新疆维吾尔自治区自然科学基金(2009211A30)
- 作品数：5 被引量：48H指数：4
- 相关作者：杨天燕郭焱孟玮海萨马燕武更多>>
- 相关机构：新疆维吾尔自治区水产科学研究所更多>>
- 发文基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金国家自然科学基金新疆生物资源基因工程重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 塔里木裂腹鱼群体遗传多样性的AFLP分析被引量：3
- 2012年
- 采用AFLP技术对喀拉喀什河、塔什库尔干河、阿克苏河多浪渠首、木扎提河4个群体共80尾塔里木裂腹鱼(Schizothorax biddulphi Günther)个体进行了遗传多样性分析。6对选择性扩增引物共扩增得到212个位点,其中多态性位点141个,多态位点比例为66.51%。4个群体的Shannon多样性指数(I)为0.316 9-0.544 3,Nei’s遗传多样性指数(H)为0.213 9-0.376 2,群体间的遗传距离为0.078 1-0.250 2。塔什库尔干河群体的多态位点比例、Shannon多样性指数和Nei’s遗传多样性指数均高于其它三个群体。AMOVA分析结果显示,群体总遗传变异85.17%来自群体内差异,而14.83%来自群体间差异,表明塔里木裂腹鱼遗传变异主要来源于群体内个体间,但群体间已存在一定程度的遗传分化。用UPGMA方法构建的群体系统进化树显示,多浪渠首群体和木扎提河群体首先聚类,然后依次与塔什库尔干河群体、喀拉喀什河群体聚类,这一方面与地理位置有关,另一方面与河流的自然环境有关。
- 杨天燕郭焱孟玮马燕武陈朋
- 关键词：AFLP分析
- 塔里木裂腹鱼群体遗传结构及遗传多样性分析被引量：22
- 2012年
- 塔里木裂腹鱼为塔里木河水系特有濒危裂腹鱼类。研究采集5个群体(多浪渠首、喀拉喀什河、木扎提河、塔什库尔干、玉龙喀什河)塔里木裂腹鱼,扩增线粒体控制区第一高变区,共获得长度456 bp序列95条。塔里木裂腹鱼单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.7118、0.0024。AMOVA分析显示,群体间遗传分化显著。FST值统计检验表明,除喀拉喀什河群体与玉龙喀什河群体之间差异不显著外,其他两两群体之间都是显著的。分子系统树和单倍型网络图分析表明,塔里木裂腹鱼单倍型间关系较近。中性检验和mismatch分析显示,塔里木裂腹鱼群体经历过近期群体扩张事件。根据核苷酸不配对分布τ值计算其群体扩张时间为20万年前。天山、昆仑山的运动以及第四纪冰期-间冰期的变化可能影响了塔里木裂腹鱼的群体历史动态。
- 孟玮郭焱海萨杨天燕马燕武谢春刚
- 新疆几种裂腹鱼类系统发育关系探讨被引量：15
- 2011年
- 通过PCR扩增获得了分布于新疆的裂腹鱼亚科(Schizothoracinae)4属7种鱼类的线粒体细胞色素b基因712 bp序列。结果表明:Cyt b基因片段的T,C,A和G碱基组成平均为30.1%,27.4%,25.6%和16.9%,共出现201个变异位点,其中简约信息位点162个,序列变异度为22.8%,转换/颠换为15.03,且碱基替代主要发生在密码子第3位点。基于Kimura双参数模型构建NJ和MP系统树以及基于最佳核苷酸替代模型,构建ML系统树结果均显示,同为原始等级裂腹鱼类的扁吻鱼和裂腹鱼属鱼类亲缘关系较近,而特化等级裂腹鱼类的斑重唇鱼和新疆裸重唇鱼亲缘关系较近。依据分子进化速率推测两个类群间发生分歧的时间约在上新世晚期到中新世间,伴随青藏高原隆起这一地质事件。
- 杨天燕孟玮海萨张人铭郭焱
- 关键词：裂腹鱼类线粒体细胞色素B基因系统发育
- 扁吻鱼和塔里木裂腹鱼线粒体COI基因片段的比较研究被引量：12
- 2011年
- 对扁吻鱼(Aspiorhynchus laticeps)和塔里木裂腹鱼(Schizothoraxbiddulphi)细胞色素c氧化酶亚基(COI)基因片段进行扩增。通过序列测定得到624bp的基因片段,无碱基的插入和缺失,A、T、G、C碱基中G含量最低,A+T含量高于G+C含量,与其它鱼类COI基因片段研究结果相一致。2个种间共检测到38处核苷酸替换,其中35处碱基转换,3处碱基颠换,蛋白质编码基因上的核苷酸替代主要是密码子第3位点上的同义替换。在编码的208个氨基酸中,仅发生2处氨基酸替代,替代率为0.96%。采用Kimura-2法计算种间平均遗传距离为0.06,以鲤作外群构建NJ系统树,扁吻鱼和塔里木裂腹鱼亲缘关系较近,而与新疆裸重唇鱼、斑重唇鱼亲缘关系较远。
- 杨天燕张人铭郭焱孟玮海萨马燕武
- 关键词：扁吻鱼线粒体COI基因
- 2种珍稀裂腹鱼类线粒体DNA部分序列片段的比较分析被引量：6
- 2011年
- 对扁吻鱼(Aspiorhynchus laticeps)及塔里木裂腹鱼(Schizothorax biddulphi)线粒体COⅠ(624 bp)、Cyt b(712 bp)和D-loop(457 bp)基因片段进行了PCR扩增和序列测定。通过分析比较发现,3个片段A+T含量与其他鱼类相比均较高,G含量偏低这一现象在2个蛋白质编码基因第3位点上显得尤为突出。2种裂腹鱼种内个体间序列变异较小。3个基因片段的核苷酸替代速率依次为D-loop>Cyt b>COⅠ。基于核苷酸最佳替换模型计算2种裂腹鱼在3个基因片段的遗传距离,COⅠ为0.055,Cyt b为0.060,D-loop为0.074。基于Cyt b基因片段序列分析结果表明,扁吻鱼和塔里木裂腹鱼发生遗传分化时间大约在距今3.57百万年左右的上新世,分化时间早于特化等级和高度特化等级裂腹鱼类。塔里木河水系处于青藏高原北部边缘地带,在地理发育上属于青藏高原的一部分,新疆裂腹鱼类的进化一定程度上受到青藏高原隆起这一地质事件的影响。
- 杨天燕孟玮张人铭郭焱海萨谢春刚
- 关键词：扁吻鱼线粒体DNA
