陈可冀中西医结合发展基金(CKJ2010032) 作品数:10 被引量:78 H指数:6 相关作者: 叶蕻芝 郑春松 刘献祥 徐筱杰 吴广文 更多>> 相关机构: 福建中医药大学 北京大学 更多>> 发文基金: 陈可冀中西医结合发展基金 国家自然科学基金 福建省科技计划重点项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 自动化与计算机技术 更多>>
从化学空间角度看独活寄生汤治疗骨性关节炎的多靶点作用 被引量:14 2011年 目的从化学空间角度探讨独活寄生汤治疗骨性关节炎的多靶点作用。方法采用计算机处理,对独活寄生汤中的分子集和MDDR数据库中骨性关节炎靶酶抑制剂的分子集进行化学空间分析,对一些特征描述符的分布进行描述,用主成分分析法将多维化学空间映射到二维空间上以得到更直观的图像。结果来源于独活寄生汤和MDDR数据库中骨性关节炎靶酶抑制剂的分子集存在绝大部分相同的化学空间,且前者拥有更大的附加区域,显示出多样性。结论通过化学空间方法直观地揭示了独活寄生汤存在的多靶点效应。 郑春松 叶蕻芝 许惠凤 吴广文 李西海 刘献祥关键词:骨性关节炎 独活寄生汤 多样性 基于计算机模拟研究治疗骨性关节炎祛风湿和活血化瘀中药的分子特征 被引量:3 2012年 目的:研究治疗骨性关节炎的祛风湿和活血化瘀中药分子特征,为其配伍提供实验依据。方法:利用分子相似性、描述符计算、主成分分析等计算方法描述祛风湿和活血化瘀中药分子的特征。结果:祛风湿和活血化瘀中药的分子在结构特征和物理化学性质上存在相似之处,在化学空间上也有相同的区域。结论:祛风湿和活血化瘀中药在骨性关节炎临床上配伍使用存在潜在的协同作用,在一定程度上揭示两者配伍的合理性。 郑春松 叶蕻芝 李西海 许惠凤 吴广文 刘献祥 徐筱杰关键词:中药 祛风湿 活血化瘀 分子特征 计算机模拟 计算机模拟预测独活寄生汤的药代动力学性质 被引量:6 2011年 随着中药临床疗效的肯定和药效学的发展,人们越来越关注中药药代动力学研究。通过中药药代动力学研究,有利于中药有效的物质基础和作用机制的阐明、临床合理用药指导、药物安全性评价和新药的开发,对于实现中药现代化具有重要意义。但中药复方存在多成分、多靶点、多途径作用的特点,其药代动力学具有特殊性,完全不同于单体成分的药代动力学研究, 郑春松 叶蕻芝 许惠凤 吴广文 李西海 刘献祥关键词:独活寄生汤 药代动力学 计算机模拟 化学结构 分子对接法预测独活寄生汤中对TNF-α和IL-1β作用的活性成分 目的:探讨独活寄生汤中作用于TNF-o和IL-1β受体的成分。方法:采用Discovery Studio 2.0软件,通过Dock Ligands(LigandFit)模块,研究独活寄生汤中成分与受体TN-α和IL-1β... 郑春松 叶蕻芝 许惠凤 李西海 吴广文 刘献祥关键词:分子对接 独活寄生汤 骨性关节炎 肿瘤坏死因子-Α 白细胞介素-1Β 文献传递 分子对接法对补肾壮筋汤治疗骨性关节炎有效成分群的研究 被引量:11 2012年 目的:寻找补肾壮筋汤的有效成分群,探讨补肾壮筋汤治疗骨性关节炎的作用机制,为其临床治疗骨性关节炎及中药的现代开发提供依据。方法:以补肾壮筋汤的药物成分为研究对象,从中药原植物化学成分手册和北京大学中草药数据库中收集该方所含化合物,共收集到250个分子式。选择白细胞介素-lβ、肿瘤坏死因子-α、环氧化酶-2和诱导型一氧化氮合酶为靶点,应用Discovery Studio 2.0软件进行分子对接计算,以DOCKSCORE参数值为评价指标,观察补肾壮筋汤的药物成分与靶点蛋白的匹配程度。结果:补肾壮筋汤中有25种化合物,每种能同时对2或3种靶点有抑制效应;还有10种化合物,每种仅对1种靶点有抑制效应。结论:补肾壮筋汤治疗骨性关节炎的药效物质基础是有效成分群,补肾壮筋汤治疗骨性关节炎具有多靶点效应。 郑春松 叶蕻芝 李西海 许惠凤 吴广文 刘献祥关键词:骨关节炎 中草药 中药药理学 补肾壮筋汤 基于计算机模拟探讨海桐皮汤治疗骨性关节炎的多向药理学行为 被引量:10 2013年 目的探讨海桐皮汤治疗骨性关节炎潜在的多向药理学行为。方法利用分子对接、生物网络等计算机模拟方法,构建治疗骨性关节炎的海桐皮汤分子集配体-靶作用网络,研究海桐皮汤的作用特点。结果虚拟筛选出215个潜在的活性化合物,其中,94个化合物与2个或2个以上的蛋白质有相互作用;所构建网络中配体-靶的作用关系曲线遵循幂函数规律。结论海桐皮汤中化合物与骨性关节炎靶标的作用具有"一对多,多对一"的非线性特点,提示海桐皮汤存在多向药理学行为,为海桐皮汤的骨性关节炎临床应用提供了科学依据。 郑春松 徐筱杰 叶蕻芝 吴广文 刘国强 刘献祥关键词:海桐皮汤 分子对接 骨性关节炎 分子对接法预测独活寄生汤对TNF-α和IL-1β作用的活性成分 被引量:15 2012年 目的探讨独活寄生汤中作用于TNF-α和IL-1β受体的成分。方法采用Discovery Studio 2.0软件,通过Dock Ligands(LigandFit)模块,研究独活寄生汤中成分与受体TNF-α和IL-1β之间的相互作用,在此基础上发现潜在的活性成分。结果以TNF-α和IL-1β为靶点,与原配体的打分阈值对比,从复方中筛出与其结合较好的成分分别有10个和1个。结论独活寄生汤治疗骨性关节炎的机制,可能与其能有效降低患者关节液中IL-1β和TNF-α水平有关。 郑春松 叶蕻芝 许惠凤 李西海 吴广文 刘献祥关键词:分子对接 独活寄生汤 骨性关节炎 肿瘤坏死因子-Α 基于计算机模拟探讨补肾壮筋汤中化合物的结构多样性和类药性 被引量:4 2012年 目的探讨补肾壮筋汤分子集结构的结构多样性和类药性。方法采用Accelrys公司Discovery Studio软件包,通过Cluster Ligands模块分子聚类,研究补肾壮筋汤分子集中化合物结构的多样性;通过QSAR模块进行补肾壮筋汤分子集、骨性关节炎公认靶酶相关药物/类药分子分子集的重要描述符和化学空间比较,分析补肾壮筋汤分子集中化合物的类药性。结果补肾壮筋汤分子集中化合物分为十类,其物理化学性质及化学空间比药物/类药分子具有多样化。结论补肾壮筋汤中化合物有良好的多样性,既有类药性质,也是天然产物化合物的一个特殊子集。 郑春松 叶蕻芝 李西海 许惠凤 吴广文 刘献祥关键词:补肾壮筋汤 多样性 类药性 骨性关节炎 青风藤治疗骨性关节炎药效物质基础多靶导向作用的计算机模拟研究 被引量:23 2012年 目的探讨青风藤治疗骨性关节炎(osteoarthritis,OA)的药效物质基础,并对青风藤多靶导向作用做出药效学阐释。方法 (1)构建青风藤化学成分分子数据库,应用分子对接探讨其与OA重要靶标的相互作用;(2)构建青风藤所含分子配体-靶作用网络及DrugBank药物库中有关OA的药物分子配体-靶作用网络,分析其网络特征,阐明青风藤治疗OA作用机制和特点。结果青风藤中共有14个化学成分分子与2个及2个以上靶点相互作用,其中6个化学成分分子对4个及4个以上靶点有作用效应。青风藤分子配体-靶作用网络与药物分子配体-靶作用网络的轮廓和特征相似。结论青风藤存在多成分、多靶导向效应,且部分成分存在多靶导向效应,为青风藤治疗OA的药效学分子机制提供了解释,同时也为寻找治疗OA的新型药物提供一定的参考和借鉴。 郑春松 徐筱杰 叶蕻芝 刘献祥关键词:青风藤 药效物质基础 计算机模拟 多靶点 骨性关节炎 基于计算机模拟探讨六味地黄丸治疗骨关节炎的多成分-多靶点作用 被引量:6 2013年 目的:探讨六味地黄丸治疗骨关节炎的多成分-多靶点作用。方法:以六味地黄丸所含的183个化合物和与骨关节炎相关的13个靶点蛋白质为研究对象,利用描述符计算、主成分分析、分子对接等计算机模拟方法,分析六味地黄丸所含化合物的物理化学性质及其作用的靶点,并据此构建六味地黄丸多成分-多靶点作用网络。结果:六味地黄丸所含化合物具有多样的物理化学性质,这些化合物与治疗骨关节炎药物分子、类药分子具有相似的化学空间。六味地黄丸多成分-多靶点网络模型中每个化合物的平均靶点数为2.24,平均每个靶点与5个化合物相关联。结论:六味地黄丸治疗骨关节炎具有多成分、多靶点作用的特点,可能在治疗骨关节炎方面具有良好的应用前景。 郑春松 叶蕻芝 蔡亮亮 陈加守 魏磊生 刘献祥关键词:六味地黄汤 骨关节炎