国家公益性行业科研专项(2005DIB4J024)
- 作品数：4 被引量：83H指数：4
- 相关作者：孙效文鲁翠云朱晓东耿波李娇更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院黑龙江水产研究所上海水产大学吉林大学更多>>
- 发文基金：国家公益性行业科研专项国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 利用30个微卫星标记分析长江中下游鲢群体的遗传多样性被引量：41
- 2007年
- 利用30对微卫星分子标记对长江中下游5个鲢群体进行了遗传多样性分析。结果表明:在30个基因座中,共检测到144个等位基因,每个座位检测到的等位基因数为1～10个,其中有25个座位具有多态性,多态位点百分率为83.33,5个群体的平均等位基因数A为4.0/4.1,平均有效等位基因数Ne为2.4445～2.6332,平均观察杂合度Ho为0.3233～0.3511,平均期望杂合度He为0.4421～0.4704,平均多态信息含量PIC为0.4068～0.4286。对数据进行F-检验,Fst值表明群体间的遗传分化程度中等,并对基因型进行了基于Hardy-Weinberg平衡的卡方检验,所得P值说明5个群体均一定程度上偏离了平衡。5个群体间的遗传相似系数为0.8466～0.9146,遗传距离为0.0893～0.1665,并根据Nei氏标准遗传距离用UPGMA方法对5个鲢群体进行亲缘关系聚类。
- 朱晓东耿波李娇孙效文
- 关键词：微卫星野生群体
- 草鱼基因组中微卫星分子标记的制备及筛选被引量：10
- 2007年
- 采用新型的生物素-磁珠吸附微卫星富集法与传统的放射性同位素杂交法相结合的方式,研究了草鱼(Ctenopharyngodon idella)基因组中存在的微卫星资源。结果,从1 000个细菌中,挑出90个阳性克隆,把其中45个进行测序分析,在这些序列中共含有68个微卫星核心序列,有55个含有重复次数大于5次的微卫星核心序列。其中,单一型标记49个,占72%,包括CA重复单元共22个,GT重复单元共18个,其他重复单元为9个;在72%的单一型标记中,完美单一型微卫星标记为44个,占65%。另外,混合型标记共19个,13为完美混合型;在所有微卫星标记中,CA重复类型最普遍,依次为GT、GA等。在68个微卫星标记中,有15个依据引物设计原理设计了引物。
- 马海涛鲁翠云于冬梅孙效文
- 关键词：草鱼生物素磁珠微卫星
- 镜鲤繁殖群体的遗传结构及微卫星标记与经济性状的相关性分析被引量：31
- 2008年
- 选用35个多态性微卫星分子标记对天津换新良种场镜鲤一个繁殖群体的有效等位基因数（Ae）、观测杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、多态信息含量（PIC）等进行了检测,以卡方检验估计群体Hardy-Weinberg平衡。结果表明：在35个基因座共检测到118个等位基因,平均等位基因数为3.37个,每个座位检测到的等位基因数2～7个不等,平均有效等位基因数为2.16,观测杂合度平均值0.431,无偏期望杂合度的平均值为0.4736,平均多态信息含量0.42,说明这个群体属于中度多态,遗传多样性水平不高。卡方检验的P值显示多于半数的位点都发生了偏离。并将35个基因座的不同基因型与个体的体重、体长值进行了连锁分析,得到了4个与体重、体长连锁的基因型,并将所得结果与鲤鱼体长性状QTL定位结果进行对比,其中HLJ319标记与QTL定位结果基本一致。分析了几个严重偏离平衡的基因型,并讨论出现这种现象的可能原因。
- 孙新魏振邦孙效文张研鲁翠云
- 关键词：镜鲤微卫星
