国家自然科学基金(30270948)
- 作品数:9 被引量:20H指数:3
- 相关作者:孙金海闫守庆姜丽花赵雯张廷荣更多>>
- 相关机构:吉林大学青岛农业大学中山大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家农业科技成果转化资金教育部科学技术研究重点项目更多>>
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- 银狐α-卫星DNA的克隆及序列分析
- 2009年
- 利用限制性内切酶Sac I酶切银狐基因组,经琼脂糖凝胶电泳,对特异性亮带进行克隆、测序及序列分析。结果获得9个银狐α-卫星DNA序列,该卫星DNA单体大小为737bp,G+C平均为52.7%,单体之间同源性为90%-97%,每个单体由3个约245bp的亚重复串联构成,亚重复之间的同源性为51%-57%。银狐与犬α-卫星DNA的同源性约为77%,而与蓝狐α-卫星DNA的同源性大于90%。α-卫星DNA在蓝狐基因组内的含量显著高于银狐。由于银狐(2n=34+Bs)与蓝狐(2n=50)染色体数目存在较大差异,因此推测α-卫星DNA可能参与了染色体易位,是染色体断裂与融合的靶序列。
- 闫守庆范宗兴刘洋邢沈阳赵志辉孙金海
- 关键词:银狐蓝狐卫星DNA
- 猪13/17罗伯逊易位染色体的显微分离与微克隆
- 以13/17罗伯逊易位纯合子猪[2n=36,XY或XX,rob(13;17)]为实验材料,制备其有丝分裂中期染色体,利用显微分离技术对13/17罗伯逊易位染色体进行分离,并将单条染色体进行LA-PCR扩增,其扩增片段大小...
- 耿克祥闫守庆李冰孙金海
- 关键词:罗伯逊易位显微分离
- 文献传递
- 银狐着丝粒卫星DNA序列的克隆及序列分析
- 本实验利用限制性内切酶Sac I酶切银狐基因组DNA,经1.0%凝胶电泳,回收特异性亮带,连接pUC18载体,转化DH5 α大肠杆菌,随机挑取10个阳性克隆测序采用DNAMAN 和BLAST进行序列分析, 其中9个克隆为...
- 闫守庆耿克祥李冰祝万菊孙金海
- 关键词:银狐卫星DNA
- 文献传递
- 13/17罗伯逊易位猪生长抑素基因的多态性研究被引量:1
- 2009年
- 采用微量全血培养法制备染色体标本,对13/17罗伯逊易位猪的3种杂交组合的309头后代进行核型鉴定,结果样本中存在3种核型的猪:正常核型猪(2n=38)、易位杂合子猪(2n=37)和易位纯合子猪(2n=36);利用PCR-SSCP技术检测发现生长抑素基因外显子1不存在多态性;其内含子的266~602 bp片段存在2个突变位点(T520C,G521T),但仅检测到2种基因型:AA和AB。遗传多态性分析结果表明,不同杂交组合后代及不同核型的猪群中AA基因型频率(频率范围为0.58~0.77)和A等位基因频率(频率范围为0.79~0.90)均显著高于其AB基因型频率(0.23~0.42)和B等位基因频率(0.10~0.21);易位杂合子猪的AB基因型频率(0.42)均高于正常猪(0.25)及易位纯合子猪(0.40)。经卡方检验,差异不显著(P〉0.05),群体的基因型频率处于哈代-温伯格平衡状态。
- 赵雯姜丽花何晓波张廷荣孙金海
- 关键词:罗伯逊易位内含子SSCP单核苷酸多态性
- 猪单条13/17罗伯逊易位染色体的显微分离与LA-PCR扩增被引量:4
- 2007年
- 以13/17罗伯逊易位纯合子猪[2n=36,XY或XX,rob(13;17)]为试验材料,制备其有丝分裂中期染色体,利用显微分离技术对13/17罗伯逊易位染色体进行分离,并将单条染色体进行LA-PCR扩增,其扩增片段大小主要在200~2800bp;对LA-PCR扩增产物用猪13、17号染色体近着丝点微卫星标记SWR1941和SWR1120与Southern杂交2种方法进行鉴定,结果表明LA-PCR产物来源于13/17罗伯逊易位染色体。该方法的成功建立为进一步从分子水平上研究家猪13/17罗伯逊易位所引起的表型效应的遗传机制以及筛选猪13和17号染色体上新的分子遗传标记奠定了基础。
- 耿克祥闫守庆李冰孙金海
- 关键词:罗伯逊易位显微分离微卫星
- 13/17罗伯逊易位猪POU1F1基因多态性与经济性状的相关分析被引量:2
- 2008年
- 利用外周血淋巴细胞培养制备染色体标本,对13/17罗伯逊易位猪的3种杂交组合的394头后代猪进行分群;应用PCR-RFLP技术在POU1 F1基因的扩增片段(1746 bp)中检测到1个RsaⅠ限制性内切酶的多态酶切位点A(3种基因型);应用PCR-SSCP技术检测1个POU1 F1基因第5内含子上的突变E(2种基因型),同时结合生长和胴体品质测定记录研究基因型对生产性状的遗传效应。结果表明,位点A的基因型对生长有显著影响(P<0.05),位点E基因型对生长和眼肌面积有显著影响(P<0.05)。研究结果初步揭示POU1 F1多态性与生长、眼肌面积等存在相关,推测POU1 F1多态性可作为罗伯逊易位杂合优势遗传机制的一种分子水平上的解释。
- 姜丽花赵雯何晓波孙金海张廷荣杜方磊
- 关键词:罗伯逊易位POU1F1基因核型
- 猪着丝粒卫星DNA序列的克隆及序列分析
- 本研究根据已报道的家猪着丝粒卫星DNA序列设计引物,在正常家猪脾脏组织DNA 进行PCR扩增,目的片段经纯化后克隆到pUCm-T载体,挑取阳性克隆进行序列测定。序列分析结果表明:目的片段长621bp,所测得序列间的同源性...
- 李冰闫守庆耿克祥孙金海
- 关键词:着丝粒卫星DNA
- 文献传递
- 兔(AG)_n微卫星DNA富集文库的构建与鉴定被引量:5
- 2006年
- 目的:微卫星遗传标记具有数量大、分布广且多态信息含量高等优点,因而被广泛用于动植物遗传图谱的构建、QTL定位、标记辅助选择及亲缘关系鉴定等领域。方法:采用亲和捕捉法。结果:构建了兔(AG)n微卫星DNA序列的富集文库,文库含重组克隆4 850个,其中含有(AG)n微卫星DNA序列的阳性克隆占66.7%。
- 闫守庆王慧芳孙金海
- 关键词:微卫星
- 貉α-卫星DNA的克隆及序列分析
- 2008年
- 根据蓝狐、银狐及犬α-卫星DNA序列设计引物RSP1和RSP2,在貉基因组中经PCR扩增获得5条分子质量大小不同的DNA片段,分别命名为RSP1~RSP5,经克隆及测序获得14个RSP序列;序列分析表明,除RSP4外,同类RSP片段的不同序列的长度差异很小且同源性大于90%,不同种类的RSP片段的长度差异很大,最大为1 815 bp,最小为495 bp,但所有序列的3′端约500 bp序列都具有高度的同源性,大于90%;经Blast检索,所克隆的RSP序列的部分区域与蓝狐、银狐及犬α-卫星DNA序列具有约75%的同源性,证明所克隆的RSP序列为貉α-卫星DNA序列,但其单体大小及亚重复的组成还需进一步研究。
- 闫守庆范宗兴祝万菊邢沈阳赵志辉孙金海
- 关键词:犬科动物卫星DNA
- 13/17罗伯逊易位猪SRY基因的克隆及其序列分析被引量:1
- 2006年
- 以13/17罗伯逊易位纯合子(2n=36)、杂合子猪[2n=37,XY或XX,rob(13;17)]及正常猪为试验材料,根据猪SRY基因蛋白质编码区的核心序列,设计PCR引物,扩增得到SRY基因片段,随机选取克隆质粒进行测序分析。结果表明,13/17罗伯逊易位纯合子猪与正常猪的SRY基因的核心序列相比有1个碱基发生突变;而13/17罗伯逊易位杂合子猪与正常猪SRY基因的核心序列相比有5个碱基发生突变。
- 帅丽芳孙金海赵勇
- 关键词:染色体罗伯逊易位SRY基因