国家自然科学基金(90612020)
- 作品数：4 被引量：11H指数：3
- 相关作者：黄仲曦姚开泰江庆萍鲁娟刘真更多>>
- 相关机构：南方医科大学中南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金NSFC-广东联合基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 基于表达谱分析识别鼻咽癌血管生成及淋巴管生成的调控通路被引量：3
- 2012年
- 目的探讨鼻咽癌是通过调节哪些靶基因的表达影响血管生成和淋巴管生成。方法以Sengupta等通过基因芯片数据(其中含10例正常鼻咽组织,31例鼻咽癌组织)分析所得的831个鼻咽癌与正常鼻咽组织差异表达基因为基础,根据最新的基因组信息以及设定差异表达值的最小阈值260,筛选出246个有效基因。对这246个基因进行基于文献挖掘的基因功能分析和网络构建,最后进行通路分析。结果 246个基因与鼻咽癌、EB病毒、转移、血管生成、淋巴管生成、侵袭等关键词特异相关。其中,52个基因已知与血管生成相关(P=0.00001),19个基因构成了血管生成基因网络(P=0.0042);21个基因已知与淋巴管生成相关(P=0.00001),6个基因构成了与淋巴管生成相关基因网络(P=0.0226)。包含PTGS2在内的8个基因参与NFκB信号通路已知在小细胞肺癌中与血管生成密切相关(P=7.87E-07)。包含STAT1及CXCL10等在内的5个基因参与了Toll样受体通路(P=0.00176)。结论 PTGS2和NFκB共同调控鼻咽癌血管生成,Toll样受体信号通路可能与淋巴管生成密切相关。它们的相互作用方式值得进一步研究。
- 马佳怡黄坤黄仲曦
- 关键词：鼻咽癌基因芯片血管生成淋巴管生成
- TGFBR2表达下调可能是鼻咽癌的恶性生物标志被引量：4
- 2008年
- 目的该研究拟探索在鼻咽癌发病过程中起着重要作用的关键癌基因或抑癌基因。方法利用基因芯片比较了混合的鼻咽癌细胞株与混合的非癌人鼻咽组织之间的差异表达基因。利用MILANO在线分析程序,寻找已知的癌基因和抑癌基因。免疫组化分析鉴定重要癌基因或抑癌基因表达结果的可靠性。结果MI-NANO分析所有差异表达基因后发现,在鼻咽癌细胞中表达下调比较明显的TGFBR2基因是一个重要的抑癌基因,该基因在TGFβ抑制性信号通路中起着重要的作用,参与了许多肿瘤的发病过程,而且该基因在鼻咽癌的研究中尚未见报道。在免疫组化共检测了56个非癌鼻咽组织和49个鼻咽癌组织后,Mann-Whitney test统计分析发现,与非癌鼻咽组织相比,TGFBR2在鼻咽癌组织中表达明显下调(P<0.001)。结论TGFBR2参与了鼻咽癌发病过程,其表达下调可能促进了鼻咽癌的发生发展,但是否与转移、预后及复发等临床参数相关还有待进一步研究。
- 方唯意江庆萍刘真李欣刘求真王爽谢思明鲁娟刘腾飞谢卫兵涂露霞黄静姚开泰
- 关键词：鼻咽癌基因芯片免疫组化
- 来自不同地区的两组鼻咽癌活检组织样本共同失调的基因功能及通路被引量：1
- 2011年
- 目的探究两组鼻咽癌活检组织样本中差异基因表达谱所显示的失调基因功能及通路的相同之处。方法利用生物信息学的方法分析两组差异表达基因谱,对比其失调的基因功能及通路,同时探索其相同的失调功能与两组数据间相同的基因的关系。结果两样本中显著上调的基因主要与细胞的周期调控、增殖、DNA损伤修复、细胞的粘附迁移、代谢及蛋白质结合等相关,但是显著下调的基因无明显的功能聚类;两差异基因表达谱显示出的相同失调基因功能并不是完全由它们的相同基因引起;两者共同失调的通路有10条,排在前4位的为白细胞内皮迁移、细胞粘附分子、粘着斑和磷脂酰肌醇信号系统。结论来自两个不同地区的鼻咽癌活检组织样本的比较发现,其差异表达的基因多与细胞周期调控、DNA损伤修复、粘附迁移等相关,这与临床治疗首选化疗的原因相符;通路分析得出4条差异最显著的共同通路也与肿瘤粘附迁移相关,通过干扰其在肿瘤中的病理作用,特别是磷脂酰肌醇信号系统在肿瘤发生、粘附及转移等关键步骤中的信号传导作用,有望提高鼻咽癌的治疗效果及预后。
- 熊艺颖黄仲曦
- 关键词：鼻咽癌生物信息学基因功能通路
- 鼻咽癌凋亡及增生相关基因筛选与分析被引量：3
- 2009年
- 目的筛选及分析鼻咽癌发生发展过程中的细胞凋亡相关基因及增生相关基因。方法结合GO分类从本实验室已有的鼻咽癌基因芯片数据中筛选异常表达的细胞凋亡相关基因及细胞增生相关基因;根据鼻咽癌发生发展的树模型提示的三个阶段,找出各阶段的鼻咽癌细胞凋亡相关基因及细胞增生相关基因;再结合文献进一步分析两种基因在鼻咽癌发生树模型中的分布特点及规律。结果鼻咽癌细胞凋亡相关基因19个,其中处于染色体丢失区段的下调鼻咽癌细胞凋亡相关基因9个(DNASE1L3等)、处于染色体扩增区段的上调鼻咽癌细胞凋亡相关基因10个(DEDD等)。鼻咽癌细胞增生相关基因21个,其中处于染色体丢失区段的下调鼻咽癌细胞增生相关基因8个(TUSC2等)、处于染色体扩增区段的上调鼻咽癌细胞增生相关基因13个(EMP1等)。处于染色体丢失区段的下调鼻咽癌细胞凋亡相关基因多参与诱导或调控细胞凋亡;而处于染色体扩增区段的上调鼻咽癌细胞增生相关基因多参与正调控细胞增生。结论鼻咽癌可能存在两种发生方式:一种以凋亡受抑为主要原因;另一种以增生过度为主要原因。
- 周毅波黄仲曦任彩萍祝斌姚开泰
- 关键词：鼻咽癌树模型细胞增生
