新疆维吾尔自治区自然科学基金(2010211A17)
- 作品数:4 被引量:23H指数:4
- 相关作者:韩剑罗明张祥林殷智婷董代幸更多>>
- 相关机构:新疆农业大学新疆出入境检验检疫局阿克苏地区农业检验监测中心更多>>
- 发文基金:新疆维吾尔自治区自然科学基金新疆维吾尔自治区高校科研计划质检公益性行业科研专项项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 枣疯病植原体新疆分离物16S rDNA基因克隆与序列分析被引量:10
- 2012年
- 利用植原体16SrDNA基因保守序列通用引物对新疆阿克苏地区和喀什地区的疑似枣疯病植株总DNA进行常规PCR和巢式PCR检测,分别扩增出1.5kb和1.2kb的特异性片段。对片段进行克隆、序列测定分析及系统发育树构建,结果表明,新疆枣疯病阿克苏分离物和喀什分离物的16SrDNA基因序列同源性极高,达到100%,与16SrⅤ组植原体的同源性达到98.4%以上,并且与16SrⅤ-B亚组中的枣疯病山东莱芜株系、山东龙口株系同源性最高,达到99.5%,因此归属于榆树黄化组16SrⅤ-B亚组。首次报道新疆枣疯病植原体16SrDNA的序列,确定新疆枣疯病植原体的分类地位,为枣疯病的早期诊断和检测提供依据。
- 韩剑徐金虹王同仁殷智婷罗明董代幸
- 关键词:枣疯病植原体RDNA
- 南疆红枣产区枣疯病发生现状及主导因子分析被引量:4
- 2017年
- 【目的】枣疯病是枣树生产中的毁灭性病害。研究南疆枣疯病发生危害现状及主导因子,可为该病的预测预报和防治提供依据。【方法】连续4年对新疆阿克苏地区、喀什地区枣疯病发生情况进行调查及分子检测,并分析了种植模式与管理水平、枣树品种与种植年限、传播方式等因素对枣疯病发生的影响。【结果】目前,新疆南疆红枣产区枣疯病尚属零星、团簇状分布。嫁接育苗是多数枣产区病园内苗期和幼树发病以及病害从病区传入无病区的主要原因,酸枣实生苗也是不可忽视的病害侵染来源。不同枣树品种对枣疯病的田间抗性表现出一定的差异。利用巢氏PCR检测及TaqMan探针实时荧光定量PCR检测技术对田间样品的检测结果显示,病园内存在着比例不等的无症带菌植株。【结论】无症带菌苗的人为传播是导致南疆地区枣疯病发生和流行的主导因素。
- 韩剑罗明徐金虹王同仁张祥林项雪峰
- 关键词:枣疯病植原体
- 新疆枣疯病植原体tuf基因的克隆与序列分析被引量:7
- 2013年
- 【目的】枣疯病是一种重要的植原体病害,了解新疆枣疯病植原体的系统发育关系及遗传分化,获取其分子特征信息。【方法】利用植原体tuf基因通用引物fTufu/rTufu对新疆枣疯病病株总DNA进行PCR扩增,对部分扩增片段克隆、测序及相似性分析。【结果】获得新疆枣疯病阿克苏株系(JWB-ASZ)和喀什株系(JWB-KHZ)的tuf基因片段分别为841和814 bp。经同源性比较分析,新疆枣疯病阿克苏株系(JWB-ASZ)与喀什株系(JWB-KHZ)均隶属于16S rⅤ-B亚组枣疯病植原体。其中JWB-KHZ株系与枣疯病植原体河北株系的tuf基因核苷酸及氨基酸同源性最高,分别达到90.2%和81.5%;JWB-ASZ与枣疯病植原体陕西株系的tuf基因核苷酸及氨基酸同源性最高,分别达到94.2%和94.6%,而与16S rⅤ其它亚组的核苷酸及氨基酸同源性均低于70%。枣疯病阿克苏株系与喀什株系的tuf基因核苷酸及氨基酸序列之间存在明显差异,同源性仅为为73.5%和63.5%。【结论】研究报道了新疆枣疯病植原体tuf基因序列,为揭示新疆枣疯病植原体不同株系的分子特征、分子变异和遗传多样性提供了基础。
- 韩剑徐金虹王同仁张祥林罗明
- 关键词:枣疯病植原体
- 枣疯病植原体TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法的建立被引量:7
- 2014年
- 根据枣疯病植原体16SrDNA基因保守区域设计、合成特异性引物和TaqMan探针,以构建的重组质粒作为阳性标准品,建立并优化了对枣疯病植原体的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。对优化后的方法进行灵敏度、特异性及稳定性评价,制作了标准曲线。结果显示,制作的标准曲线有极好的线性关系,相关系数(r2)达到0.998,建立的实时荧光定量PCR检测方法能够特异性地检测枣疯病植原体,能检测到60拷贝的质粒DNA。本研究建立的实时荧光定量PCR检测方法灵敏度、特异性、重复性好,不仅能够实现对枣疯病植原体的快速检测,而且为实现从病原定量水平上对枣疯病病情分级奠定了基础。
- 韩剑罗明徐金虹王同仁张祥林
- 关键词:枣疯病植原体TAQMAN探针实时荧光定量PCR