国家重点实验室开放基金(2005-05)
- 作品数:5 被引量:32H指数:3
- 相关作者:张云泉刘胜飞吴锦容潘浣钰赵厚本更多>>
- 相关机构:中国科学院软件研究所中国科学院大学中国科学院华南植物园更多>>
- 发文基金:国家重点实验室开放基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于共享存储和Gzip的并行压缩算法研究被引量:8
- 2009年
- Gzip无损压缩算法。尽管gzip算法能够取得很好的压缩比,但它在分析和压缩编码的过程需要进行大量的计算。为了缩短压缩时间,提出了一种基于共享存储的并行压缩策略。采用OpenMP标准和"生产者/消费者"模型实现了gzip的并行压缩版本。在Beowulf集群中的一个SMP节点(双CPU)和曙光天阔服务器(4路双核)上的测试表明,并行化的gzip程序取得了极大的性能提升,尤其是大文件的压缩。
- 宋刚蒋孟奇张云泉刘胜飞
- 关键词:共享存储并行编程数据压缩OPENMPGZIP
- 基于机群架构的并行数据库中间件系统改进研究
- 基于机群架构的高性能计算机已经被应用到很多领域,如大气预测、油藏模拟、CFD仿真模拟和Web服务等.随着数据量的爆炸式增长,传统的集中式的数据库系统已经难以满足各种应用的需求,基于机群式架构的并行数据库系统为增强海量数据...
- 陈虎张云泉柳锴李玉成
- 关键词:并行数据库中间件MPI
- 文献传递
- 基于机群架构的并行数据库中间件系统改进研究被引量:1
- 2007年
- 基于机群架构的高性能计算机已经被应用到很多领域,如大气预测、油藏模拟、CFD仿真模拟和Web服务等.随着数据量的爆炸式增长,传统的集中式的数据库系统已经难以满足各种应用的需求,基于机群式架构的并行数据库系统为增强海量数据的存储以及处理能力提供了一种途径.对以前实现的一个基于机群架构的并行数据库中间件系统ParaMidSQL进行了改进.通过对并行选择、并行排序、并行连接等关键操作的测试,给出对并行数据库中间件系统改进后的性能分析.
- 陈虎张云泉柳锴李玉成
- 关键词:并行数据库中间件MPI
- 土壤水分变化对外来入侵植物飞机草生长的影响被引量:19
- 2007年
- 以外来入侵植物飞机草为研究对象,设计3个水分梯度(15mm,10mm,5.83mm),研究飞机草的叶绿素含量、生物量、光合生理特征等指标对土壤含水量变化的响应。结果表明,随着土壤水分含量的降低,飞机草的单位叶面积干质量、叶绿素含量、净光合速率、气孔导度、蒸腾速率、胞间CO2摩尔分数、光饱和点等都呈下降趋势。同时,根冠比和水分利用率随着水分胁迫的加重而有所提高,表明飞机草对土壤水分胁迫有一定的适应能力,但总体而言,土壤水分胁迫不利于飞机草的生长,限制了其向降雨量较少的地区入侵。
- 吴锦容赵厚本潘浣钰彭少麟
- 关键词:飞机草土壤水分变化生物量光合特征
- 基于自索引的DBF压缩查询工具研究
- 2009年
- 介绍了DBF表的文件格式和基于自索引的全文查询算法FM-index。针对DBF文件同时包含二进制文件头和纯文本数据记录的特点,以及对查询结果的特定要求,扩充了现有的FM-index算法,使其支持对DBF文件的压缩查询。测试结果表明,虽然FM-index在压缩/解压时间上与WinRAR仍有一段差距,但是FM-index对压缩查询功能的支持大大提高了文件的查询性能。
- 刘胜飞张云泉张迪
- 关键词:全文索引数据库表查询
- 万亿次机群系统高性能应用软件运行现状分析被引量:4
- 2005年
- 通过调用PAPI(PerformanceApplicationProgrammingInterface)接口函数[6]对2004年3月~4月之间运行在国家应用“973”计划项目LSSC-II万亿次机群系统上部分应用程序进行了跟踪,收集到了大量宝贵的性能数据。依据这些性能数据信息,对我国当前高性能软件的运行情况给出了初步分析。分析结果表明,目前大部分应用程序性能都处于较低水平,并行程序使用处理器的数目范围一般为1~64个,处理器平均效率低于10%,平均性能低于300Mflops。
- 侯晓吻张林波张云泉
- 关键词:性能分析