云南省自然科学基金(2005C0012Z) 作品数:5 被引量:36 H指数:4 相关作者: 张仲凯 董家红 丁铭 方琦 张丽珍 更多>> 相关机构: 云南省农业科学院 云南农业大学 云南省农业生物技术重点实验室 更多>> 发文基金: 云南省自然科学基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
侵染曼陀罗的中国番茄黄化曲叶病毒及其卫星DNAβ全基因组结构特征 被引量:1 2008年 从云南大理曼陀罗上采集到病毒分离物YN72,症状表现为叶脉增厚、叶片褪绿、植株矮化。全序列测定表明,YN72DNA-A全长2 739个核苷酸。基因组比较发现,YN72 DNA-A与中国番茄黄化曲叶病毒分离物(TYLCCNV-[Y43])同源性最高(93.4%),与中国番茄黄化曲叶病毒烟草分离物(TYLCCNV-[Y5])的同源性次之(92.9%),而与亚洲地区的其它双生病毒的同源性均在90%以下,表明曼陀罗中的分离物YN72是TYLCCNV的1个分离物。利用W TG s卫星分子DNAβ的特异性引物beta01和beta02,在YN72中PCR扩增到DNAβ分子。序列分析表明,YN72β全长1 335个核苷酸,在其互补链上编码1个有功能的ORF(C1)。YN72β的全序列与TYLCCNV分离物卫星分子Beanβ和Y297β的同源性最高,分别为99.8%和99.3%;与其它所比较的DNAβ的同源性均低于80.6%。系统进化树研究表明,YN72卫星分子DNAβ与其辅助病毒是共同进化的。 丁铭 杨程 罗延青 岳宁 方琦 苏晓霞 张仲凯关键词:中国番茄黄化曲叶病毒 曼陀罗 卫星DNAΒ 侵染西番莲的一个Potyvirus分离物的鉴定 从田间采集到花叶、皱缩病株样本,经电镜观察和采用马铃薯Y病毒属病毒双夹心酶联检测试剂盒(DAS-ELISA)进行测定,样本检测出马铃薯Y病毒属病毒,利用马铃薯Y病毒属(Potyvirus)简并引物,以带病毒植株总RNA为... 丁铭 方琦 李婷婷 苏晓霞 张丽珍 董家红 张仲凯关键词:西番莲 马铃薯Y病毒属 文献传递 番茄斑萎病毒属病毒的多样性 被引量:8 2007年 番茄斑萎病毒属(Tospovirus)病毒属于布尼亚病毒科(Bunyaviridae),是一类世界性分布的具有重要经济价值的植物病毒。到目前为止,该属已报道了至少28个Tospovirus病毒种或分离物,但少数分离物之间关系不清楚,甚至同种病毒的不同分离物被命名为两种不同的病毒。本文从种类、血清学、寄主范围、地理分布、传播介体以及核壳体蛋白基因(N)核甘酸序列及其推导的氨基酸序列的相似性等方面分析了所有分离物之间的关系,并通过N基因推导的氨基酸序列分析了Tospovirus病毒的遗传多样性,最后推测Tospovirus病毒起源于南亚及东南亚地区。 程晓非 武晓云 李凡 李正跃 董家红 张仲凯关键词:多样性 进化树 番茄环纹斑点病的发生流行特点初步研究 <正>番茄环纹斑点病毒(Tomato zonate spotted virus,TZSV)是本实验室发现的番茄斑萎病毒属(Tospovirus)新种,属于西瓜银色斑驳病毒(Watermelon silver mottle... 尹跃艳 董家红 方琦 丁铭 李婷婷 张丽珍 苏晓霞 张仲凯关键词:病害流行 中间寄主 侵染循环 文献传递 马铃薯A病毒云南分离物外壳蛋白基因的克隆与序列分析 被引量:8 2006年 根据马铃薯病毒A(Potato virusA,PVA)外壳蛋白(CP)基因序列设计合成的一对引物,以带病毒植株总RNA为模板,RT-PCR扩增得到长约800 bp的目的片段。将目的片段克隆至pGEM-T Easy载体并进行了序列测定,测得全长为807 bp的PVA CP基因。测序结果与PVA其他分离物CP基因序列比较,其氨基酸同源性最高可达98.5%。根据GenBank中PVA CP氨基酸序列建立了病毒的系统进化树并对PVA不同分离物CP氨基酸序列差异性进行了分析。 丁铭 方琦 张丽珍 李婷婷 董家红 张仲凯关键词:马玲薯 云南分离物 外壳蛋白基因 云南建水西葫芦花叶病的病原鉴定 <正>西葫芦(Cucurbita pepo Linn.)是云南重要的反季节蔬菜作物,在冬春少雨干旱的条件下,病毒病易流行为害,引起西葫芦花叶、果实畸形,部分田块发病率达100%,造成严重减产及品质下降。近几年,在进行云南... 董家红 程晓非 张丽珍 李婷婷 方琦 苏晓霞 张仲凯关键词:西葫芦 花叶病 病原 文献传递 马铃薯卷叶病毒云南分离物外壳蛋白基因的克隆与序列分析 被引量:12 2006年 With designed specific primers based on Potato leafroll virus(PLRV) coat protein(CP) gene sequence,one PCR fragment(about 0.6 kb) was amplified by reverse transcription polymerase chain reaction(RT-PCR) using the total RNA as template extracted from virus infected potato plant collected in Zhaotong,Yunnan province.The fragment was cloned into pGEM-T easy vector and sequenced.The sequence was compared with that of homologous gene of other PLRV isolates.The results showed it had high homology with the other isolates(the highest homology reached 99.2% of nucleic acid).Based on CP amino acid sequence the phylogenic tree of PLRV was established and the isolates were clustered into many groups. 丁铭 方琦 李婷婷 张丽珍 董家红 李展 张仲凯关键词:马铃薯卷叶病毒 外壳蛋白基因 分离物 PLRV 侵染番茄的中国番茄黄化曲叶病毒致病性相关分子的遗传多样性 被引量:7 2008年 对云南番茄中的中国番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl China virus,TYLCCNV)不同分离物的致病性相关分子DNAβ进行PCR扩增和克隆.全序列比较分析发现滇西北和滇南各分离物DNAβ同源率较高而且进化关系较近,滇西南与之差异较大.获得的16个DNAβ分离物具有一定的地理分布差异. 丁铭 岳宁 董家红 张仲凯关键词:番茄 中国番茄黄化曲叶病毒 DNAΒ