶条件数,表明微流控芯片能以接近24孔结晶板的效率进行蛋白质结晶筛选.但是,在4℃时微流控芯片与24孔结晶板有60%的结晶条件不同,20℃时有90%的结晶条件不同,这表明目前的这种微流控芯片还不能直接代替传统的24孔结晶板,它可以作为蛋白质结晶筛选时的一种补充方式.
孙凯雷王丽杨文静祁祺胡小健李刚
关键词:蛋白质结晶
猫高级视皮层21a区对视皮层17和18区方向选择性的反馈调制作用——基于脑内源信号光学成像的研究
猫和猴的视皮层存在着两条将视觉信息由低级视皮层向高级视皮层传递的并行的前馈信息处理通路,即形状信息处理通路(腹侧通路)和运动信息处理通路(背侧通路)。
朱斌陈元新谈彧君寿天德
文献传递
Asymmetric transportation induced by thermal noise at the nanoscale被引量:3
2012年
Based on a simple model,we theoretically show that asymmetric transportation is possible in nanoscale systems experiencing thermal noise without the presence of external fluctuations.The key to this theoretical advance is that the correlation lengths of the thermal fluctuations become significantly long for nanoscale systems.This differs from macroscopic systems in which the thermal noises are usually treated as white noise.Our observation does not violate the second law of thermodynamics,since at the nanoscale,extra energy is required to keep the asymmetric structure against thermal fluctuations.
WAN RongZhengHU JunFANG HaiPing
关键词:热噪声热力学第二定律噪声处理
青蒿素及其衍生物的抗疟机制研究进展被引量:11
2009年
青蒿素及其衍生物是一类重要的抗疟药物,其分子结构中含有特殊的过氧桥键.近几十年来,青蒿素及其衍生物的抗疟机制引起了国内外科学工作者浓厚的兴趣.文中结合最新的研究结果,综述了青蒿素及其衍生物的抗疟机制.研究进展表明,该类衍生物的抗疟机制基本分为两步:首先,青蒿素及其衍生物在疟原虫体内的Fe(Ⅱ)或其他还原性物质作用下形成一些活性中间体;然后,这些中间体通过过氧化膜脂质、干扰线粒体的功能、烷基化血红素或抑制蛋白质活性等途径表现出抗疟作用.作者对3种可能的活性中间体学说以及作用靶点进行了详细的讨论,并提出了下一步的研究方向.通过对青蒿素及其衍生物抗疟机制的论述,为今后抗疟药物的设计提供帮助.
韩利平黄强曾丽艳钟扬卫海滨南蓬
关键词:青蒿素活性中间体靶点
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