教育部科学技术研究重点项目(211205)
- 作品数：6 被引量：3H指数：1
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- 主成分和二肽分析抗癌晶体蛋白氨基酸组成特征
- 2012年
- 主成分分析结果表明,抗癌晶体蛋白的氨基酸组成满足公式:0.340C+0.358D+0.518E+0.109G+0.478H+0.525L+0.148N+0.565R+0.520W+0.123Y<0.260A+0.408F+0.033I+0.142K+0.246M+0.435P+0.515Q+0.571S+0.444T+0.110U–0.7。二肽组成分析结果表明,抗癌晶体蛋白中S*型二肽含量最高,A*、M*、P*及Q*型二肽次之,其含量也很高。研究结果初步揭示了抗癌晶体蛋白的氨基酸组成特征,为进一步深入研究其构效关系奠定了基础。
- 洪雪梅林毅
- 关键词：抗癌晶体蛋白氨基酸组成主成分分析构效关系
- Cry1A型杀虫晶体蛋白活性区的空间结构比较分析
- 2016年
- 对9种代表性Cry1A型杀虫晶体蛋白成员进行活性区空间结构的同源模建与比较分析.分析结果表明:DomainⅠ和DomainⅢ相对保守,其中,DomainⅠ整体走向及结构基本重叠,只有Cry1Aa和Cry1Af多了一个螺旋;DomainⅡ的主要差异体现在loop上;将DomainⅢ结构一致的成员Cry1Ab,Cry1Ad,Cry1Ae和Cry1Af归为一个亚型,其他5种成员归为另一个亚型.研究确定了影响Cry1A型杀虫晶体蛋白结构差异的关键氨基酸及关键结构片段.
- 刘肖萍林毅
- 关键词：苏云金杆菌CRY1构效关系
- Ⅱ型抗癌晶体蛋白的芳香族氨基酸及其与抗肝癌活性间的关系被引量：1
- 2012年
- 利用氨基酸序列比对,蛋白质间相互作用位点预测和蛋白质与蛋白质对接,研究Ⅱ型抗癌晶体蛋白的氨基酸组成与其抗肝癌活性之间关系.结果表明:Ⅱ型抗癌晶体蛋白分子上位点49,51,52,55～60,194和205～212的氨基酸残基,特别是芳香族氨基酸在配体和受体蛋白质间的相互作用中起着重要作用;在Hex的蛋白质与蛋白质对接中,配体P11和P32与受体甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)的结合能量最低,表明P11和P32更容易与GAPDH结合.
- 陈爱明林毅
- 关键词：苏云金芽孢杆菌分子对接甘油醛-3-磷酸脱氢酶
- 新型杀虫晶体蛋白Cry7Ab4空间结构的计算机解析被引量：1
- 2012年
- 采用一级结构分析,二级结构预测及同源比对建模的方法,模拟出新型杀虫晶体蛋白Cry7Ab4的空间结构,并进行动力学优化.结合其杀大猿叶甲活性数据与蛋白结构比对分析,发现Cry7Ab4与Cry7Aa1的活性差异主要归因于α3,α4上疏水性氨基酸的不同.
- 洪雪梅林毅
- 关键词：苏云金芽孢杆菌杀虫晶体蛋白空间结构构效关系
- Ⅱ型抗癌晶体蛋白抗肝癌作用的关键芳香族氨基酸被引量：1
- 2013年
- 为探讨Ⅱ型抗癌晶体蛋白(Parasporin-2)上与抗肝癌作用相关的关键氨基酸,利用5-BU对Parasporin-2活性区编码DNA(P2Y)进行PCR诱变,之后在大肠杆菌中表达,产物纯化后经MTT法检测其对肝癌细胞系和正常肝细胞系的作用。获得的9个突变体其抗肝癌活性差异极大,其中P2M1和P2M8对两种肝癌细胞系SMMC7721和Bel7402均有较强的细胞毒杀作用而不影响正常肝细胞系Chang-liver。比较了P2M1、P2M8和P2Y的二级结构与三级结构,发现二级结构上的变化如β折叠变长或α螺旋增加影响着Ⅱ型抗癌晶体蛋白的抗肝癌活性。基于突变体间氨基酸序列比对、突变体与受体间分子对接以及模拟突变等研究的结果表明,位点52、56、58和208上的氨基酸残基特别是芳香族氨基酸在Parasporin-2与受体间的互作中可能起着重要作用。
- 廖利民林淑芳田凌陈爱明林毅
- 关键词：突变体抗肝癌
- 蛋白质突变仿真&虚拟筛选系统的开发和应用
- 2012年
- 筛选因过程复杂造成费钱费时费力,成为定向进化的瓶颈。因此,开发出蛋白质突变仿真&虚拟筛选系统,以部分替代实验筛选,提高筛选效率,具有十分重要的意义。利用对字符串的随机替换来模仿蛋白质序列的突变,通过加权二肽组成、偏最小二乘回归等数学模型对产生的蛋白质序列进行筛选。开发的蛋白质突变仿真&虚拟筛选系统软件,可以部分替代实验筛选。软件在WINDOWS XP及DotNetFramework 2.0下运行稳定,计算速度快,拟合结果良好,基本可以满足数据处理的需要。软件的参数灵活可调,能够输出各种数据,可以方便分析验证,也可与其它软件整合进行数据分析以达到研究目的。
- 洪雪梅林毅张光亚
