国家科技重大专项(2012ZX10002011)
- 作品数：2 被引量：19H指数：1
- 相关作者：许国旺李艳丽罗萍尹沛源华瑞更多>>
- 相关机构：中国科学院吉林大学第一医院大连理工大学更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学医药卫生更多>>
- 基于拟靶向液相色谱-质谱联用的胃癌患者血清代谢组分析被引量：19
- 2014年
- 胃癌是一种高发的恶性肿瘤,是癌症相关死亡的第二大病因。早期筛查是提高患者生存率的有效手段,但目前临床上尚缺乏实现胃癌无创筛检的可靠标志物。本研究采用了基于液相色谱-质谱联用的拟靶向代谢组学方法分析了20例胃癌患者及40例正常人血清代谢组,以期发现新的潜在代谢标志物。代谢组数据的主成分分析和偏最小二乘法数据分析结果显示,胃癌患者与健康人群的血清代谢组存在明显的差异,结合非参数检验进一步筛选并定性出57个差异代谢物。其中二氢胆固醇经验证组样本验证,具有成为胃癌代谢标志物的潜力。本研究在发现胃癌的潜在代谢标志物的同时,也为胃癌患者代谢分型提供了重要的科学依据。
- 杨太忠罗萍李艳丽华瑞尹沛源许国旺
- 关键词：液相色谱-质谱代谢组学肿瘤标志物胃癌
- MS-IAS:集成的质谱代谢组学数据分析系统
- 2012年
- 针对代谢组学研究中的数据处理问题,本研究建立了基于质谱的数据分析系统MS-IAS(Mass spec-trometry based integrated analysis system)。此系统集成了特征选择、聚类、分类等多种方法,用以处理质谱数据,具有多种统计分析方法能对所选的特征变量进行比较,以发现与所研究问题相关的潜在生物标志物。MS-IAS支持数据与多种算法结果可图形化显示,有助于对数据的解释与分析。以肝病患者的质谱代谢组数据为例,展示MS-IAS的功能,两种特征选择算法从数据集中筛选出了40个对肝病具有区分能力的特征变量,展示了MS-IAS成为代谢组学研究中的通用质谱数据分析系统的潜力。
- 林晓惠明迪张洋阮强王全才张瑞严康李红李海燕许国旺
- 关键词：代谢组学质谱聚类
